More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5060 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0384  MutS2 family protein  42.69 
 
 		 840 aa  641    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5060  MutS2 family protein  100 
 
 		 802 aa  1633    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2920  Smr protein/MutS2  43.55 
 
 		 792 aa  664    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000870196 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2648  DNA-mismatch repair protein  43.98 
 
 		 797 aa  686    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.270427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0268  Smr protein/MutS2  69.57 
 
 		 805 aa  1127    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0912246 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0730  MutS2 family protein  39.08 
 
 		 804 aa  527  1e-148  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2780  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  35.72 
 
 		 705 aa  438  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383732 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2632  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  34.34 
 
 		 784 aa  435  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176007  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1638  MutS2 family protein  33.92 
 
 		 782 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00924497  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1829  Smr protein/MutS2  33.33 
 
 		 804 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1470  MutS2 family protein  34.16 
 
 		 792 aa  409  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.471316  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1732  Smr protein/MutS2  33.29 
 
 		 796 aa  404  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0668  Smr protein/MutS2  33.54 
 
 		 794 aa  405  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.529959  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1689  Smr protein/MutS2  31.89 
 
 		 793 aa  397  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  32.42 
 
 		 784 aa  398  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0538  MutS2 family protein  32.39 
 
 		 791 aa  392  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00387352  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05680  MutS2 family protein  31.76 
 
 		 791 aa  391  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1203  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.34 
 
 		 782 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1225  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.34 
 
 		 782 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0230  MutS2 family protein  33.13 
 
 		 789 aa  392  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000337666  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0824  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.46 
 
 		 792 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  32.48 
 
 		 786 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2046  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.96 
 
 		 791 aa  392  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2680  mismatch repair ATPase  33.89 
 
 		 788 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2225  Smr protein/MutS2  34.28 
 
 		 793 aa  387  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1813  MutS2 family protein  31.55 
 
 		 796 aa  386  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.572275 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1014  MutS2 family protein  32.96 
 
 		 793 aa  384  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0625051  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1108  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.88 
 
 		 782 aa  384  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0684525  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0699  DNA mismatch repair protein MutS-like  33.29 
 
 		 793 aa  380  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0153  MutS2 family protein  34.9 
 
 		 796 aa  380  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323958  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1356  MutS2 family protein  32.46 
 
 		 794 aa  379  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1642  MutS2 family protein  31.92 
 
 		 787 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000590377  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0545  MutS2 family protein  32.03 
 
 		 775 aa  379  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.807648  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0727  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.54 
 
 		 782 aa  375  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1336  MutS2 family protein  32.71 
 
 		 781 aa  374  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.78 
 
 		 786 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0381928  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.66 
 
 		 786 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000221381  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4285  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.9 
 
 		 786 aa  372  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4296  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.78 
 
 		 786 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4665  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.41 
 
 		 786 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000565535 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3240  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.1 
 
 		 786 aa  372  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4662  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.78 
 
 		 786 aa  372  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0676128  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0576  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.66 
 
 		 786 aa  372  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2031  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  39.21 
 
 		 723 aa  368  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4447  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.66 
 
 		 786 aa  369  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4380  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.6 
 
 		 786 aa  369  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4014  MutS2 family protein  31.65 
 
 		 828 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.301308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4794  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.66 
 
 		 786 aa  369  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.167233  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1711  MutS2 family protein  31.32 
 
 		 801 aa  369  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000187694  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0426  mismatch repair ATPase  31.06 
 
 		 791 aa  365  2e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00172781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2135  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.37 
 
 		 786 aa  364  3e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0447  DNA mismatch repair protein MutS-like  33.58 
 
 		 789 aa  364  4e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1847  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.25 
 
 		 786 aa  364  4e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1717  MutS family ATPase  30 
 
 		 800 aa  360  5e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10978  MutS2 family protein  32 
 
 		 722 aa  360  7e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1412  MutS2 family protein  33.52 
 
 		 783 aa  360  8e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29197e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2798  MutS2 family protein  32.37 
 
 		 783 aa  359  9e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2913  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33.89 
 
 		 721 aa  357  5.999999999999999e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00104872  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0458  MutS family ATPase  30.73 
 
 		 795 aa  355  1e-96  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0062  MutS2 family protein  31.79 
 
 		 826 aa  355  1e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21825  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2974  MutS 2 protein  32.84 
 
 		 785 aa  353  8e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0547  MutS2 family protein  32.45 
 
 		 792 aa  352  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  34.45 
 
 		 789 aa  350  6e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0634  MutS2 family protein  29.62 
 
 		 779 aa  346  1e-93  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  34.44 
 
 		 761 aa  340  5.9999999999999996e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0935  MutS2 family protein  30.63 
 
 		 785 aa  340  7e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5711  MutS2 family protein  30.97 
 
 		 824 aa  340  9e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  34.97 
 
 		 788 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2782  MutS2 family protein  33.68 
 
 		 785 aa  337  5e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798995  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1710  MutS2 family protein  30.23 
 
 		 820 aa  336  9e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.261707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  30.21 
 
 		 750 aa  335  2e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3655  MutS2 family protein  29.45 
 
 		 780 aa  334  5e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1809  MutS family DNA structure-specific ATPase  30.76 
 
 		 776 aa  334  5e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.284001  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4891  MutS2 family protein  30.36 
 
 		 806 aa  332  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4299  MutS2 family protein  30.86 
 
 		 812 aa  331  4e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1308  MutS2 family protein  32.33 
 
 		 778 aa  330  7e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1457  Smr protein/MutS2  31.2 
 
 		 805 aa  321  3e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3771  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.3 
 
 		 830 aa  320  7.999999999999999e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3820  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.3 
 
 		 830 aa  319  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1541  MutS2 family protein  33.19 
 
 		 757 aa  317  5e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1493  MutS2 family protein  33.19 
 
 		 757 aa  317  7e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1568  MutS2 family protein  30.54 
 
 		 763 aa  316  9e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0299  MutS2 family protein  29.52 
 
 		 803 aa  315  1.9999999999999998e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1737  MutS family DNA structure-specific ATPase  29.96 
 
 		 783 aa  311  4e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2125  MutS2 family protein  30.24 
 
 		 776 aa  308  4.0000000000000004e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0098  MutS2 protein  33.17 
 
 		 780 aa  304  5.000000000000001e-81  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4901  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.26 
 
 		 803 aa  303  9e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0734  MutS2 family protein  31.41 
 
 		 780 aa  302  1e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.11062  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2651  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.1 
 
 		 798 aa  301  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.530364  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1719  MutS2 family protein  31.65 
 
 		 779 aa  300  9e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1152  MutS2 family protein  29.86 
 
 		 757 aa  296  1e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3486  putative MutS family protein  33.14 
 
 		 633 aa  294  5e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.441527  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3205  DNA mismatch repair protein  33.08 
 
 		 633 aa  294  6e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148048  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3259  DNA mismatch repair protein  33.27 
 
 		 633 aa  293  9e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.357626  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3499  MutS family protein, putative  33.08 
 
 		 633 aa  292  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.969005  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3515  putative MutS family protein  33.08 
 
 		 633 aa  293  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3196  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  31.29 
 
 		 633 aa  291  3e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3289  MutS family protein  33.27 
 
 		 633 aa  291  4e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2199  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33.84 
 
 		 633 aa  291  4e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3547  MutS family protein  33.27 
 
 		 633 aa  291  4e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>