More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0509 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_02951  DNA mismatch repair protein MutS family protein  57.23 
 
 		 804 aa  897    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0619291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02381  DNA mismatch repair protein MutS family protein  60.23 
 
 		 805 aa  947    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1585  MutS 2 protein  57.36 
 
 		 804 aa  900    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2651  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  46.62 
 
 		 798 aa  669    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.530364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1826  MutS 2 protein  82.6 
 
 		 814 aa  1185    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0509  MutS2 family protein  100 
 
 		 799 aa  1587    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0204433  normal  0.523172 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0219  MutS2 family protein  43.68 
 
 		 803 aa  718    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0611  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  49.05 
 
 		 796 aa  647    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.651644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02381  DNA mismatch repair protein MutS family protein  43.49 
 
 		 803 aa  722    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03891  putative DNA mismatch repair protein MutS family protein  72.16 
 
 		 828 aa  1108    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.331058 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3820  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  44.23 
 
 		 830 aa  669    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1999  MutS2 family protein  45.39 
 
 		 825 aa  662    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4901  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  46.7 
 
 		 803 aa  667    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3771  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  44.11 
 
 		 830 aa  666    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02371  DNA mismatch repair protein MutS family protein  43.73 
 
 		 803 aa  727    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02471  DNA mismatch repair protein MutS family protein  42.35 
 
 		 803 aa  718    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.677193  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3301  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  42.29 
 
 		 857 aa  623  1e-177  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0896287  normal  0.0130312 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2750  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  44.12 
 
 		 818 aa  611  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05680  MutS2 family protein  32.48 
 
 		 791 aa  402  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  35.1 
 
 		 786 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0230  MutS2 family protein  33.25 
 
 		 789 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000337666  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2632  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.47 
 
 		 784 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176007  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0062  MutS2 family protein  35.64 
 
 		 826 aa  377  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21825  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.88 
 
 		 786 aa  378  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0381928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4662  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.88 
 
 		 786 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0676128  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4285  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.84 
 
 		 786 aa  378  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4296  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.84 
 
 		 786 aa  378  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1711  MutS2 family protein  36.2 
 
 		 801 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000187694  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3240  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.78 
 
 		 786 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4665  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.72 
 
 		 786 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000565535 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.84 
 
 		 786 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000221381  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4014  MutS2 family protein  36.1 
 
 		 828 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.301308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2125  MutS2 family protein  36.67 
 
 		 776 aa  373  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4447  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.72 
 
 		 786 aa  376  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4794  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.72 
 
 		 786 aa  376  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.167233  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0576  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.72 
 
 		 786 aa  376  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1470  MutS2 family protein  31.61 
 
 		 792 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.471316  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1014  MutS2 family protein  30.97 
 
 		 793 aa  369  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0625051  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4380  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.73 
 
 		 786 aa  369  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1356  MutS2 family protein  34.46 
 
 		 794 aa  369  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1813  MutS2 family protein  30.59 
 
 		 796 aa  365  1e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.572275 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  35.5 
 
 		 784 aa  365  2e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1847  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.81 
 
 		 786 aa  364  3e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2135  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.81 
 
 		 786 aa  362  1e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1710  MutS2 family protein  35.58 
 
 		 820 aa  359  9.999999999999999e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.261707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0538  MutS2 family protein  31.06 
 
 		 791 aa  357  2.9999999999999997e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00387352  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0727  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.84 
 
 		 782 aa  356  8.999999999999999e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1225  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.25 
 
 		 782 aa  355  2e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1203  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.25 
 
 		 782 aa  355  2e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1642  MutS2 family protein  29.47 
 
 		 787 aa  355  2.9999999999999997e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000590377  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1638  MutS2 family protein  33.96 
 
 		 782 aa  350  7e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00924497  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1108  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.3 
 
 		 782 aa  348  2e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0684525  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0153  MutS2 family protein  31.06 
 
 		 796 aa  346  8.999999999999999e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323958  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  36.72 
 
 		 789 aa  345  1e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5711  MutS2 family protein  34.24 
 
 		 824 aa  345  2e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0824  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  34.32 
 
 		 792 aa  344  4e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1717  MutS family ATPase  31.35 
 
 		 800 aa  344  5e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2680  mismatch repair ATPase  34.27 
 
 		 788 aa  342  2e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0426  mismatch repair ATPase  30.82 
 
 		 791 aa  338  2.9999999999999997e-91  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00172781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4891  MutS2 family protein  34.72 
 
 		 806 aa  337  5e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0634  MutS2 family protein  30.4 
 
 		 779 aa  334  3e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2046  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.61 
 
 		 791 aa  333  5e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1308  MutS2 family protein  31.02 
 
 		 778 aa  331  3e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0545  MutS2 family protein  33.25 
 
 		 775 aa  326  1e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.807648  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1412  MutS2 family protein  31.26 
 
 		 783 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29197e-17 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0730  MutS2 family protein  34.77 
 
 		 804 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2798  MutS2 family protein  31.38 
 
 		 783 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0458  MutS family ATPase  29.47 
 
 		 795 aa  319  1e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3655  MutS2 family protein  27.45 
 
 		 780 aa  314  2.9999999999999996e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1737  MutS family DNA structure-specific ATPase  29.27 
 
 		 783 aa  315  2.9999999999999996e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  33.58 
 
 		 761 aa  313  9e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0547  MutS2 family protein  31.63 
 
 		 792 aa  312  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  32.79 
 
 		 750 aa  313  1e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2782  MutS2 family protein  32.01 
 
 		 785 aa  310  8e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798995  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1719  MutS2 family protein  29.66 
 
 		 779 aa  307  4.0000000000000004e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1829  Smr protein/MutS2  29.4 
 
 		 804 aa  307  6e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1336  MutS2 family protein  28.31 
 
 		 781 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1809  MutS family DNA structure-specific ATPase  28.75 
 
 		 776 aa  305  2.0000000000000002e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.284001  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2974  MutS 2 protein  30.34 
 
 		 785 aa  300  5e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2199  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  31.21 
 
 		 633 aa  295  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0935  MutS2 family protein  29.06 
 
 		 785 aa  294  5e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0734  MutS2 family protein  33.1 
 
 		 780 aa  293  8e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.11062  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1689  Smr protein/MutS2  30.22 
 
 		 793 aa  293  1e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3515  putative MutS family protein  30.9 
 
 		 633 aa  290  7e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3486  putative MutS family protein  31.09 
 
 		 633 aa  290  9e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.441527  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3499  MutS family protein, putative  30.71 
 
 		 633 aa  289  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.969005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1760  DNA mismatch repair protein MutS  31.02 
 
 		 572 aa  289  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.21933  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3205  DNA mismatch repair protein  30.71 
 
 		 633 aa  288  4e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3504  putative MutS family protein  30.71 
 
 		 633 aa  287  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3259  DNA mismatch repair protein  30.71 
 
 		 633 aa  286  8e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.357626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3289  MutS family protein  30.71 
 
 		 633 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3547  MutS family protein  30.71 
 
 		 633 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  30.04 
 
 		 788 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3196  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  30.71 
 
 		 633 aa  285  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4299  MutS2 family protein  30.63 
 
 		 812 aa  285  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1732  Smr protein/MutS2  29.84 
 
 		 796 aa  283  9e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1541  MutS2 family protein  30.15 
 
 		 757 aa  282  2e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1493  MutS2 family protein  30.15 
 
 		 757 aa  282  2e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1920  MutS2 family protein  26.46 
 
 		 760 aa  278  2e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.380002  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1457  Smr protein/MutS2  31.74 
 
 		 805 aa  272  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>