More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2780 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2780  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  100 
 
 		 705 aa  1442    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383732 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2920  Smr protein/MutS2  34.59 
 
 		 792 aa  430  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000870196 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0268  Smr protein/MutS2  35.96 
 
 		 805 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0912246 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5060  MutS2 family protein  35.72 
 
 		 802 aa  425  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2031  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  36.46 
 
 		 723 aa  422  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2648  DNA-mismatch repair protein  35.01 
 
 		 797 aa  415  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.270427  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10978  MutS2 family protein  34.99 
 
 		 722 aa  409  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2913  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  37.93 
 
 		 721 aa  408  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00104872  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0730  MutS2 family protein  33.62 
 
 		 804 aa  391  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0384  MutS2 family protein  32.53 
 
 		 840 aa  381  1e-104  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2632  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.91 
 
 		 784 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176007  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1732  Smr protein/MutS2  30.07 
 
 		 796 aa  326  9e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1829  Smr protein/MutS2  28.91 
 
 		 804 aa  323  8e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1638  MutS2 family protein  31.46 
 
 		 782 aa  320  5e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00924497  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1356  MutS2 family protein  31.36 
 
 		 794 aa  317  5e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0727  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.4 
 
 		 782 aa  314  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1689  Smr protein/MutS2  30.82 
 
 		 793 aa  313  4.999999999999999e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1108  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.09 
 
 		 782 aa  313  5.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0684525  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  30.97 
 
 		 786 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0699  DNA mismatch repair protein MutS-like  30.89 
 
 		 793 aa  306  7e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1470  MutS2 family protein  29.42 
 
 		 792 aa  304  3.0000000000000004e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.471316  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0230  MutS2 family protein  29.45 
 
 		 789 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000337666  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1203  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.31 
 
 		 782 aa  302  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1225  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.31 
 
 		 782 aa  302  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1813  MutS2 family protein  29.31 
 
 		 796 aa  301  3e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.572275 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0538  MutS2 family protein  28.83 
 
 		 791 aa  301  4e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00387352  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05680  MutS2 family protein  28.39 
 
 		 791 aa  300  8e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  30.64 
 
 		 784 aa  299  9e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2225  Smr protein/MutS2  30.96 
 
 		 793 aa  298  2e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3240  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.44 
 
 		 786 aa  296  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1014  MutS2 family protein  29.56 
 
 		 793 aa  293  6e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0625051  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0634  MutS2 family protein  30.82 
 
 		 779 aa  291  4e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.94 
 
 		 786 aa  290  6e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0381928  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1717  MutS family ATPase  29.5 
 
 		 800 aa  288  2e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0668  Smr protein/MutS2  28.76 
 
 		 794 aa  288  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.529959  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4285  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.1 
 
 		 786 aa  287  5e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4665  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.1 
 
 		 786 aa  287  5e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000565535 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.09 
 
 		 786 aa  287  5e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000221381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4296  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.1 
 
 		 786 aa  286  7e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4662  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.96 
 
 		 786 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0676128  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0576  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.1 
 
 		 786 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613341  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4447  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.96 
 
 		 786 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4794  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.96 
 
 		 786 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.167233  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4380  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.23 
 
 		 786 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0824  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.91 
 
 		 792 aa  282  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2046  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.16 
 
 		 791 aa  282  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0447  DNA mismatch repair protein MutS-like  29.28 
 
 		 789 aa  282  2e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1493  MutS2 family protein  29.46 
 
 		 757 aa  280  8e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1541  MutS2 family protein  29.46 
 
 		 757 aa  280  9e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1711  MutS2 family protein  28.26 
 
 		 801 aa  278  4e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000187694  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1642  MutS2 family protein  28.74 
 
 		 787 aa  276  8e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000590377  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1847  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.73 
 
 		 786 aa  273  7e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2135  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.73 
 
 		 786 aa  273  8.000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2680  mismatch repair ATPase  31.25 
 
 		 788 aa  269  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1308  MutS2 family protein  30.13 
 
 		 778 aa  269  1e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1568  MutS2 family protein  29.2 
 
 		 763 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4891  MutS2 family protein  29.74 
 
 		 806 aa  267  4e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1809  MutS family DNA structure-specific ATPase  28.51 
 
 		 776 aa  267  4e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.284001  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3655  MutS2 family protein  30.18 
 
 		 780 aa  267  5e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1336  MutS2 family protein  28.78 
 
 		 781 aa  266  8e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0299  MutS2 family protein  27.67 
 
 		 803 aa  265  3e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1920  MutS2 family protein  32.41 
 
 		 760 aa  262  2e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.380002  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0153  MutS2 family protein  30.63 
 
 		 796 aa  261  3e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323958  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0547  MutS2 family protein  28.19 
 
 		 792 aa  261  4e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2782  MutS2 family protein  26 
 
 		 785 aa  260  6e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798995  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4299  MutS2 family protein  29.67 
 
 		 812 aa  260  7e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  29.67 
 
 		 789 aa  259  1e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0458  MutS family ATPase  30.63 
 
 		 795 aa  258  2e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  31.13 
 
 		 750 aa  258  3e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1710  MutS2 family protein  26.6 
 
 		 820 aa  258  3e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.261707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0545  MutS2 family protein  28.35 
 
 		 775 aa  257  4e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.807648  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3205  DNA mismatch repair protein  29.33 
 
 		 633 aa  257  5e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148048  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3515  putative MutS family protein  29.14 
 
 		 633 aa  257  5e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3289  MutS family protein  29.33 
 
 		 633 aa  256  9e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3547  MutS family protein  29.33 
 
 		 633 aa  256  9e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5711  MutS2 family protein  27.38 
 
 		 824 aa  255  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3259  DNA mismatch repair protein  29.33 
 
 		 633 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.357626  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0062  MutS2 family protein  28.3 
 
 		 826 aa  253  6e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21825  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3486  putative MutS family protein  28.95 
 
 		 633 aa  253  7e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.441527  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3504  putative MutS family protein  29.14 
 
 		 633 aa  253  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  31.43 
 
 		 761 aa  252  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3499  MutS family protein, putative  28.95 
 
 		 633 aa  252  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.969005  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2974  MutS 2 protein  27.49 
 
 		 785 aa  251  4e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3196  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  28.76 
 
 		 633 aa  250  5e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1719  MutS2 family protein  26.14 
 
 		 779 aa  249  1e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2199  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  28.85 
 
 		 633 aa  249  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1760  DNA mismatch repair protein MutS  29.17 
 
 		 572 aa  249  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.21933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1737  MutS family DNA structure-specific ATPase  29.36 
 
 		 783 aa  248  4e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4014  MutS2 family protein  27.16 
 
 		 828 aa  246  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.301308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0611  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.29 
 
 		 796 aa  246  9.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.651644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0426  mismatch repair ATPase  27.93 
 
 		 791 aa  245  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00172781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0219  MutS2 family protein  27.1 
 
 		 803 aa  244  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  28.34 
 
 		 788 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1450  MutS2 family protein  26.11 
 
 		 818 aa  244  5e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0784  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.19 
 
 		 529 aa  242  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02371  DNA mismatch repair protein MutS family protein  27.01 
 
 		 803 aa  242  1e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2159  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.83 
 
 		 522 aa  240  8e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2125  MutS2 family protein  28.25 
 
 		 776 aa  239  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1412  MutS2 family protein  30.11 
 
 		 783 aa  239  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29197e-17 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1897  MutS2 family protein  28.37 
 
 		 767 aa  238  4e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.557227  normal  0.0324553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>