More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2031 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2913  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  61.94 
 
 		 721 aa  912    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00104872  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2031  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  100 
 
 		 723 aa  1474    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10978  MutS2 family protein  57 
 
 		 722 aa  839    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2780  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  36.19 
 
 		 705 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0268  Smr protein/MutS2  34.16 
 
 		 805 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0912246 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2920  Smr protein/MutS2  31.97 
 
 		 792 aa  356  7.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000870196 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5060  MutS2 family protein  34.02 
 
 		 802 aa  355  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2648  DNA-mismatch repair protein  33.63 
 
 		 797 aa  350  8e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.270427  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0384  MutS2 family protein  33.33 
 
 		 840 aa  317  3e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0727  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.37 
 
 		 782 aa  297  5e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1829  Smr protein/MutS2  29.18 
 
 		 804 aa  296  8e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0730  MutS2 family protein  28.91 
 
 		 804 aa  288  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1717  MutS family ATPase  32.41 
 
 		 800 aa  287  5e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05680  MutS2 family protein  29.58 
 
 		 791 aa  285  3.0000000000000004e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1638  MutS2 family protein  31.38 
 
 		 782 aa  279  1e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00924497  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1203  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.5 
 
 		 782 aa  275  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1225  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.5 
 
 		 782 aa  275  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  31.19 
 
 		 786 aa  273  8.000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0547  MutS2 family protein  32.12 
 
 		 792 aa  273  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1689  Smr protein/MutS2  32.03 
 
 		 793 aa  272  2e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0699  DNA mismatch repair protein MutS-like  28.29 
 
 		 793 aa  272  2e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1356  MutS2 family protein  28.42 
 
 		 794 aa  272  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2046  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.66 
 
 		 791 aa  272  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0230  MutS2 family protein  29.36 
 
 		 789 aa  271  4e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000337666  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  31.77 
 
 		 784 aa  270  5e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2632  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.51 
 
 		 784 aa  270  8.999999999999999e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176007  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0538  MutS2 family protein  31.03 
 
 		 791 aa  269  2e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00387352  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1470  MutS2 family protein  30.48 
 
 		 792 aa  268  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.471316  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1108  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.98 
 
 		 782 aa  268  2e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0684525  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0668  Smr protein/MutS2  28.06 
 
 		 794 aa  269  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.529959  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1813  MutS2 family protein  30.85 
 
 		 796 aa  264  4e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.572275 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  30.58 
 
 		 789 aa  263  6e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1642  MutS2 family protein  30.35 
 
 		 787 aa  263  6.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000590377  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2225  Smr protein/MutS2  27.86 
 
 		 793 aa  262  2e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2135  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.68 
 
 		 786 aa  261  3e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1847  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.68 
 
 		 786 aa  261  3e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1732  Smr protein/MutS2  27.66 
 
 		 796 aa  261  3e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2974  MutS 2 protein  30.63 
 
 		 785 aa  260  6e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3240  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.54 
 
 		 786 aa  259  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0153  MutS2 family protein  28.9 
 
 		 796 aa  254  3e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323958  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1014  MutS2 family protein  30.29 
 
 		 793 aa  254  5.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0625051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1412  MutS2 family protein  28.64 
 
 		 783 aa  252  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29197e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0576  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.69 
 
 		 786 aa  251  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2680  mismatch repair ATPase  30.48 
 
 		 788 aa  251  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0824  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.03 
 
 		 792 aa  250  6e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4285  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.35 
 
 		 786 aa  249  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4296  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.35 
 
 		 786 aa  249  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1308  MutS2 family protein  33.65 
 
 		 778 aa  249  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.35 
 
 		 786 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0381928  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4665  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.35 
 
 		 786 aa  249  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000565535 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2199  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  30.55 
 
 		 633 aa  249  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2159  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.37 
 
 		 522 aa  248  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2798  MutS2 family protein  27.25 
 
 		 783 aa  247  4e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0426  mismatch repair ATPase  29.61 
 
 		 791 aa  248  4e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00172781  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4447  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.18 
 
 		 786 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4794  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.18 
 
 		 786 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.167233  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.18 
 
 		 786 aa  247  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000221381  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5711  MutS2 family protein  27.41 
 
 		 824 aa  246  6.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4380  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.01 
 
 		 786 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4662  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.18 
 
 		 786 aa  246  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0676128  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4891  MutS2 family protein  30.02 
 
 		 806 aa  244  3.9999999999999997e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3515  putative MutS family protein  31.09 
 
 		 633 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2782  MutS2 family protein  30.46 
 
 		 785 aa  244  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798995  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0545  MutS2 family protein  31.23 
 
 		 775 aa  243  7e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.807648  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3289  MutS family protein  31.14 
 
 		 633 aa  243  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3205  DNA mismatch repair protein  31.14 
 
 		 633 aa  243  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148048  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1336  MutS2 family protein  31.79 
 
 		 781 aa  243  1e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3547  MutS family protein  31.14 
 
 		 633 aa  243  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3504  putative MutS family protein  31.14 
 
 		 633 aa  243  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3259  DNA mismatch repair protein  31.14 
 
 		 633 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.357626  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0458  MutS family ATPase  27.2 
 
 		 795 aa  241  2.9999999999999997e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3196  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  30.96 
 
 		 633 aa  241  4e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0634  MutS2 family protein  30.27 
 
 		 779 aa  241  5e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3499  MutS family protein, putative  30.95 
 
 		 633 aa  240  8e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.969005  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3486  putative MutS family protein  30.75 
 
 		 633 aa  238  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.441527  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0062  MutS2 family protein  29.96 
 
 		 826 aa  238  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21825  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1493  MutS2 family protein  27.18 
 
 		 757 aa  236  9e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1541  MutS2 family protein  27.18 
 
 		 757 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0299  MutS2 family protein  28.57 
 
 		 803 aa  234  3e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1760  DNA mismatch repair protein MutS  30.69 
 
 		 572 aa  234  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.21933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4014  MutS2 family protein  26.92 
 
 		 828 aa  233  7.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.301308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0447  DNA mismatch repair protein MutS-like  30.77 
 
 		 789 aa  232  2e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4901  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.08 
 
 		 803 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  29.02 
 
 		 750 aa  231  4e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1568  MutS2 family protein  28.07 
 
 		 763 aa  230  7e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1711  MutS2 family protein  27.11 
 
 		 801 aa  229  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000187694  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1897  MutS2 family protein  27.71 
 
 		 767 aa  229  1e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.557227  normal  0.0324553 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1737  MutS family DNA structure-specific ATPase  29.59 
 
 		 783 aa  229  1e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  30.22 
 
 		 761 aa  228  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3655  MutS2 family protein  30.34 
 
 		 780 aa  227  5.0000000000000005e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1710  MutS2 family protein  27.67 
 
 		 820 aa  227  5.0000000000000005e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.261707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0784  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.83 
 
 		 529 aa  227  6e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2651  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.52 
 
 		 798 aa  226  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.530364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3820  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.88 
 
 		 830 aa  224  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0935  MutS2 family protein  31.36 
 
 		 785 aa  223  7e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1809  MutS family DNA structure-specific ATPase  27.19 
 
 		 776 aa  223  7e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.284001  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3771  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.88 
 
 		 830 aa  223  9e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1152  MutS2 family protein  28.64 
 
 		 757 aa  222  1.9999999999999999e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1450  MutS2 family protein  25.37 
 
 		 818 aa  221  3e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0098  MutS2 protein  27.79 
 
 		 780 aa  221  3e-56  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>