More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2225 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0447  DNA mismatch repair protein MutS-like  57.43 
 
 		 789 aa  837    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0699  DNA mismatch repair protein MutS-like  65.66 
 
 		 793 aa  983    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1689  Smr protein/MutS2  62.22 
 
 		 793 aa  1009    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2225  Smr protein/MutS2  100 
 
 		 793 aa  1605    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1732  Smr protein/MutS2  64.38 
 
 		 796 aa  1039    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1829  Smr protein/MutS2  61.84 
 
 		 804 aa  999    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0668  Smr protein/MutS2  89.28 
 
 		 794 aa  1434    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.529959  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2648  DNA-mismatch repair protein  34.79 
 
 		 797 aa  430  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.270427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0730  MutS2 family protein  34.36 
 
 		 804 aa  426  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1014  MutS2 family protein  33.74 
 
 		 793 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0625051  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0384  MutS2 family protein  33.8 
 
 		 840 aa  400  9.999999999999999e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05680  MutS2 family protein  31.61 
 
 		 791 aa  394  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.48 
 
 		 786 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000221381  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0268  Smr protein/MutS2  32.21 
 
 		 805 aa  395  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0912246 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5060  MutS2 family protein  34.28 
 
 		 802 aa  393  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.36 
 
 		 786 aa  391  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0381928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4662  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.36 
 
 		 786 aa  391  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0676128  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4447  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.36 
 
 		 786 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4285  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.36 
 
 		 786 aa  392  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4296  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.36 
 
 		 786 aa  392  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2632  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.76 
 
 		 784 aa  391  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176007  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4794  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.36 
 
 		 786 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.167233  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4665  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.23 
 
 		 786 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000565535 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0538  MutS2 family protein  30.86 
 
 		 791 aa  389  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00387352  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1108  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  34.94 
 
 		 782 aa  392  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0684525  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4380  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.43 
 
 		 786 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0576  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.6 
 
 		 786 aa  391  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2920  Smr protein/MutS2  30.35 
 
 		 792 aa  392  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000870196 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3240  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.1 
 
 		 786 aa  389  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  33.09 
 
 		 786 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2046  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.34 
 
 		 791 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1638  MutS2 family protein  32.67 
 
 		 782 aa  379  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00924497  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2974  MutS 2 protein  33.29 
 
 		 785 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2782  MutS2 family protein  32.17 
 
 		 785 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798995  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1470  MutS2 family protein  31.87 
 
 		 792 aa  373  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.471316  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1642  MutS2 family protein  31.85 
 
 		 787 aa  376  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000590377  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  33.62 
 
 		 784 aa  371  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0824  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.38 
 
 		 792 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0458  MutS family ATPase  29.78 
 
 		 795 aa  363  1e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0547  MutS2 family protein  32.55 
 
 		 792 aa  361  4e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1737  MutS family DNA structure-specific ATPase  32.56 
 
 		 783 aa  357  5e-97  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2798  MutS2 family protein  31.7 
 
 		 783 aa  357  5.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0153  MutS2 family protein  31 
 
 		 796 aa  355  1e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323958  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2680  mismatch repair ATPase  32.02 
 
 		 788 aa  355  2e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1717  MutS family ATPase  29.74 
 
 		 800 aa  354  2.9999999999999997e-96  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1203  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.27 
 
 		 782 aa  353  7e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1225  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.27 
 
 		 782 aa  353  7e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0299  MutS2 family protein  30.43 
 
 		 803 aa  353  7e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0727  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.46 
 
 		 782 aa  353  8e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1412  MutS2 family protein  31.22 
 
 		 783 aa  352  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29197e-17 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1356  MutS2 family protein  33.5 
 
 		 794 aa  350  4e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0426  mismatch repair ATPase  29.32 
 
 		 791 aa  350  8e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00172781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  33.21 
 
 		 788 aa  350  8e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1711  MutS2 family protein  31.81 
 
 		 801 aa  349  1e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000187694  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1813  MutS2 family protein  29.89 
 
 		 796 aa  349  1e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.572275 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1568  MutS2 family protein  29.95 
 
 		 763 aa  348  2e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0230  MutS2 family protein  29.66 
 
 		 789 aa  347  7e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000337666  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0062  MutS2 family protein  30.8 
 
 		 826 aa  342  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21825  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1809  MutS family DNA structure-specific ATPase  30.58 
 
 		 776 aa  340  5e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.284001  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2135  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.85 
 
 		 786 aa  337  5e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1847  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.85 
 
 		 786 aa  337  5e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0634  MutS2 family protein  28.35 
 
 		 779 aa  337  7e-91  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4891  MutS2 family protein  30.1 
 
 		 806 aa  336  7.999999999999999e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0545  MutS2 family protein  32.46 
 
 		 775 aa  335  2e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.807648  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4014  MutS2 family protein  30.99 
 
 		 828 aa  334  5e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.301308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0935  MutS2 family protein  30.5 
 
 		 785 aa  333  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3655  MutS2 family protein  27.65 
 
 		 780 aa  331  3e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1541  MutS2 family protein  32.33 
 
 		 757 aa  330  7e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1493  MutS2 family protein  32.33 
 
 		 757 aa  330  7e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2125  MutS2 family protein  31.06 
 
 		 776 aa  328  2.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1710  MutS2 family protein  29.72 
 
 		 820 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.261707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1336  MutS2 family protein  28.8 
 
 		 781 aa  326  1e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1920  MutS2 family protein  30.17 
 
 		 760 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.380002  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1450  MutS2 family protein  29.23 
 
 		 818 aa  320  7.999999999999999e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2780  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.96 
 
 		 705 aa  318  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383732 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1719  MutS2 family protein  30.79 
 
 		 779 aa  315  2.9999999999999996e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  30.13 
 
 		 750 aa  297  5e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1308  MutS2 family protein  30.84 
 
 		 778 aa  295  3e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1152  MutS2 family protein  28.18 
 
 		 757 aa  294  5e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0098  MutS2 protein  27.7 
 
 		 780 aa  294  5e-78  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4299  MutS2 family protein  30 
 
 		 812 aa  293  9e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2459  Smr protein/MutS2  28.78 
 
 		 765 aa  293  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215696  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1368  Smr protein/MutS2  28.5 
 
 		 771 aa  288  2e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2651  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.2 
 
 		 798 aa  288  4e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.530364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5711  MutS2 family protein  29.62 
 
 		 824 aa  287  4e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2913  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  29.06 
 
 		 721 aa  287  5e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00104872  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2054  DNA mismatch repair protein MutS-like  28.77 
 
 		 771 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4901  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.28 
 
 		 803 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10978  MutS2 family protein  28.73 
 
 		 722 aa  282  1e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  31.02 
 
 		 789 aa  280  6e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1897  MutS2 family protein  29.69 
 
 		 767 aa  279  1e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.557227  normal  0.0324553 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0734  MutS2 family protein  31.25 
 
 		 780 aa  278  2e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.11062  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1999  MutS2 family protein  28.01 
 
 		 825 aa  278  2e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02371  DNA mismatch repair protein MutS family protein  27.42 
 
 		 803 aa  276  8e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  29.57 
 
 		 761 aa  276  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2031  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.16 
 
 		 723 aa  275  2.0000000000000002e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0611  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.87 
 
 		 796 aa  275  2.0000000000000002e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.651644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02381  DNA mismatch repair protein MutS family protein  27.74 
 
 		 803 aa  275  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02471  DNA mismatch repair protein MutS family protein  27.75 
 
 		 803 aa  274  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.677193  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02381  DNA mismatch repair protein MutS family protein  29.5 
 
 		 805 aa  271  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>