More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2459 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1368  Smr protein/MutS2  51.76 
 
 
771 aa  743    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2459  Smr protein/MutS2  100 
 
 
765 aa  1551    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215696  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2054  DNA mismatch repair protein MutS-like  49.35 
 
 
771 aa  738    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1897  MutS2 family protein  51.24 
 
 
767 aa  761    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.557227  normal  0.0324553 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0496  Smr protein/MutS2  47.68 
 
 
817 aa  682    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00013691 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1087  Smr protein/MutS2  45.78 
 
 
817 aa  623  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2632  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  34.04 
 
 
784 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176007  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0547  MutS2 family protein  34.63 
 
 
792 aa  382  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2782  MutS2 family protein  33 
 
 
785 aa  366  1e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798995  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0634  MutS2 family protein  29.09 
 
 
779 aa  360  4e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  33.33 
 
 
788 aa  360  4e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3655  MutS2 family protein  30.45 
 
 
780 aa  359  8e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3240  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.68 
 
 
786 aa  359  9.999999999999999e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  33.58 
 
 
786 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2974  MutS 2 protein  33.46 
 
 
785 aa  357  5.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2680  mismatch repair ATPase  33.75 
 
 
788 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0230  MutS2 family protein  32.71 
 
 
789 aa  352  1e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000337666  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.03 
 
 
786 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000221381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.77 
 
 
786 aa  350  6e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0381928  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4285  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.9 
 
 
786 aa  349  1e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4296  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.9 
 
 
786 aa  349  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0153  MutS2 family protein  30.83 
 
 
796 aa  349  1e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323958  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4662  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.11 
 
 
786 aa  348  2e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0676128  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1470  MutS2 family protein  30.98 
 
 
792 aa  348  2e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.471316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4665  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.13 
 
 
786 aa  348  2e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000565535 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0576  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.86 
 
 
786 aa  347  6e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613341  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4447  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.9 
 
 
786 aa  346  7e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4794  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.9 
 
 
786 aa  346  7e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.167233  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05680  MutS2 family protein  30.79 
 
 
791 aa  346  1e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0426  mismatch repair ATPase  31.72 
 
 
791 aa  346  1e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00172781  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4380  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.86 
 
 
786 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1568  MutS2 family protein  30.18 
 
 
763 aa  343  7e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0935  MutS2 family protein  32.74 
 
 
785 aa  343  9e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1638  MutS2 family protein  31.46 
 
 
782 aa  342  2e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00924497  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1203  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.7 
 
 
782 aa  339  9.999999999999999e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1225  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.7 
 
 
782 aa  339  9.999999999999999e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1813  MutS2 family protein  28.23 
 
 
796 aa  338  1.9999999999999998e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.572275 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0824  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.25 
 
 
792 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4891  MutS2 family protein  31.66 
 
 
806 aa  337  5e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1450  MutS2 family protein  31.05 
 
 
818 aa  337  5.999999999999999e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1642  MutS2 family protein  30.15 
 
 
787 aa  337  5.999999999999999e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000590377  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1710  MutS2 family protein  32.84 
 
 
820 aa  336  1e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.261707  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2046  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.34 
 
 
791 aa  336  1e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0727  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.35 
 
 
782 aa  332  1e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1717  MutS family ATPase  32.93 
 
 
800 aa  333  1e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1412  MutS2 family protein  30.45 
 
 
783 aa  332  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29197e-17 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1847  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.31 
 
 
786 aa  331  3e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2135  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.18 
 
 
786 aa  330  4e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2798  MutS2 family protein  30.8 
 
 
783 aa  329  9e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1336  MutS2 family protein  30.19 
 
 
781 aa  329  1.0000000000000001e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4014  MutS2 family protein  31.77 
 
 
828 aa  328  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.301308  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0062  MutS2 family protein  32.85 
 
 
826 aa  328  3e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21825  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1014  MutS2 family protein  28.86 
 
 
793 aa  327  6e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0625051  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1152  MutS2 family protein  28.53 
 
 
757 aa  325  3e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0538  MutS2 family protein  28.84 
 
 
791 aa  322  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00387352  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1308  MutS2 family protein  30.33 
 
 
778 aa  321  3e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1108  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.2 
 
 
782 aa  320  5e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0684525  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  32.09 
 
 
784 aa  319  1e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1809  MutS family DNA structure-specific ATPase  30.06 
 
 
776 aa  318  2e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.284001  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1737  MutS family DNA structure-specific ATPase  30.14 
 
 
783 aa  317  4e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0299  MutS2 family protein  28.62 
 
 
803 aa  315  1.9999999999999998e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1719  MutS2 family protein  30.08 
 
 
779 aa  314  2.9999999999999996e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0545  MutS2 family protein  31.69 
 
 
775 aa  313  5.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.807648  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1711  MutS2 family protein  30.37 
 
 
801 aa  313  1e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000187694  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1829  Smr protein/MutS2  29.61 
 
 
804 aa  311  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1493  MutS2 family protein  30.15 
 
 
757 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1541  MutS2 family protein  30.15 
 
 
757 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0730  MutS2 family protein  32.66 
 
 
804 aa  301  3e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1356  MutS2 family protein  30.81 
 
 
794 aa  301  4e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  32.36 
 
 
761 aa  298  2e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  33.03 
 
 
750 aa  293  6e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2338  MutS2 family protein  33.89 
 
 
774 aa  292  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1972  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.89 
 
 
774 aa  292  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.656834  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1920  MutS2 family protein  27.71 
 
 
760 aa  291  3e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.380002  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1732  Smr protein/MutS2  29.69 
 
 
796 aa  289  2e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4901  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.48 
 
 
803 aa  286  9e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3820  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.08 
 
 
830 aa  286  9e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1689  Smr protein/MutS2  28.69 
 
 
793 aa  284  5.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123598  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  32.98 
 
 
789 aa  283  6.000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3771  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.97 
 
 
830 aa  282  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1457  Smr protein/MutS2  32.28 
 
 
805 aa  278  4e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0458  MutS family ATPase  27.54 
 
 
795 aa  277  4e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0668  Smr protein/MutS2  26.98 
 
 
794 aa  276  9e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.529959  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5711  MutS2 family protein  29.99 
 
 
824 aa  276  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2651  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.71 
 
 
798 aa  272  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.530364  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3301  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.3 
 
 
857 aa  273  1e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0896287  normal  0.0130312 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2225  Smr protein/MutS2  28.78 
 
 
793 aa  272  2e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4299  MutS2 family protein  32.54 
 
 
812 aa  272  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2648  DNA-mismatch repair protein  29.43 
 
 
797 aa  271  4e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.270427  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0699  DNA mismatch repair protein MutS-like  28.66 
 
 
793 aa  266  8e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2125  MutS2 family protein  31.24 
 
 
776 aa  266  8.999999999999999e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0268  Smr protein/MutS2  30.24 
 
 
805 aa  266  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0912246 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2920  Smr protein/MutS2  28.11 
 
 
792 aa  264  6e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000870196 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0734  MutS2 family protein  32.07 
 
 
780 aa  262  2e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.11062  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0999  Smr protein/MutS2  27.53 
 
 
769 aa  261  4e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0611  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.23 
 
 
796 aa  260  5.0000000000000005e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.651644  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0098  MutS2 protein  29.7 
 
 
780 aa  254  3e-66  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0384  MutS2 family protein  26.66 
 
 
840 aa  252  2e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5060  MutS2 family protein  27.94 
 
 
802 aa  246  8e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0447  DNA mismatch repair protein MutS-like  29.43 
 
 
789 aa  246  9e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>