More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0268 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0268  Smr protein/MutS2  100 
 
 		 805 aa  1635    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0912246 
 
 
-
 
NC_002950  PG0384  MutS2 family protein  43.21 
 
 		 840 aa  655    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2920  Smr protein/MutS2  45.06 
 
 		 792 aa  707    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000870196 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5060  MutS2 family protein  69.57 
 
 		 802 aa  1127    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2648  DNA-mismatch repair protein  45.13 
 
 		 797 aa  697    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.270427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0730  MutS2 family protein  39.78 
 
 		 804 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1638  MutS2 family protein  34.11 
 
 		 782 aa  443  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00924497  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2780  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  35.96 
 
 		 705 aa  446  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383732 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1829  Smr protein/MutS2  32.88 
 
 		 804 aa  428  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1470  MutS2 family protein  34.53 
 
 		 792 aa  427  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.471316  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2046  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.12 
 
 		 791 aa  424  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  34.39 
 
 		 786 aa  422  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2632  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.38 
 
 		 784 aa  422  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176007  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  32.63 
 
 		 784 aa  415  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0230  MutS2 family protein  32.88 
 
 		 789 aa  410  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000337666  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1689  Smr protein/MutS2  32.88 
 
 		 793 aa  402  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1014  MutS2 family protein  32.59 
 
 		 793 aa  403  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0625051  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0668  Smr protein/MutS2  31.87 
 
 		 794 aa  402  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.529959  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0699  DNA mismatch repair protein MutS-like  33.74 
 
 		 793 aa  397  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1813  MutS2 family protein  31.5 
 
 		 796 aa  397  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.572275 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1732  Smr protein/MutS2  32.88 
 
 		 796 aa  393  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1356  MutS2 family protein  34.08 
 
 		 794 aa  393  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2225  Smr protein/MutS2  32.21 
 
 		 793 aa  394  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05680  MutS2 family protein  30.43 
 
 		 791 aa  394  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0545  MutS2 family protein  33.42 
 
 		 775 aa  395  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.807648  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1108  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.76 
 
 		 782 aa  395  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0684525  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1711  MutS2 family protein  32.15 
 
 		 801 aa  390  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000187694  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0824  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.38 
 
 		 792 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2974  MutS 2 protein  33.37 
 
 		 785 aa  386  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0538  MutS2 family protein  32.31 
 
 		 791 aa  385  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00387352  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0062  MutS2 family protein  32.4 
 
 		 826 aa  385  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21825  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2913  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  34.31 
 
 		 721 aa  380  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00104872  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1336  MutS2 family protein  33.21 
 
 		 781 aa  380  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4285  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.31 
 
 		 786 aa  377  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4296  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.31 
 
 		 786 aa  377  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4665  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.31 
 
 		 786 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000565535 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2031  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.57 
 
 		 723 aa  378  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10978  MutS2 family protein  33.29 
 
 		 722 aa  378  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1642  MutS2 family protein  30.3 
 
 		 787 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000590377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0576  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.99 
 
 		 786 aa  375  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613341  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.19 
 
 		 786 aa  375  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0381928  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4447  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.19 
 
 		 786 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2680  mismatch repair ATPase  32.73 
 
 		 788 aa  375  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4794  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.19 
 
 		 786 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.167233  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.19 
 
 		 786 aa  375  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000221381  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4014  MutS2 family protein  31.84 
 
 		 828 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.301308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4662  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.19 
 
 		 786 aa  375  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0676128  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4380  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.75 
 
 		 786 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0547  MutS2 family protein  32.2 
 
 		 792 aa  372  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0727  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.4 
 
 		 782 aa  371  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1225  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.06 
 
 		 782 aa  370  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1203  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.06 
 
 		 782 aa  370  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0153  MutS2 family protein  34.21 
 
 		 796 aa  371  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323958  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3240  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.9 
 
 		 786 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0458  MutS family ATPase  31.55 
 
 		 795 aa  366  1e-100  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2798  MutS2 family protein  31.58 
 
 		 783 aa  366  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1847  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.33 
 
 		 786 aa  365  1e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1412  MutS2 family protein  31.82 
 
 		 783 aa  365  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29197e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0935  MutS2 family protein  32.1 
 
 		 785 aa  365  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2135  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.46 
 
 		 786 aa  365  2e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0634  MutS2 family protein  32.59 
 
 		 779 aa  362  1e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1717  MutS family ATPase  29.96 
 
 		 800 aa  361  3e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  31.8 
 
 		 750 aa  360  9e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2782  MutS2 family protein  30.83 
 
 		 785 aa  359  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798995  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  32.92 
 
 		 789 aa  357  5e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0447  DNA mismatch repair protein MutS-like  32.83 
 
 		 789 aa  355  2e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0426  mismatch repair ATPase  30.45 
 
 		 791 aa  354  4e-96  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00172781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1710  MutS2 family protein  30.58 
 
 		 820 aa  351  3e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.261707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1568  MutS2 family protein  30.55 
 
 		 763 aa  342  1e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4299  MutS2 family protein  32.15 
 
 		 812 aa  342  2e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4891  MutS2 family protein  30.96 
 
 		 806 aa  339  1.9999999999999998e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3655  MutS2 family protein  29.99 
 
 		 780 aa  337  5.999999999999999e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  31.18 
 
 		 761 aa  333  6e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  31.42 
 
 		 788 aa  332  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1308  MutS2 family protein  32.99 
 
 		 778 aa  330  4e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1809  MutS family DNA structure-specific ATPase  28.97 
 
 		 776 aa  329  2.0000000000000001e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.284001  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1493  MutS2 family protein  31.33 
 
 		 757 aa  327  5e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1541  MutS2 family protein  31.33 
 
 		 757 aa  327  6e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0299  MutS2 family protein  29.86 
 
 		 803 aa  326  1e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5711  MutS2 family protein  29.19 
 
 		 824 aa  324  3e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2125  MutS2 family protein  31.71 
 
 		 776 aa  321  3e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1457  Smr protein/MutS2  31.01 
 
 		 805 aa  312  2e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1737  MutS family DNA structure-specific ATPase  28.64 
 
 		 783 aa  311  2e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1152  MutS2 family protein  27.77 
 
 		 757 aa  306  9.000000000000001e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3771  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.17 
 
 		 830 aa  306  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1719  MutS2 family protein  28.66 
 
 		 779 aa  304  4.0000000000000003e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3820  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.06 
 
 		 830 aa  303  7.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1897  MutS2 family protein  31.17 
 
 		 767 aa  302  2e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.557227  normal  0.0324553 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1920  MutS2 family protein  31.38 
 
 		 760 aa  300  6e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.380002  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3205  DNA mismatch repair protein  34.66 
 
 		 633 aa  298  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3196  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  34.28 
 
 		 633 aa  298  4e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3259  DNA mismatch repair protein  34.47 
 
 		 633 aa  296  7e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.357626  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3499  MutS family protein, putative  34.47 
 
 		 633 aa  296  9e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.969005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3289  MutS family protein  34.47 
 
 		 633 aa  296  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3547  MutS family protein  34.47 
 
 		 633 aa  296  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3486  putative MutS family protein  34.47 
 
 		 633 aa  296  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.441527  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3515  putative MutS family protein  34.28 
 
 		 633 aa  295  3e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3504  putative MutS family protein  34.09 
 
 		 633 aa  293  6e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0734  MutS2 family protein  29.29 
 
 		 780 aa  293  1e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.11062  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1760  DNA mismatch repair protein MutS  34.47 
 
 		 572 aa  292  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.21933  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>