More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2226 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 956 aa  1869    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  38.58 
 
 		 896 aa  657    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0458  DNA mismatch repair protein MutS  54.11 
 
 		 865 aa  891    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143165  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  54.05 
 
 		 893 aa  892    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  56.98 
 
 		 917 aa  875    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0358  DNA mismatch repair protein MutS  54.39 
 
 		 918 aa  868    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.613152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  39.87 
 
 		 887 aa  632  1e-180  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  37.68 
 
 		 870 aa  634  1e-180  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  41.49 
 
 		 869 aa  622  1e-176  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  39.45 
 
 		 870 aa  614  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  43.03 
 
 		 871 aa  609  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  36.53 
 
 		 881 aa  611  1e-173  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  36.97 
 
 		 857 aa  607  9.999999999999999e-173  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  37.3 
 
 		 873 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  40.15 
 
 		 903 aa  605  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  38.25 
 
 		 900 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  36.83 
 
 		 932 aa  605  1.0000000000000001e-171  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  41.07 
 
 		 868 aa  605  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  36.69 
 
 		 867 aa  600  1e-170  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  38.02 
 
 		 860 aa  598  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  41.18 
 
 		 865 aa  597  1e-169  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  37.42 
 
 		 852 aa  596  1e-169  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0434  DNA mismatch repair protein MutS  43.59 
 
 		 853 aa  593  1e-168  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0558205  normal  0.0590484 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  40.25 
 
 		 872 aa  593  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  35.71 
 
 		 873 aa  592  1e-167  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  43.6 
 
 		 882 aa  587  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  38.19 
 
 		 897 aa  586  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  39.05 
 
 		 869 aa  587  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  39.94 
 
 		 872 aa  588  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  35.78 
 
 		 872 aa  582  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1520  DNA mismatch repair protein MutS  43.17 
 
 		 848 aa  583  1.0000000000000001e-165  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  35.78 
 
 		 872 aa  582  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  40.08 
 
 		 892 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  41.36 
 
 		 857 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  39.6 
 
 		 840 aa  580  1e-164  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  39.91 
 
 		 891 aa  577  1.0000000000000001e-163  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  34.74 
 
 		 910 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  35.34 
 
 		 910 aa  578  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  41.25 
 
 		 889 aa  578  1.0000000000000001e-163  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  42.81 
 
 		 863 aa  573  1.0000000000000001e-162  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  41.96 
 
 		 850 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  40.24 
 
 		 859 aa  572  1.0000000000000001e-162  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2101  DNA mismatch repair protein MutS  36.44 
 
 		 858 aa  571  1e-161  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  38.61 
 
 		 853 aa  570  1e-161  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  39.45 
 
 		 870 aa  572  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  37.59 
 
 		 863 aa  569  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  39.67 
 
 		 823 aa  566  1e-160  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  36.02 
 
 		 895 aa  567  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  40.19 
 
 		 872 aa  560  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  38.74 
 
 		 881 aa  559  1e-157  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  36.53 
 
 		 890 aa  558  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  36.11 
 
 		 868 aa  552  1e-156  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  36.45 
 
 		 890 aa  555  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  36.51 
 
 		 894 aa  554  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  42.36 
 
 		 872 aa  553  1e-156  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  36.27 
 
 		 892 aa  551  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  36.41 
 
 		 892 aa  550  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  36.37 
 
 		 892 aa  552  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  36.37 
 
 		 892 aa  552  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  36.28 
 
 		 890 aa  551  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  37.47 
 
 		 861 aa  549  1e-155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3224  DNA mismatch repair protein MutS  43.18 
 
 		 895 aa  546  1e-154  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  36.73 
 
 		 892 aa  548  1e-154  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  37.72 
 
 		 856 aa  548  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  38.92 
 
 		 871 aa  548  1e-154  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  36 
 
 		 892 aa  547  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  40.44 
 
 		 874 aa  546  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  37.72 
 
 		 856 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  37.6 
 
 		 856 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  38.63 
 
 		 875 aa  544  1e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  37.6 
 
 		 856 aa  543  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  37.72 
 
 		 856 aa  545  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1537  DNA mismatch repair protein MutS  45.05 
 
 		 880 aa  545  1e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  39.17 
 
 		 855 aa  543  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  39.69 
 
 		 837 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  39.88 
 
 		 854 aa  540  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1001  DNA mismatch repair protein MutS  38.07 
 
 		 819 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280502  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  37.51 
 
 		 882 aa  539  9.999999999999999e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  40.22 
 
 		 854 aa  542  9.999999999999999e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  39.01 
 
 		 861 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  36.28 
 
 		 854 aa  540  9.999999999999999e-153  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0366  DNA mismatch repair protein MutS  41.99 
 
 		 914 aa  538  1e-151  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0942134  normal  0.39879 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  38.91 
 
 		 873 aa  536  1e-151  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  37.08 
 
 		 887 aa  537  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  37.61 
 
 		 896 aa  536  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  41.15 
 
 		 855 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  38.89 
 
 		 861 aa  538  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  38.77 
 
 		 861 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  40.23 
 
 		 880 aa  538  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  39.1 
 
 		 868 aa  536  1e-151  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  41.1 
 
 		 855 aa  533  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  34.72 
 
 		 883 aa  533  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  35.19 
 
 		 868 aa  535  1e-150  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  35.34 
 
 		 858 aa  535  1e-150  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  35.93 
 
 		 828 aa  534  1e-150  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  38.51 
 
 		 901 aa  535  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  41.15 
 
 		 855 aa  535  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  40.56 
 
 		 859 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  38.33 
 
 		 859 aa  532  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  37.18 
 
 		 888 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>