More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1920 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0299  MutS2 family protein  49.05 
 
 		 803 aa  740    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1920  MutS2 family protein  100 
 
 		 760 aa  1512    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.380002  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1493  MutS2 family protein  46.61 
 
 		 757 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1541  MutS2 family protein  46.61 
 
 		 757 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2632  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.41 
 
 		 784 aa  432  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176007  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.01 
 
 		 786 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0381928  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0999  Smr protein/MutS2  37.58 
 
 		 769 aa  418  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4285  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.14 
 
 		 786 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.26 
 
 		 786 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000221381  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4447  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.01 
 
 		 786 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4296  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.14 
 
 		 786 aa  415  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4794  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.01 
 
 		 786 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.167233  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0576  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.32 
 
 		 786 aa  414  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4662  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  34.89 
 
 		 786 aa  415  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0676128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4665  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.14 
 
 		 786 aa  415  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000565535 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4380  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.59 
 
 		 786 aa  410  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05680  MutS2 family protein  35.87 
 
 		 791 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3240  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  34.31 
 
 		 786 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1014  MutS2 family protein  34.92 
 
 		 793 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0625051  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  35.11 
 
 		 786 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1813  MutS2 family protein  34.53 
 
 		 796 aa  395  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.572275 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1470  MutS2 family protein  33.25 
 
 		 792 aa  390  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.471316  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2046  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.06 
 
 		 791 aa  388  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0824  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33 
 
 		 792 aa  388  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1108  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.56 
 
 		 782 aa  389  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0684525  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0634  MutS2 family protein  38.95 
 
 		 779 aa  376  1e-103  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  31.65 
 
 		 784 aa  374  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1638  MutS2 family protein  33.93 
 
 		 782 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00924497  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0458  MutS family ATPase  32.01 
 
 		 795 aa  373  1e-102  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1642  MutS2 family protein  35.33 
 
 		 787 aa  373  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000590377  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0538  MutS2 family protein  31.59 
 
 		 791 aa  374  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00387352  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2125  MutS2 family protein  31.89 
 
 		 776 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1711  MutS2 family protein  32.74 
 
 		 801 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000187694  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4891  MutS2 family protein  33.43 
 
 		 806 aa  369  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1737  MutS family DNA structure-specific ATPase  33.74 
 
 		 783 aa  369  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0727  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.65 
 
 		 782 aa  365  1e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0230  MutS2 family protein  31.87 
 
 		 789 aa  365  1e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000337666  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0426  mismatch repair ATPase  31.3 
 
 		 791 aa  365  1e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00172781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1203  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.39 
 
 		 782 aa  361  3e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1225  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.39 
 
 		 782 aa  361  3e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1809  MutS family DNA structure-specific ATPase  31.59 
 
 		 776 aa  360  6e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.284001  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1829  Smr protein/MutS2  31.76 
 
 		 804 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1336  MutS2 family protein  35.01 
 
 		 781 aa  357  3.9999999999999996e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2135  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  34 
 
 		 786 aa  357  3.9999999999999996e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1847  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  34.12 
 
 		 786 aa  357  5e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0545  MutS2 family protein  33.52 
 
 		 775 aa  353  8.999999999999999e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.807648  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1689  Smr protein/MutS2  33.02 
 
 		 793 aa  351  4e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123598  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1719  MutS2 family protein  33.61 
 
 		 779 aa  348  2e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1308  MutS2 family protein  34.65 
 
 		 778 aa  348  2e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0062  MutS2 family protein  31.05 
 
 		 826 aa  345  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21825  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1152  MutS2 family protein  33.43 
 
 		 757 aa  342  2e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1356  MutS2 family protein  32.15 
 
 		 794 aa  340  5e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3655  MutS2 family protein  36.11 
 
 		 780 aa  340  5.9999999999999996e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0153  MutS2 family protein  31.36 
 
 		 796 aa  340  7e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323958  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1568  MutS2 family protein  35.65 
 
 		 763 aa  334  4e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  31.68 
 
 		 789 aa  333  5e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1717  MutS family ATPase  31.97 
 
 		 800 aa  333  5e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1710  MutS2 family protein  31.54 
 
 		 820 aa  332  2e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.261707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0668  Smr protein/MutS2  29.99 
 
 		 794 aa  331  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.529959  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1732  Smr protein/MutS2  30.68 
 
 		 796 aa  331  3e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  29.33 
 
 		 750 aa  325  1e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  34.15 
 
 		 761 aa  324  4e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2974  MutS 2 protein  31.21 
 
 		 785 aa  324  4e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0730  MutS2 family protein  29.74 
 
 		 804 aa  323  5e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2782  MutS2 family protein  29.67 
 
 		 785 aa  323  7e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798995  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0098  MutS2 protein  33.64 
 
 		 780 aa  322  9.999999999999999e-87  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2798  MutS2 family protein  30.91 
 
 		 783 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2225  Smr protein/MutS2  30.85 
 
 		 793 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1412  MutS2 family protein  31.18 
 
 		 783 aa  320  6e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29197e-17 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4014  MutS2 family protein  30.33 
 
 		 828 aa  320  6e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.301308  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0547  MutS2 family protein  30.83 
 
 		 792 aa  318  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4299  MutS2 family protein  31.03 
 
 		 812 aa  314  3.9999999999999997e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0734  MutS2 family protein  31.42 
 
 		 780 aa  313  9e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.11062  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1450  MutS2 family protein  30.48 
 
 		 818 aa  311  2e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2680  mismatch repair ATPase  28.04 
 
 		 788 aa  311  4e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0935  MutS2 family protein  30.36 
 
 		 785 aa  308  4.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  28.86 
 
 		 788 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0699  DNA mismatch repair protein MutS-like  30.74 
 
 		 793 aa  305  3.0000000000000004e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2651  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.31 
 
 		 798 aa  303  5.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.530364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2459  Smr protein/MutS2  28.11 
 
 		 765 aa  303  1e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215696  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0447  DNA mismatch repair protein MutS-like  29.49 
 
 		 789 aa  301  2e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4901  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.41 
 
 		 803 aa  297  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0268  Smr protein/MutS2  31.34 
 
 		 805 aa  295  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0912246 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5711  MutS2 family protein  26.76 
 
 		 824 aa  291  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2648  DNA-mismatch repair protein  30.8 
 
 		 797 aa  291  3e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.270427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0611  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.87 
 
 		 796 aa  291  4e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.651644  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1999  MutS2 family protein  29.12 
 
 		 825 aa  288  2e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2750  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  27.82 
 
 		 818 aa  286  7e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3301  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  27.76 
 
 		 857 aa  286  1.0000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0896287  normal  0.0130312 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1897  MutS2 family protein  28.34 
 
 		 767 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.557227  normal  0.0324553 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1457  Smr protein/MutS2  29.55 
 
 		 805 aa  282  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1972  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  27.61 
 
 		 774 aa  279  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.656834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2338  MutS2 family protein  27.61 
 
 		 774 aa  279  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1368  Smr protein/MutS2  27.78 
 
 		 771 aa  279  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3771  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  26.56 
 
 		 830 aa  276  7e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5060  MutS2 family protein  30.66 
 
 		 802 aa  276  8e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3820  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  26.67 
 
 		 830 aa  276  8e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2199  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  34.06 
 
 		 633 aa  273  7e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3515  putative MutS family protein  33.98 
 
 		 633 aa  272  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1218  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  32.39 
 
 		 654 aa  272  2e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>