More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3466 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0621  DNA mismatch repair protein MutS  56.87 
 
 		 905 aa  794    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.720679  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0142  DNA mismatch repair protein MutS  57.49 
 
 		 898 aa  947    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  43.55 
 
 		 871 aa  650    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3599  DNA mismatch repair protein MutS  58.56 
 
 		 908 aa  928    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2326  DNA mismatch repair protein MutS  52.87 
 
 		 925 aa  787    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.160487 
 
 
-
 
NC_002978  WD0190  DNA mismatch repair protein MutS  45.03 
 
 		 820 aa  728    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  43.71 
 
 		 851 aa  638    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2655  DNA mismatch repair protein MutS  70.21 
 
 		 876 aa  1145    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.607224  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0147  DNA mismatch repair protein MutS  57.49 
 
 		 910 aa  946    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0513  DNA mismatch repair protein MutS  56.43 
 
 		 907 aa  889    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3424  DNA mismatch repair protein MutS  43.82 
 
 		 851 aa  641    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0827  DNA mismatch repair protein MutS  69.37 
 
 		 878 aa  1146    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0423  DNA mismatch repair protein MutS  56.72 
 
 		 883 aa  930    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4799  DNA mismatch repair protein MutS  55.38 
 
 		 896 aa  835    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.720607 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0260  DNA mismatch repair protein MutS  43.33 
 
 		 804 aa  710    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.76262  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0490  DNA mismatch repair protein MutS  55.92 
 
 		 888 aa  883    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  42.97 
 
 		 863 aa  642    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  43.71 
 
 		 851 aa  639    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1218  DNA mismatch repair protein MutS  70.86 
 
 		 875 aa  1165    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.318661  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  41.19 
 
 		 869 aa  659    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  43.49 
 
 		 851 aa  637    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2761  DNA mismatch repair protein MutS  51.37 
 
 		 904 aa  766    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  43.45 
 
 		 872 aa  649    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4649  DNA mismatch repair protein MutS  54.81 
 
 		 916 aa  829    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.427089 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  48.64 
 
 		 873 aa  676    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0913  DNA mismatch repair protein MutS  47.96 
 
 		 882 aa  657    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3466  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 877 aa  1757    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3541  DNA mismatch repair protein MutS  56.79 
 
 		 929 aa  866    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  44.75 
 
 		 852 aa  650    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0528  DNA mismatch repair protein MutS  57.19 
 
 		 911 aa  906    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0799066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3293  DNA mismatch repair protein MutS  50.06 
 
 		 858 aa  755    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0310827  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0824  DNA mismatch repair protein MutS  43.31 
 
 		 804 aa  694    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0209  DNA mismatch repair protein MutS  67.97 
 
 		 877 aa  1139    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.784326 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2879  DNA mismatch repair protein MutS  70.74 
 
 		 880 aa  1163    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0363  DNA mismatch repair protein MutS  56.56 
 
 		 882 aa  902    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0047  DNA mismatch repair protein MutS  57.5 
 
 		 908 aa  926    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.967716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0008  DNA mismatch repair protein MutS  52.17 
 
 		 904 aa  800    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0032  DNA mismatch repair protein MutS  57.79 
 
 		 880 aa  924    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  43.23 
 
 		 862 aa  637    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4282  DNA mismatch repair protein MutS  55.66 
 
 		 916 aa  829    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0321  DNA mismatch repair protein MutS  56.32 
 
 		 923 aa  899    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.784021  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0614  DNA mismatch repair protein MutS  57.03 
 
 		 907 aa  919    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1263  DNA mismatch repair protein MutS  51.84 
 
 		 919 aa  800    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0902404 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2875  DNA mismatch repair protein MutS  68.49 
 
 		 879 aa  1146    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.928835 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2791  DNA mismatch repair protein MutS  51.66 
 
 		 864 aa  756    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0030  DNA mismatch repair protein MutS  58.09 
 
 		 915 aa  894    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355609 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6533  DNA mismatch repair protein MutS  53.95 
 
 		 962 aa  786    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948742  normal  0.317969 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4031  DNA mismatch repair protein MutS  58.07 
 
 		 881 aa  924    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137829  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0035  DNA mismatch repair protein MutS  56.81 
 
 		 921 aa  874    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0159  DNA mismatch repair protein MutS  57.21 
 
 		 910 aa  949    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  44.38 
 
 		 854 aa  645    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  41.49 
 
 		 869 aa  637    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  44.53 
 
 		 854 aa  649    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3021  DNA mismatch repair protein MutS  53.15 
 
 		 897 aa  831    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  43.51 
 
 		 872 aa  671    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7101  DNA mismatch repair protein MutS  54.67 
 
 		 929 aa  803    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743761  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1299  DNA mismatch repair protein MutS  52.09 
 
 		 914 aa  863    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.141225  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  44.66 
 
 		 854 aa  647    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7642  DNA mismatch repair protein MutS  55.54 
 
 		 910 aa  886    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.532158 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  46.29 
 
 		 868 aa  689    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  43.86 
 
 		 855 aa  635  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  41.41 
 
 		 870 aa  634  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  42.34 
 
 		 870 aa  633  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  43.86 
 
 		 855 aa  634  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  43.86 
 
 		 855 aa  634  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  44.09 
 
 		 855 aa  635  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  43.74 
 
 		 855 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  44.95 
 
 		 891 aa  631  1e-179  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02583  DNA mismatch repair protein  43.81 
 
 		 853 aa  625  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.858461  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0955  DNA mismatch repair protein MutS  43.81 
 
 		 853 aa  625  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3986  DNA mismatch repair protein MutS  43.81 
 
 		 853 aa  627  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.724345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02548  hypothetical protein  43.81 
 
 		 853 aa  625  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766489  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0979  DNA mismatch repair protein MutS  43.81 
 
 		 853 aa  625  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.462533 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2860  DNA mismatch repair protein MutS  43.69 
 
 		 853 aa  625  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3030  DNA mismatch repair protein MutS  43.81 
 
 		 860 aa  626  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  41.7 
 
 		 861 aa  625  1e-178  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2871  DNA mismatch repair protein MutS  43.81 
 
 		 853 aa  625  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  42.21 
 
 		 872 aa  623  1e-177  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3143  DNA mismatch repair protein MutS  43.69 
 
 		 853 aa  623  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1111  DNA mismatch repair protein MutS  42.75 
 
 		 922 aa  622  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.88674  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  41.92 
 
 		 859 aa  624  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  42.68 
 
 		 863 aa  623  1e-177  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  42.6 
 
 		 853 aa  621  1e-176  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  40.9 
 
 		 873 aa  620  1e-176  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  41.48 
 
 		 872 aa  620  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  41.6 
 
 		 874 aa  619  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  38.78 
 
 		 870 aa  619  1e-176  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  43.09 
 
 		 854 aa  618  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  41.87 
 
 		 861 aa  617  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  42.11 
 
 		 856 aa  618  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  42.22 
 
 		 855 aa  616  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  42.21 
 
 		 856 aa  619  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2691  DNA mismatch repair protein MutS  42.28 
 
 		 938 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0407651  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  42.09 
 
 		 856 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  43.31 
 
 		 859 aa  616  1e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1075  DNA mismatch repair protein MutS  43.24 
 
 		 916 aa  617  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835373  normal  0.410772 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  42.45 
 
 		 882 aa  618  1e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  42.44 
 
 		 880 aa  618  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  40.27 
 
 		 856 aa  616  1e-175  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  40.96 
 
 		 855 aa  613  9.999999999999999e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>