More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1104 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  65.09 
 
 
761 aa  952    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  100 
 
 
750 aa  1475    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  47.96 
 
 
789 aa  619  1e-176  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2632  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  36.12 
 
 
784 aa  430  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176007  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1014  MutS2 family protein  35.2 
 
 
793 aa  424  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0625051  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  37.73 
 
 
784 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05680  MutS2 family protein  34.18 
 
 
791 aa  419  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1470  MutS2 family protein  33.75 
 
 
792 aa  413  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.471316  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3240  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  34.64 
 
 
786 aa  405  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  34.01 
 
 
786 aa  405  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000221381  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1711  MutS2 family protein  37.47 
 
 
801 aa  405  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000187694  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.76 
 
 
786 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0381928  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4447  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.63 
 
 
786 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4285  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.29 
 
 
786 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4296  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.63 
 
 
786 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4662  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.88 
 
 
786 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0676128  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4794  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.63 
 
 
786 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.167233  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4380  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.5 
 
 
786 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4665  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.63 
 
 
786 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000565535 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0576  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.38 
 
 
786 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613341  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1638  MutS2 family protein  35.74 
 
 
782 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00924497  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2046  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.27 
 
 
791 aa  397  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0824  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  37.71 
 
 
792 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0458  MutS family ATPase  32.53 
 
 
795 aa  390  1e-107  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1717  MutS family ATPase  33.08 
 
 
800 aa  390  1e-107  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1813  MutS2 family protein  31.49 
 
 
796 aa  390  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.572275 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1203  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.22 
 
 
782 aa  388  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0730  MutS2 family protein  38.46 
 
 
804 aa  387  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1225  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.22 
 
 
782 aa  388  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  36.32 
 
 
786 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1356  MutS2 family protein  34.96 
 
 
794 aa  388  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4891  MutS2 family protein  35.67 
 
 
806 aa  382  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4014  MutS2 family protein  35.64 
 
 
828 aa  380  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.301308  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2125  MutS2 family protein  36.07 
 
 
776 aa  382  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0153  MutS2 family protein  31.82 
 
 
796 aa  376  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323958  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0062  MutS2 family protein  35.37 
 
 
826 aa  376  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21825  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0538  MutS2 family protein  33.04 
 
 
791 aa  377  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00387352  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1108  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.23 
 
 
782 aa  378  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0684525  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2135  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.41 
 
 
786 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1847  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.41 
 
 
786 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0426  mismatch repair ATPase  33.21 
 
 
791 aa  374  1e-102  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00172781  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0727  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.65 
 
 
782 aa  371  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2920  Smr protein/MutS2  32.87 
 
 
792 aa  371  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000870196 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1642  MutS2 family protein  31.15 
 
 
787 aa  372  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000590377  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2782  MutS2 family protein  33.63 
 
 
785 aa  369  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798995  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0545  MutS2 family protein  36.73 
 
 
775 aa  365  2e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.807648  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0230  MutS2 family protein  34.22 
 
 
789 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000337666  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1308  MutS2 family protein  32.82 
 
 
778 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1336  MutS2 family protein  31.61 
 
 
781 aa  357  5.999999999999999e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1493  MutS2 family protein  33.03 
 
 
757 aa  352  1e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1541  MutS2 family protein  33.03 
 
 
757 aa  351  2e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3655  MutS2 family protein  33.49 
 
 
780 aa  351  2e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2648  DNA-mismatch repair protein  31.91 
 
 
797 aa  350  6e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.270427  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1710  MutS2 family protein  34.84 
 
 
820 aa  350  6e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.261707  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0268  Smr protein/MutS2  31.8 
 
 
805 aa  348  3e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0912246 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  35.38 
 
 
788 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0299  MutS2 family protein  29.74 
 
 
803 aa  342  1e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0634  MutS2 family protein  31.13 
 
 
779 aa  338  1.9999999999999998e-91  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2651  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.12 
 
 
798 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.530364  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1809  MutS family DNA structure-specific ATPase  33.18 
 
 
776 aa  336  9e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.284001  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1737  MutS family DNA structure-specific ATPase  30.99 
 
 
783 aa  335  1e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2974  MutS 2 protein  34.42 
 
 
785 aa  330  4e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1568  MutS2 family protein  31.3 
 
 
763 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0734  MutS2 family protein  35.28 
 
 
780 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.11062  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0935  MutS2 family protein  32.86 
 
 
785 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5060  MutS2 family protein  30.21 
 
 
802 aa  324  4e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1719  MutS2 family protein  32.42 
 
 
779 aa  324  5e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2798  MutS2 family protein  31.57 
 
 
783 aa  321  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1152  MutS2 family protein  32.62 
 
 
757 aa  321  3e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0547  MutS2 family protein  32.62 
 
 
792 aa  321  3.9999999999999996e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2680  mismatch repair ATPase  33.63 
 
 
788 aa  320  7e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3771  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.6 
 
 
830 aa  320  7e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0384  MutS2 family protein  29.28 
 
 
840 aa  318  3e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3820  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.97 
 
 
830 aa  318  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1829  Smr protein/MutS2  29.55 
 
 
804 aa  317  5e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4901  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.04 
 
 
803 aa  317  6e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5711  MutS2 family protein  33.29 
 
 
824 aa  316  9.999999999999999e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1412  MutS2 family protein  31.31 
 
 
783 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29197e-17 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2750  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.54 
 
 
818 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1972  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  35.31 
 
 
774 aa  312  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.656834  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2338  MutS2 family protein  35.31 
 
 
774 aa  312  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1920  MutS2 family protein  28.74 
 
 
760 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.380002  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0999  Smr protein/MutS2  30.66 
 
 
769 aa  308  2.0000000000000002e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1999  MutS2 family protein  31.72 
 
 
825 aa  306  7e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3301  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.89 
 
 
857 aa  299  1e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0896287  normal  0.0130312 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0611  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  34.38 
 
 
796 aa  299  2e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.651644  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4299  MutS2 family protein  31.34 
 
 
812 aa  299  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1457  Smr protein/MutS2  34.19 
 
 
805 aa  296  7e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0509  MutS2 family protein  32.79 
 
 
799 aa  295  2e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0204433  normal  0.523172 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03891  putative DNA mismatch repair protein MutS family protein  32.07 
 
 
828 aa  295  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.331058 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2459  Smr protein/MutS2  33.03 
 
 
765 aa  293  6e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215696  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1689  Smr protein/MutS2  30.12 
 
 
793 aa  293  6e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123598  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0668  Smr protein/MutS2  29.89 
 
 
794 aa  292  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.529959  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1450  MutS2 family protein  28.75 
 
 
818 aa  289  1e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1897  MutS2 family protein  32.82 
 
 
767 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.557227  normal  0.0324553 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2225  Smr protein/MutS2  30.13 
 
 
793 aa  283  7.000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1732  Smr protein/MutS2  32.08 
 
 
796 aa  280  9e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2199  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33.01 
 
 
633 aa  276  9e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3205  DNA mismatch repair protein  31.64 
 
 
633 aa  275  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148048  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0219  MutS2 family protein  28.11 
 
 
803 aa  274  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>