More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_02381 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_02381  DNA mismatch repair protein MutS family protein  100 
 
 		 803 aa  1612    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02951  DNA mismatch repair protein MutS family protein  46.95 
 
 		 804 aa  756    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0619291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1585  MutS 2 protein  47.15 
 
 		 804 aa  754    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1826  MutS 2 protein  43.09 
 
 		 814 aa  649    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0509  MutS2 family protein  43.36 
 
 		 799 aa  697    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0204433  normal  0.523172 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02381  DNA mismatch repair protein MutS family protein  46.67 
 
 		 805 aa  763    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0219  MutS2 family protein  91.41 
 
 		 803 aa  1458    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03891  putative DNA mismatch repair protein MutS family protein  42.54 
 
 		 828 aa  716    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.331058 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02471  DNA mismatch repair protein MutS family protein  74.6 
 
 		 803 aa  1247    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.677193  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02371  DNA mismatch repair protein MutS family protein  95.27 
 
 		 803 aa  1521    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2750  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  37.16 
 
 		 818 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3820  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  36.61 
 
 		 830 aa  539  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3771  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  36.61 
 
 		 830 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2651  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  36.17 
 
 		 798 aa  533  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.530364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4901  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  37.73 
 
 		 803 aa  532  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1999  MutS2 family protein  36.59 
 
 		 825 aa  528  1e-148  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0611  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  37.25 
 
 		 796 aa  503  1e-141  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.651644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3301  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.95 
 
 		 857 aa  478  1e-133  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0896287  normal  0.0130312 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0230  MutS2 family protein  30.3 
 
 		 789 aa  343  5.999999999999999e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000337666  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1225  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.52 
 
 		 782 aa  343  7e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1203  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.52 
 
 		 782 aa  343  7e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2632  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.96 
 
 		 784 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176007  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05680  MutS2 family protein  31.47 
 
 		 791 aa  340  5e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0538  MutS2 family protein  30.04 
 
 		 791 aa  339  9.999999999999999e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00387352  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  30.04 
 
 		 784 aa  338  2.9999999999999997e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0727  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.88 
 
 		 782 aa  334  4e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  30.7 
 
 		 786 aa  332  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1813  MutS2 family protein  30.19 
 
 		 796 aa  325  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.572275 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1308  MutS2 family protein  31.03 
 
 		 778 aa  325  3e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0824  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.46 
 
 		 792 aa  320  7e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0062  MutS2 family protein  28.3 
 
 		 826 aa  319  1e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21825  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1356  MutS2 family protein  29.92 
 
 		 794 aa  319  1e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3240  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.51 
 
 		 786 aa  316  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1638  MutS2 family protein  30.81 
 
 		 782 aa  314  4.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00924497  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1847  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.88 
 
 		 786 aa  313  9e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2135  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.76 
 
 		 786 aa  312  1e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0576  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.17 
 
 		 786 aa  312  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2125  MutS2 family protein  27.3 
 
 		 776 aa  311  4e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4665  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.17 
 
 		 786 aa  310  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000565535 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1108  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.18 
 
 		 782 aa  310  6.999999999999999e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0684525  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.05 
 
 		 786 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0381928  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4296  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.05 
 
 		 786 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2680  mismatch repair ATPase  27.62 
 
 		 788 aa  310  1.0000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.92 
 
 		 786 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000221381  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4285  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.92 
 
 		 786 aa  308  3e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4662  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.92 
 
 		 786 aa  308  3e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0676128  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1717  MutS family ATPase  30.19 
 
 		 800 aa  307  4.0000000000000004e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4447  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.92 
 
 		 786 aa  306  8.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4794  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.92 
 
 		 786 aa  306  8.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.167233  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4380  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.05 
 
 		 786 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1470  MutS2 family protein  28.97 
 
 		 792 aa  305  3.0000000000000004e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.471316  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1809  MutS family DNA structure-specific ATPase  30.71 
 
 		 776 aa  305  3.0000000000000004e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.284001  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1737  MutS family DNA structure-specific ATPase  29.81 
 
 		 783 aa  304  5.000000000000001e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0935  MutS2 family protein  28.32 
 
 		 785 aa  301  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4014  MutS2 family protein  28.2 
 
 		 828 aa  302  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.301308  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1719  MutS2 family protein  29.69 
 
 		 779 aa  300  5e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1710  MutS2 family protein  27.22 
 
 		 820 aa  300  7e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.261707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5711  MutS2 family protein  27.55 
 
 		 824 aa  300  9e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1014  MutS2 family protein  29.93 
 
 		 793 aa  297  6e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0625051  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1642  MutS2 family protein  30.28 
 
 		 787 aa  296  9e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000590377  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2798  MutS2 family protein  28.43 
 
 		 783 aa  296  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4891  MutS2 family protein  28.88 
 
 		 806 aa  295  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1711  MutS2 family protein  27.71 
 
 		 801 aa  295  3e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000187694  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1412  MutS2 family protein  28.12 
 
 		 783 aa  295  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29197e-17 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0634  MutS2 family protein  30.96 
 
 		 779 aa  291  3e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2782  MutS2 family protein  28.11 
 
 		 785 aa  289  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798995  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1336  MutS2 family protein  30.17 
 
 		 781 aa  288  4e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0547  MutS2 family protein  27.63 
 
 		 792 aa  286  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1829  Smr protein/MutS2  27.47 
 
 		 804 aa  285  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2046  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.56 
 
 		 791 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0668  Smr protein/MutS2  27.67 
 
 		 794 aa  284  6.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.529959  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  28.34 
 
 		 750 aa  281  4e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2974  MutS 2 protein  27.43 
 
 		 785 aa  280  9e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0426  mismatch repair ATPase  27.76 
 
 		 791 aa  280  1e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00172781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2648  DNA-mismatch repair protein  29.67 
 
 		 797 aa  275  3e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.270427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0458  MutS family ATPase  29.43 
 
 		 795 aa  275  3e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2920  Smr protein/MutS2  27.32 
 
 		 792 aa  273  7e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000870196 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0153  MutS2 family protein  28.95 
 
 		 796 aa  272  2e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323958  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  28.34 
 
 		 761 aa  271  2.9999999999999997e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3655  MutS2 family protein  28.4 
 
 		 780 aa  270  7e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1493  MutS2 family protein  30.19 
 
 		 757 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2225  Smr protein/MutS2  27.55 
 
 		 793 aa  268  4e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1541  MutS2 family protein  30.05 
 
 		 757 aa  267  5.999999999999999e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  28.62 
 
 		 789 aa  266  8.999999999999999e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0545  MutS2 family protein  28.52 
 
 		 775 aa  266  1e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.807648  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1689  Smr protein/MutS2  26.41 
 
 		 793 aa  265  3e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1732  Smr protein/MutS2  26.75 
 
 		 796 aa  264  4.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0730  MutS2 family protein  26.33 
 
 		 804 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0299  MutS2 family protein  31.99 
 
 		 803 aa  261  3e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2199  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  31.68 
 
 		 633 aa  260  6e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  26.62 
 
 		 788 aa  257  5e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3515  putative MutS family protein  31.98 
 
 		 633 aa  253  7e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0699  DNA mismatch repair protein MutS-like  27.55 
 
 		 793 aa  253  8.000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3205  DNA mismatch repair protein  31.98 
 
 		 633 aa  252  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148048  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1920  MutS2 family protein  31.62 
 
 		 760 aa  252  2e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.380002  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3259  DNA mismatch repair protein  31.98 
 
 		 633 aa  250  6e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.357626  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4299  MutS2 family protein  25.74 
 
 		 812 aa  250  8e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3289  MutS family protein  31.98 
 
 		 633 aa  249  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3547  MutS family protein  31.98 
 
 		 633 aa  249  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3499  MutS family protein, putative  31.78 
 
 		 633 aa  249  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.969005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>