More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_53969 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_53969  predicted protein  100 
 
 		 1423 aa  2961    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01708  protein required for mismatch repair in mitosis and meiosis (Eurofung)  32.41 
 
 		 1186 aa  315  2.9999999999999996e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81012  Mismatch repair ATPase MSH6 (MutS family)  33.92 
 
 		 1212 aa  308  6e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0833152 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40782  predicted protein  35.09 
 
 		 1113 aa  295  3e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.119207  normal  0.227387 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02590  mismatch repair-related protein, putative  32.75 
 
 		 1205 aa  263  1e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.102659  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  31.7 
 
 		 884 aa  258  5e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  31.7 
 
 		 884 aa  258  5e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2603  DNA mismatch repair protein MutS  30.99 
 
 		 891 aa  255  5.000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  31.52 
 
 		 828 aa  254  8.000000000000001e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  29.73 
 
 		 848 aa  251  7e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  30.67 
 
 		 863 aa  251  8e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  30.09 
 
 		 858 aa  249  2e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  29.88 
 
 		 861 aa  248  6e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49314  predicted protein  31.08 
 
 		 916 aa  247  9.999999999999999e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0725595  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  29.94 
 
 		 856 aa  247  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  31.62 
 
 		 904 aa  246  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  31.58 
 
 		 930 aa  246  3e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  30.16 
 
 		 856 aa  246  3e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  29.97 
 
 		 867 aa  245  3.9999999999999997e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  31.15 
 
 		 862 aa  243  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  31.95 
 
 		 865 aa  243  2e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0993  DNA mismatch repair protein MutS  30.5 
 
 		 882 aa  243  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0273389  normal  0.417331 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  30.19 
 
 		 871 aa  242  4e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1089  DNA mismatch repair protein MutS  30.34 
 
 		 882 aa  242  5e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  32.5 
 
 		 872 aa  240  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  30.62 
 
 		 880 aa  239  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  29.55 
 
 		 872 aa  239  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  29.61 
 
 		 854 aa  239  4e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1151  DNA mismatch repair protein MutS  30.03 
 
 		 882 aa  239  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75556  normal  0.534383 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01550  conserved hypothetical protein  31.05 
 
 		 1191 aa  239  4e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  31.67 
 
 		 910 aa  238  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  30.82 
 
 		 870 aa  238  6e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  29.55 
 
 		 858 aa  238  6e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1282  DNA mismatch repair protein MutS  29.42 
 
 		 862 aa  238  7e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  30.34 
 
 		 887 aa  238  7e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  36 
 
 		 868 aa  238  9e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  29.91 
 
 		 853 aa  237  1.0000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  30.13 
 
 		 859 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  30.48 
 
 		 861 aa  236  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1243  DNA mismatch repair protein MutS  29.46 
 
 		 926 aa  235  6e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.32952  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  30.96 
 
 		 886 aa  234  8.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  29.47 
 
 		 872 aa  234  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  31.08 
 
 		 872 aa  234  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2234  DNA mismatch repair protein MutS  30.82 
 
 		 894 aa  233  1e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.282824  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  31.35 
 
 		 855 aa  233  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  31.35 
 
 		 855 aa  233  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  36.96 
 
 		 860 aa  233  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0493  DNA mismatch repair protein MutS  30.78 
 
 		 915 aa  233  2e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.467736  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2691  DNA mismatch repair protein MutS  29.95 
 
 		 938 aa  233  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0407651  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  31.5 
 
 		 855 aa  233  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  31.16 
 
 		 859 aa  233  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3706  DNA mismatch repair protein MutS  35.96 
 
 		 1085 aa  232  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0191943 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0423  DNA mismatch repair protein MutS  31.87 
 
 		 883 aa  233  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  29.86 
 
 		 856 aa  232  3e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  28.44 
 
 		 840 aa  233  3e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  29.33 
 
 		 858 aa  232  4e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3145  DNA mismatch repair protein MutS  29.95 
 
 		 939 aa  232  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1446  DNA mismatch repair protein MutS  29.95 
 
 		 939 aa  232  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2173  DNA mismatch repair protein MutS  29.95 
 
 		 939 aa  232  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.01775  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  31.19 
 
 		 855 aa  232  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  30.99 
 
 		 896 aa  232  4e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1671  DNA mismatch repair protein MutS  29.95 
 
 		 891 aa  232  5e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2612  DNA mismatch repair protein MutS  29.95 
 
 		 939 aa  232  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  30.3 
 
 		 885 aa  231  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  31.19 
 
 		 855 aa  231  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  32.13 
 
 		 892 aa  231  7e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  30.77 
 
 		 893 aa  231  8e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  29.55 
 
 		 859 aa  231  9e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03749  DNA mismatch repair protein msh3 (MutS protein homolog 3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B6T1]  39.24 
 
 		 1091 aa  231  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.642565  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07480  DNA mismatch repair protein MSH2, putative  28.57 
 
 		 965 aa  231  1e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271772  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3531  DNA mismatch repair protein MutS  35.96 
 
 		 1088 aa  230  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  30.81 
 
 		 878 aa  230  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59113  predicted protein  29.83 
 
 		 910 aa  229  4e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  35.52 
 
 		 883 aa  228  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5394  DNA mismatch repair protein MutS  30.28 
 
 		 885 aa  229  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.597717  normal  0.74748 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0214  DNA mismatch repair protein MutS  29.37 
 
 		 851 aa  229  4e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.250019 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2284  DNA mismatch repair protein MutS  30.6 
 
 		 897 aa  229  4e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.339354  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1075  DNA mismatch repair protein MutS  30.46 
 
 		 916 aa  228  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835373  normal  0.410772 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  30.78 
 
 		 874 aa  228  9e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  30.54 
 
 		 862 aa  227  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1111  DNA mismatch repair protein MutS  30.85 
 
 		 922 aa  227  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.88674  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  30.83 
 
 		 853 aa  227  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  31 
 
 		 823 aa  226  2e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  29.45 
 
 		 868 aa  225  4.9999999999999996e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  29.14 
 
 		 852 aa  224  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3751  DNA mismatch repair protein MutS  32.29 
 
 		 855 aa  224  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  28.99 
 
 		 857 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  30.88 
 
 		 857 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  0.000000000609956 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0321  DNA mismatch repair protein MutS  31.41 
 
 		 923 aa  223  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.784021  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  35.59 
 
 		 861 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  30.15 
 
 		 917 aa  223  1.9999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4799  DNA mismatch repair protein MutS  32.22 
 
 		 896 aa  223  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.720607 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1617  DNA mismatch repair protein MutS  31.35 
 
 		 878 aa  223  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0490  DNA mismatch repair protein MutS  30.98 
 
 		 888 aa  222  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  30.88 
 
 		 880 aa  221  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  30.41 
 
 		 897 aa  221  5e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4649  DNA mismatch repair protein MutS  32.22 
 
 		 916 aa  222  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.427089 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  30.88 
 
 		 857 aa  221  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0614  DNA mismatch repair protein MutS  31.48 
 
 		 907 aa  221  6e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1299  DNA mismatch repair protein MutS  30.63 
 
 		 914 aa  221  7e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.141225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>