More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0321 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3466  DNA mismatch repair protein MutS  56.05 
 
 		 877 aa  877    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1299  DNA mismatch repair protein MutS  55.27 
 
 		 914 aa  974    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.141225  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0047  DNA mismatch repair protein MutS  60.35 
 
 		 908 aa  1025    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.967716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3599  DNA mismatch repair protein MutS  59.13 
 
 		 908 aa  963    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0190  DNA mismatch repair protein MutS  44.68 
 
 		 820 aa  710    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2655  DNA mismatch repair protein MutS  56.89 
 
 		 876 aa  897    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.607224  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0147  DNA mismatch repair protein MutS  59.93 
 
 		 910 aa  1023    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6533  DNA mismatch repair protein MutS  60.61 
 
 		 962 aa  952    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948742  normal  0.317969 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7642  DNA mismatch repair protein MutS  80.87 
 
 		 910 aa  1445    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.532158 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0423  DNA mismatch repair protein MutS  60.31 
 
 		 883 aa  1019    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0621  DNA mismatch repair protein MutS  60.02 
 
 		 905 aa  919    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.720679  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0260  DNA mismatch repair protein MutS  43.49 
 
 		 804 aa  712    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.76262  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0490  DNA mismatch repair protein MutS  81.99 
 
 		 888 aa  1432    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1218  DNA mismatch repair protein MutS  56.78 
 
 		 875 aa  900    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.318661  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2761  DNA mismatch repair protein MutS  49.73 
 
 		 904 aa  744    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0827  DNA mismatch repair protein MutS  56.46 
 
 		 878 aa  900    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0032  DNA mismatch repair protein MutS  60.22 
 
 		 880 aa  1013    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0513  DNA mismatch repair protein MutS  89.66 
 
 		 907 aa  1597    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3541  DNA mismatch repair protein MutS  57.73 
 
 		 929 aa  913    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  47.7 
 
 		 873 aa  671    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0528  DNA mismatch repair protein MutS  92.07 
 
 		 911 aa  1625    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0799066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3293  DNA mismatch repair protein MutS  48.66 
 
 		 858 aa  733    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0310827  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0824  DNA mismatch repair protein MutS  43.9 
 
 		 804 aa  711    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0209  DNA mismatch repair protein MutS  54.89 
 
 		 877 aa  878    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.784326 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0159  DNA mismatch repair protein MutS  59.93 
 
 		 910 aa  1030    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0363  DNA mismatch repair protein MutS  86.56 
 
 		 882 aa  1540    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1263  DNA mismatch repair protein MutS  57.48 
 
 		 919 aa  945    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0902404 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0321  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 923 aa  1835    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.784021  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0614  DNA mismatch repair protein MutS  82.26 
 
 		 907 aa  1483    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2326  DNA mismatch repair protein MutS  59.67 
 
 		 925 aa  943    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.160487 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0030  DNA mismatch repair protein MutS  60.74 
 
 		 915 aa  982    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355609 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4649  DNA mismatch repair protein MutS  60.88 
 
 		 916 aa  1011    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.427089 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2875  DNA mismatch repair protein MutS  55.69 
 
 		 879 aa  891    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.928835 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2791  DNA mismatch repair protein MutS  49.78 
 
 		 864 aa  728    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4031  DNA mismatch repair protein MutS  61.1 
 
 		 881 aa  1025    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137829  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2879  DNA mismatch repair protein MutS  56.67 
 
 		 880 aa  896    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0008  DNA mismatch repair protein MutS  52.23 
 
 		 904 aa  811    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4799  DNA mismatch repair protein MutS  61.3 
 
 		 896 aa  1003    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.720607 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3021  DNA mismatch repair protein MutS  53.2 
 
 		 897 aa  830    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4282  DNA mismatch repair protein MutS  61.08 
 
 		 916 aa  1007    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0035  DNA mismatch repair protein MutS  62.23 
 
 		 921 aa  1032    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0142  DNA mismatch repair protein MutS  59.93 
 
 		 898 aa  1023    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7101  DNA mismatch repair protein MutS  61.7 
 
 		 929 aa  959    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743761  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0913  DNA mismatch repair protein MutS  47.62 
 
 		 882 aa  635  1e-180  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  42.32 
 
 		 871 aa  622  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  42.54 
 
 		 868 aa  618  1e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  40.71 
 
 		 891 aa  615  9.999999999999999e-175  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  42.15 
 
 		 872 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  42.35 
 
 		 872 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  39.51 
 
 		 870 aa  607  9.999999999999999e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  39.16 
 
 		 873 aa  608  9.999999999999999e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  42.12 
 
 		 880 aa  604  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  42.84 
 
 		 898 aa  605  1.0000000000000001e-171  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  37.2 
 
 		 870 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0335  DNA mismatch repair protein MutS  41.47 
 
 		 815 aa  604  1.0000000000000001e-171  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.213975  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  39.74 
 
 		 932 aa  599  1e-170  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  41.66 
 
 		 863 aa  598  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  41.99 
 
 		 859 aa  595  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  39.76 
 
 		 859 aa  596  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  40.33 
 
 		 869 aa  597  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  40.77 
 
 		 870 aa  593  1e-168  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  37.77 
 
 		 869 aa  593  1e-168  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  39.35 
 
 		 900 aa  595  1e-168  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  39.65 
 
 		 862 aa  592  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  39.05 
 
 		 892 aa  589  1e-167  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  40.67 
 
 		 861 aa  592  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  40.13 
 
 		 861 aa  589  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  40.76 
 
 		 861 aa  589  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  40.83 
 
 		 859 aa  588  1e-166  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1619  DNA mismatch repair protein MutS  43.09 
 
 		 897 aa  587  1e-166  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.510747 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  37.39 
 
 		 887 aa  587  1e-166  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  40.8 
 
 		 855 aa  586  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  40.34 
 
 		 861 aa  587  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  41.23 
 
 		 872 aa  585  1.0000000000000001e-165  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  40.24 
 
 		 863 aa  585  1.0000000000000001e-165  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  37.08 
 
 		 896 aa  585  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  40.35 
 
 		 862 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  35.83 
 
 		 868 aa  582  1e-164  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  40.63 
 
 		 856 aa  580  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  39.56 
 
 		 872 aa  582  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  39.27 
 
 		 858 aa  581  1e-164  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  41.03 
 
 		 860 aa  581  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  39.38 
 
 		 853 aa  580  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  41.19 
 
 		 855 aa  581  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  40.13 
 
 		 881 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  40.4 
 
 		 856 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  41.07 
 
 		 884 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  41.07 
 
 		 884 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  40.43 
 
 		 856 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  39.91 
 
 		 859 aa  579  1.0000000000000001e-163  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  39.78 
 
 		 881 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  38.8 
 
 		 855 aa  574  1.0000000000000001e-162  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  38.54 
 
 		 928 aa  574  1.0000000000000001e-162  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  39.59 
 
 		 904 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  40.29 
 
 		 856 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  41.05 
 
 		 854 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2520  DNA mismatch repair protein MutS  41.01 
 
 		 894 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00821283  hitchhiker  0.000000391787 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  38.02 
 
 		 910 aa  574  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  38.06 
 
 		 910 aa  575  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  38.66 
 
 		 856 aa  575  1.0000000000000001e-162  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>