More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0204 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0204  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  100 
 
 		 475 aa  953    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1083  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  37.55 
 
 		 447 aa  289  7e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0195  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  38.04 
 
 		 446 aa  277  3e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1072  MutS family protein  33.19 
 
 		 463 aa  241  2.9999999999999997e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.6736 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1433  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.17 
 
 		 648 aa  97.8  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00229473  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85730  predicted protein  29.45 
 
 		 871 aa  98.2  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.144196 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1486  DNA mismatch repair protein MutS  29.31 
 
 		 867 aa  94.7  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  30 
 
 		 881 aa  94.7  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  29.96 
 
 		 870 aa  94.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1642  MutS2 family protein  31.72 
 
 		 787 aa  93.6  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000590377  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0159  DNA mismatch repair protein MutS  28.27 
 
 		 910 aa  93.2  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  32.2 
 
 		 858 aa  92.8  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4799  DNA mismatch repair protein MutS  29.29 
 
 		 896 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.720607 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  29.82 
 
 		 846 aa  92  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4649  DNA mismatch repair protein MutS  28.87 
 
 		 916 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.427089 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  29.46 
 
 		 750 aa  90.9  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0209  DNA mismatch repair protein MutS  26.41 
 
 		 877 aa  90.9  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.784326 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  27.76 
 
 		 872 aa  90.9  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  29.57 
 
 		 881 aa  90.1  8e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4282  DNA mismatch repair protein MutS  28.45 
 
 		 916 aa  90.1  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07480  DNA mismatch repair protein MSH2, putative  28.39 
 
 		 965 aa  89.7  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271772  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  29.82 
 
 		 884 aa  89.7  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  29.82 
 
 		 884 aa  89.7  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  30.74 
 
 		 857 aa  89.4  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  28.02 
 
 		 956 aa  89.4  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1638  MutS2 family protein  28.51 
 
 		 782 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00924497  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  28.95 
 
 		 846 aa  88.6  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  28 
 
 		 859 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  28.46 
 
 		 828 aa  88.6  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  25.59 
 
 		 784 aa  88.6  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0174  DNA mismatch repair protein MutS  29.49 
 
 		 820 aa  88.2  3e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0147  DNA mismatch repair protein MutS  27.85 
 
 		 910 aa  88.2  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  27.56 
 
 		 855 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53969  predicted protein  25.9 
 
 		 1423 aa  87.8  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2651  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.14 
 
 		 798 aa  88.6  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.530364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0670  DNA mismatch repair protein MutS  28.21 
 
 		 902 aa  88.2  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.48055  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1181  DNA mismatch repair protein MutS  26.67 
 
 		 927 aa  88.2  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0142  DNA mismatch repair protein MutS  27.85 
 
 		 898 aa  88.2  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  28.82 
 
 		 868 aa  87.8  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1813  MutS2 family protein  30.43 
 
 		 796 aa  87.4  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.572275 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0621  DNA mismatch repair protein MutS  27.62 
 
 		 905 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.720679  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  27.56 
 
 		 857 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1450  MutS2 family protein  27.49 
 
 		 818 aa  87  6e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  29.61 
 
 		 855 aa  87  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  27.56 
 
 		 857 aa  87  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  0.000000000609956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  31.2 
 
 		 886 aa  87  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  27.35 
 
 		 870 aa  86.7  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0538  MutS2 family protein  25.55 
 
 		 791 aa  86.7  8e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00387352  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  28.15 
 
 		 853 aa  85.9  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  27.11 
 
 		 857 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1004  DNA mismatch repair protein MutS  30.53 
 
 		 817 aa  86.3  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4552  DNA mismatch repair protein MutS  28.98 
 
 		 871 aa  85.9  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0219  MutS2 family protein  28.75 
 
 		 803 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0434  DNA mismatch repair protein MutS  26.51 
 
 		 853 aa  86.3  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0558205  normal  0.0590484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  29.06 
 
 		 864 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4031  DNA mismatch repair protein MutS  27.2 
 
 		 881 aa  86.7  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137829  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34085  predicted protein  31.32 
 
 		 1007 aa  86.3  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.297969  normal  0.623648 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2750  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  26.05 
 
 		 818 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  30.7 
 
 		 860 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  27.24 
 
 		 854 aa  85.1  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  30.64 
 
 		 860 aa  85.5  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5060  MutS2 family protein  28.64 
 
 		 802 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1250  DNA mismatch repair protein MutS  29.69 
 
 		 823 aa  85.9  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.297858  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3466  DNA mismatch repair protein MutS  27.16 
 
 		 877 aa  85.5  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3706  DNA mismatch repair protein MutS  35.37 
 
 		 1085 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0191943 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03891  putative DNA mismatch repair protein MutS family protein  28.05 
 
 		 828 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.331058 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  29.49 
 
 		 856 aa  85.5  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  29.87 
 
 		 840 aa  85.9  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  29.91 
 
 		 891 aa  84.7  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_002950  PG0384  MutS2 family protein  29.3 
 
 		 840 aa  85.1  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  30.9 
 
 		 855 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  27.11 
 
 		 880 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  30.86 
 
 		 863 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  29.03 
 
 		 862 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1336  MutS2 family protein  29.3 
 
 		 781 aa  84.7  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  31.71 
 
 		 863 aa  84.7  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0423  DNA mismatch repair protein MutS  27.17 
 
 		 883 aa  84.3  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1243  DNA mismatch repair protein MutS  27.43 
 
 		 926 aa  84.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.32952  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3531  DNA mismatch repair protein MutS  35.37 
 
 		 1088 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  28.63 
 
 		 883 aa  84.3  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  27.56 
 
 		 855 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  29.57 
 
 		 850 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  28.45 
 
 		 867 aa  84  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  30.04 
 
 		 859 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  27.56 
 
 		 855 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  30.04 
 
 		 882 aa  84  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0230  MutS2 family protein  27.35 
 
 		 789 aa  84  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000337666  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  26.5 
 
 		 869 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  28.89 
 
 		 857 aa  83.6  0.000000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03749  DNA mismatch repair protein msh3 (MutS protein homolog 3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B6T1]  28.63 
 
 		 1091 aa  83.6  0.000000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.642565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2031  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  27.23 
 
 		 723 aa  83.6  0.000000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  27.56 
 
 		 860 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1238  DNA mismatch repair protein MutS  25.97 
 
 		 858 aa  83.2  0.000000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02371  DNA mismatch repair protein MutS family protein  28.22 
 
 		 803 aa  83.2  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05680  MutS2 family protein  29.95 
 
 		 791 aa  83.2  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02471  DNA mismatch repair protein MutS family protein  29.31 
 
 		 803 aa  83.2  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.677193  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  28.76 
 
 		 882 aa  83.2  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0827  DNA mismatch repair protein MutS  24.89 
 
 		 878 aa  83.2  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2842  DNA mismatch repair protein MutS  31.64 
 
 		 870 aa  82.4  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  33.33 
 
 		 895 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>