More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1568 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1568  MutS2 family protein  100 
 
 		 763 aa  1514    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1152  MutS2 family protein  40.81 
 
 		 757 aa  539  9.999999999999999e-153  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05680  MutS2 family protein  36.49 
 
 		 791 aa  451  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1014  MutS2 family protein  34.67 
 
 		 793 aa  419  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0625051  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1642  MutS2 family protein  34.13 
 
 		 787 aa  421  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000590377  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1356  MutS2 family protein  33.07 
 
 		 794 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3655  MutS2 family protein  36.14 
 
 		 780 aa  417  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0634  MutS2 family protein  35.23 
 
 		 779 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0545  MutS2 family protein  32.39 
 
 		 775 aa  400  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.807648  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1638  MutS2 family protein  33.25 
 
 		 782 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00924497  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1813  MutS2 family protein  33.5 
 
 		 796 aa  398  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.572275 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4380  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.04 
 
 		 786 aa  392  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.46 
 
 		 786 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0381928  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4285  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.46 
 
 		 786 aa  390  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1541  MutS2 family protein  32.85 
 
 		 757 aa  391  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1493  MutS2 family protein  32.85 
 
 		 757 aa  391  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.58 
 
 		 786 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000221381  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1470  MutS2 family protein  30.73 
 
 		 792 aa  392  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.471316  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0547  MutS2 family protein  30.13 
 
 		 792 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4447  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.21 
 
 		 786 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4296  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.33 
 
 		 786 aa  388  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4662  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.46 
 
 		 786 aa  389  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0676128  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4794  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.21 
 
 		 786 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.167233  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2632  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.16 
 
 		 784 aa  388  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176007  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4665  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.33 
 
 		 786 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000565535 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3240  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.04 
 
 		 786 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0576  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.33 
 
 		 786 aa  388  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2974  MutS 2 protein  30.01 
 
 		 785 aa  382  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0153  MutS2 family protein  32.12 
 
 		 796 aa  382  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323958  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1336  MutS2 family protein  33.12 
 
 		 781 aa  379  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1711  MutS2 family protein  30.28 
 
 		 801 aa  376  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000187694  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0230  MutS2 family protein  30.52 
 
 		 789 aa  379  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000337666  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4299  MutS2 family protein  30.67 
 
 		 812 aa  376  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0727  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.88 
 
 		 782 aa  374  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2782  MutS2 family protein  30.36 
 
 		 785 aa  375  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798995  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2680  mismatch repair ATPase  29.99 
 
 		 788 aa  373  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1412  MutS2 family protein  31.11 
 
 		 783 aa  371  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29197e-17 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  31.04 
 
 		 784 aa  372  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1225  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.41 
 
 		 782 aa  369  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1203  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.41 
 
 		 782 aa  369  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2135  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.56 
 
 		 786 aa  368  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1847  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.69 
 
 		 786 aa  369  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1737  MutS family DNA structure-specific ATPase  31.65 
 
 		 783 aa  366  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0824  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.25 
 
 		 792 aa  365  2e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2125  MutS2 family protein  30.14 
 
 		 776 aa  364  4e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1829  Smr protein/MutS2  28.43 
 
 		 804 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2046  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.63 
 
 		 791 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1108  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.06 
 
 		 782 aa  362  2e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0684525  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0730  MutS2 family protein  28.89 
 
 		 804 aa  360  4e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2798  MutS2 family protein  30.63 
 
 		 783 aa  360  5e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  29.3 
 
 		 788 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2459  Smr protein/MutS2  30.31 
 
 		 765 aa  353  5e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215696  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4014  MutS2 family protein  30.58 
 
 		 828 aa  353  7e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.301308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4891  MutS2 family protein  29.94 
 
 		 806 aa  353  8e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1308  MutS2 family protein  33.42 
 
 		 778 aa  352  1e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0668  Smr protein/MutS2  29.59 
 
 		 794 aa  352  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.529959  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1719  MutS2 family protein  30.75 
 
 		 779 aa  351  3e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0062  MutS2 family protein  29.69 
 
 		 826 aa  351  3e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21825  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0935  MutS2 family protein  28.44 
 
 		 785 aa  350  7e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1368  Smr protein/MutS2  28.61 
 
 		 771 aa  349  8e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  30.58 
 
 		 786 aa  349  1e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1717  MutS family ATPase  30.89 
 
 		 800 aa  349  1e-94  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2225  Smr protein/MutS2  29.52 
 
 		 793 aa  347  3e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0426  mismatch repair ATPase  31.34 
 
 		 791 aa  347  4e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00172781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0299  MutS2 family protein  33.08 
 
 		 803 aa  346  7e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1732  Smr protein/MutS2  28.45 
 
 		 796 aa  345  1e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0268  Smr protein/MutS2  31.28 
 
 		 805 aa  345  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0912246 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1689  Smr protein/MutS2  28.22 
 
 		 793 aa  345  2e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123598  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0384  MutS2 family protein  27.57 
 
 		 840 aa  339  9.999999999999999e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1897  MutS2 family protein  27.86 
 
 		 767 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.557227  normal  0.0324553 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1920  MutS2 family protein  36.03 
 
 		 760 aa  336  7.999999999999999e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.380002  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  29.16 
 
 		 789 aa  332  1e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2054  DNA mismatch repair protein MutS-like  26.69 
 
 		 771 aa  332  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  31.3 
 
 		 750 aa  331  3e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0538  MutS2 family protein  28.98 
 
 		 791 aa  331  4e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00387352  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1710  MutS2 family protein  28.84 
 
 		 820 aa  329  1.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.261707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0734  MutS2 family protein  29.27 
 
 		 780 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.11062  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1809  MutS family DNA structure-specific ATPase  31.74 
 
 		 776 aa  328  3e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.284001  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2920  Smr protein/MutS2  29.72 
 
 		 792 aa  326  9e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000870196 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  31.97 
 
 		 761 aa  323  8e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5060  MutS2 family protein  30.93 
 
 		 802 aa  323  9.000000000000001e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2648  DNA-mismatch repair protein  30.05 
 
 		 797 aa  322  9.999999999999999e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.270427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0496  Smr protein/MutS2  27.25 
 
 		 817 aa  319  1e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00013691 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3820  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.85 
 
 		 830 aa  317  7e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3771  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.85 
 
 		 830 aa  316  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0458  MutS family ATPase  30.11 
 
 		 795 aa  313  9e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5711  MutS2 family protein  25.6 
 
 		 824 aa  311  2.9999999999999997e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0098  MutS2 protein  31.57 
 
 		 780 aa  310  1.0000000000000001e-82  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0699  DNA mismatch repair protein MutS-like  28.2 
 
 		 793 aa  307  6e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0999  Smr protein/MutS2  32.39 
 
 		 769 aa  307  6e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4901  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.77 
 
 		 803 aa  299  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3205  DNA mismatch repair protein  34.24 
 
 		 633 aa  298  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148048  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0447  DNA mismatch repair protein MutS-like  28.07 
 
 		 789 aa  299  2e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3486  putative MutS family protein  34.51 
 
 		 633 aa  298  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.441527  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3196  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  34.51 
 
 		 633 aa  296  7e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3289  MutS family protein  33.85 
 
 		 633 aa  295  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3259  DNA mismatch repair protein  34.05 
 
 		 633 aa  295  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.357626  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2651  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.43 
 
 		 798 aa  295  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.530364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3547  MutS family protein  33.85 
 
 		 633 aa  295  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3515  putative MutS family protein  34.12 
 
 		 633 aa  294  3e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>