More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1689 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2225  Smr protein/MutS2  61.84 
 
 
793 aa  995    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1829  Smr protein/MutS2  63.76 
 
 
804 aa  1044    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1732  Smr protein/MutS2  58.74 
 
 
796 aa  931    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0447  DNA mismatch repair protein MutS-like  52.4 
 
 
789 aa  750    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0699  DNA mismatch repair protein MutS-like  58.39 
 
 
793 aa  874    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1689  Smr protein/MutS2  100 
 
 
793 aa  1608    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123598  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0668  Smr protein/MutS2  61.46 
 
 
794 aa  994    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.529959  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2920  Smr protein/MutS2  32.19 
 
 
792 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000870196 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0730  MutS2 family protein  34.81 
 
 
804 aa  419  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1014  MutS2 family protein  32.88 
 
 
793 aa  416  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0625051  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1470  MutS2 family protein  31.87 
 
 
792 aa  404  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.471316  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1108  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.51 
 
 
782 aa  398  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0684525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05680  MutS2 family protein  31.5 
 
 
791 aa  393  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2648  DNA-mismatch repair protein  33.79 
 
 
797 aa  395  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.270427  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2632  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.96 
 
 
784 aa  395  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0268  Smr protein/MutS2  32.88 
 
 
805 aa  393  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0912246 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0547  MutS2 family protein  34.4 
 
 
792 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  33.08 
 
 
784 aa  390  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5060  MutS2 family protein  31.89 
 
 
802 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3240  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.5 
 
 
786 aa  389  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2974  MutS 2 protein  33.42 
 
 
785 aa  389  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4285  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.59 
 
 
786 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4296  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.59 
 
 
786 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4665  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.59 
 
 
786 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000565535 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4380  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.38 
 
 
786 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0576  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.63 
 
 
786 aa  382  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613341  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0230  MutS2 family protein  31.84 
 
 
789 aa  382  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000337666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.05 
 
 
786 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0381928  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4447  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.59 
 
 
786 aa  379  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4794  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.59 
 
 
786 aa  379  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.167233  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1638  MutS2 family protein  33.21 
 
 
782 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00924497  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0299  MutS2 family protein  32.63 
 
 
803 aa  377  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.5 
 
 
786 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000221381  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  32.42 
 
 
786 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4662  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.47 
 
 
786 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0676128  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0538  MutS2 family protein  31.51 
 
 
791 aa  379  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00387352  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0153  MutS2 family protein  30.54 
 
 
796 aa  375  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323958  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1711  MutS2 family protein  32.22 
 
 
801 aa  372  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000187694  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0824  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.45 
 
 
792 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0727  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.29 
 
 
782 aa  365  2e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2680  mismatch repair ATPase  33.5 
 
 
788 aa  364  3e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1225  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.35 
 
 
782 aa  363  5.0000000000000005e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1203  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.35 
 
 
782 aa  363  5.0000000000000005e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1642  MutS2 family protein  29.35 
 
 
787 aa  362  1e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000590377  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1737  MutS family DNA structure-specific ATPase  32.21 
 
 
783 aa  362  1e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0384  MutS2 family protein  31.12 
 
 
840 aa  362  2e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1813  MutS2 family protein  29.84 
 
 
796 aa  361  3e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.572275 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1356  MutS2 family protein  33.33 
 
 
794 aa  360  4e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1336  MutS2 family protein  29.69 
 
 
781 aa  359  9.999999999999999e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2046  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.09 
 
 
791 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0545  MutS2 family protein  31.61 
 
 
775 aa  358  2.9999999999999997e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.807648  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1493  MutS2 family protein  33.12 
 
 
757 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2782  MutS2 family protein  31 
 
 
785 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798995  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1541  MutS2 family protein  33.12 
 
 
757 aa  354  4e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2135  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.5 
 
 
786 aa  350  5e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1847  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.37 
 
 
786 aa  350  6e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0634  MutS2 family protein  28.72 
 
 
779 aa  348  2e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1412  MutS2 family protein  31.46 
 
 
783 aa  347  5e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29197e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2798  MutS2 family protein  31.46 
 
 
783 aa  346  1e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1568  MutS2 family protein  27.67 
 
 
763 aa  345  2e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3655  MutS2 family protein  29.3 
 
 
780 aa  345  2e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0426  mismatch repair ATPase  29.42 
 
 
791 aa  345  2e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00172781  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0062  MutS2 family protein  32.34 
 
 
826 aa  344  4e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21825  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0935  MutS2 family protein  31.2 
 
 
785 aa  342  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2125  MutS2 family protein  33.12 
 
 
776 aa  341  4e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0458  MutS family ATPase  28.84 
 
 
795 aa  340  4e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0098  MutS2 protein  28.22 
 
 
780 aa  337  3.9999999999999995e-91  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1920  MutS2 family protein  32.84 
 
 
760 aa  337  5e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.380002  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  31.37 
 
 
788 aa  337  7e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4891  MutS2 family protein  32.32 
 
 
806 aa  335  1e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1717  MutS family ATPase  29.04 
 
 
800 aa  328  2.0000000000000001e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4014  MutS2 family protein  31.11 
 
 
828 aa  325  1e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.301308  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  32.96 
 
 
789 aa  325  3e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1809  MutS family DNA structure-specific ATPase  28.96 
 
 
776 aa  325  3e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.284001  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1719  MutS2 family protein  29.24 
 
 
779 aa  322  9.999999999999999e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1710  MutS2 family protein  31.25 
 
 
820 aa  320  7e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.261707  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2780  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.25 
 
 
705 aa  320  9e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383732 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1308  MutS2 family protein  28.75 
 
 
778 aa  309  1.0000000000000001e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4299  MutS2 family protein  30.95 
 
 
812 aa  308  3e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0734  MutS2 family protein  29.94 
 
 
780 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.11062  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  30.12 
 
 
750 aa  303  1e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1450  MutS2 family protein  27.86 
 
 
818 aa  298  3e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1897  MutS2 family protein  30.02 
 
 
767 aa  297  6e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.557227  normal  0.0324553 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3820  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.23 
 
 
830 aa  293  6e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2651  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.66 
 
 
798 aa  293  7e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.530364  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3771  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.23 
 
 
830 aa  293  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2459  Smr protein/MutS2  28.94 
 
 
765 aa  291  3e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215696  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0999  Smr protein/MutS2  27.28 
 
 
769 aa  290  6e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0611  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.92 
 
 
796 aa  289  2e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.651644  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02381  DNA mismatch repair protein MutS family protein  30.56 
 
 
805 aa  287  5e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0509  MutS2 family protein  30.34 
 
 
799 aa  285  3.0000000000000004e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0204433  normal  0.523172 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1152  MutS2 family protein  27.39 
 
 
757 aa  283  1e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  31.07 
 
 
761 aa  282  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2913  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  27.08 
 
 
721 aa  281  4e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00104872  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03891  putative DNA mismatch repair protein MutS family protein  30.67 
 
 
828 aa  280  6e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.331058 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3301  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  27.57 
 
 
857 aa  280  9e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0896287  normal  0.0130312 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2054  DNA mismatch repair protein MutS-like  27.73 
 
 
771 aa  276  9e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2031  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.14 
 
 
723 aa  276  1.0000000000000001e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1457  Smr protein/MutS2  29.92 
 
 
805 aa  274  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0219  MutS2 family protein  27.47 
 
 
803 aa  274  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>