More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3293 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0147  DNA mismatch repair protein MutS  49.6 
 
 		 910 aa  759    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0142  DNA mismatch repair protein MutS  49.6 
 
 		 898 aa  759    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7101  DNA mismatch repair protein MutS  49.49 
 
 		 929 aa  681    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743761  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1263  DNA mismatch repair protein MutS  48.21 
 
 		 919 aa  711    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0902404 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2655  DNA mismatch repair protein MutS  51.89 
 
 		 876 aa  769    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.607224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0827  DNA mismatch repair protein MutS  50.57 
 
 		 878 aa  753    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0260  DNA mismatch repair protein MutS  42.36 
 
 		 804 aa  649    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.76262  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7642  DNA mismatch repair protein MutS  48.53 
 
 		 910 aa  725    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.532158 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0490  DNA mismatch repair protein MutS  49.27 
 
 		 888 aa  752    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1218  DNA mismatch repair protein MutS  51.49 
 
 		 875 aa  758    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.318661  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4282  DNA mismatch repair protein MutS  47.73 
 
 		 916 aa  701    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0008  DNA mismatch repair protein MutS  48.99 
 
 		 904 aa  716    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0047  DNA mismatch repair protein MutS  49.04 
 
 		 908 aa  743    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.967716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0159  DNA mismatch repair protein MutS  49.66 
 
 		 910 aa  776    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4649  DNA mismatch repair protein MutS  48.07 
 
 		 916 aa  712    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.427089 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3541  DNA mismatch repair protein MutS  52.41 
 
 		 929 aa  770    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0513  DNA mismatch repair protein MutS  48.98 
 
 		 907 aa  754    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2761  DNA mismatch repair protein MutS  68.6 
 
 		 904 aa  1065    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0528  DNA mismatch repair protein MutS  49.21 
 
 		 911 aa  749    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0799066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3293  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 858 aa  1699    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0310827  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0209  DNA mismatch repair protein MutS  49.83 
 
 		 877 aa  780    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.784326 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0030  DNA mismatch repair protein MutS  49.04 
 
 		 915 aa  715    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355609 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0363  DNA mismatch repair protein MutS  48.47 
 
 		 882 aa  742    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0035  DNA mismatch repair protein MutS  51.99 
 
 		 921 aa  753    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3466  DNA mismatch repair protein MutS  50.06 
 
 		 877 aa  752    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3599  DNA mismatch repair protein MutS  50.56 
 
 		 908 aa  755    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0321  DNA mismatch repair protein MutS  48.77 
 
 		 923 aa  736    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.784021  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0614  DNA mismatch repair protein MutS  48.24 
 
 		 907 aa  743    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2875  DNA mismatch repair protein MutS  48.06 
 
 		 879 aa  734    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.928835 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2791  DNA mismatch repair protein MutS  68.1 
 
 		 864 aa  1063    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4799  DNA mismatch repair protein MutS  48.3 
 
 		 896 aa  707    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.720607 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4031  DNA mismatch repair protein MutS  51.08 
 
 		 881 aa  773    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137829  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0032  DNA mismatch repair protein MutS  49.15 
 
 		 880 aa  746    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0423  DNA mismatch repair protein MutS  47.44 
 
 		 883 aa  733    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0621  DNA mismatch repair protein MutS  48.53 
 
 		 905 aa  675    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.720679  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3021  DNA mismatch repair protein MutS  50.06 
 
 		 897 aa  740    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2326  DNA mismatch repair protein MutS  48.09 
 
 		 925 aa  665    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.160487 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2879  DNA mismatch repair protein MutS  51.61 
 
 		 880 aa  757    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1299  DNA mismatch repair protein MutS  43.28 
 
 		 914 aa  692    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.141225  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6533  DNA mismatch repair protein MutS  48.83 
 
 		 962 aa  673    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948742  normal  0.317969 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0824  DNA mismatch repair protein MutS  41.49 
 
 		 804 aa  625  1e-178  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  47.12 
 
 		 873 aa  623  1e-177  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_002978  WD0190  DNA mismatch repair protein MutS  39.5 
 
 		 820 aa  617  1e-175  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0913  DNA mismatch repair protein MutS  45.98 
 
 		 882 aa  598  1e-169  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  42.63 
 
 		 868 aa  592  1e-168  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  40.05 
 
 		 863 aa  595  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  41.62 
 
 		 854 aa  589  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  41.51 
 
 		 851 aa  592  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  42.18 
 
 		 852 aa  588  1e-166  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  41.91 
 
 		 855 aa  587  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  42.41 
 
 		 857 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  0.000000000609956 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  42.53 
 
 		 857 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  42.53 
 
 		 857 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  43.6 
 
 		 854 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  42.17 
 
 		 859 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  40.44 
 
 		 862 aa  584  1.0000000000000001e-165  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  42.45 
 
 		 855 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  42.45 
 
 		 855 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3424  DNA mismatch repair protein MutS  40.49 
 
 		 851 aa  580  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  40.6 
 
 		 851 aa  580  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  42.41 
 
 		 880 aa  581  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  40.6 
 
 		 851 aa  579  1e-164  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  40.95 
 
 		 854 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  39.84 
 
 		 853 aa  572  1.0000000000000001e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  42.13 
 
 		 855 aa  573  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1146  DNA mismatch repair protein MutS  42.32 
 
 		 858 aa  575  1.0000000000000001e-162  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  41.22 
 
 		 860 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  40.72 
 
 		 884 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  40.72 
 
 		 884 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1282  DNA mismatch repair protein MutS  44.87 
 
 		 862 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  41.16 
 
 		 872 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  41.14 
 
 		 854 aa  572  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  39.45 
 
 		 853 aa  570  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  41.56 
 
 		 871 aa  566  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  40.45 
 
 		 874 aa  562  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2860  DNA mismatch repair protein MutS  40.42 
 
 		 853 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  39.95 
 
 		 855 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3030  DNA mismatch repair protein MutS  39.95 
 
 		 860 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  41.24 
 
 		 872 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  39.61 
 
 		 871 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  39.64 
 
 		 881 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  39.95 
 
 		 855 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  39.95 
 
 		 855 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  40.58 
 
 		 853 aa  565  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  39.95 
 
 		 855 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  41.11 
 
 		 860 aa  559  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  39.77 
 
 		 891 aa  560  1e-158  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1913  DNA mismatch repair protein MutS  41.43 
 
 		 893 aa  562  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.396246  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  39.84 
 
 		 855 aa  562  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3986  DNA mismatch repair protein MutS  40.19 
 
 		 853 aa  561  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.724345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2612  DNA mismatch repair protein MutS  41.5 
 
 		 939 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  42.59 
 
 		 878 aa  562  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0955  DNA mismatch repair protein MutS  40.19 
 
 		 853 aa  558  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1657  DNA mismatch repair protein MutS  44.14 
 
 		 868 aa  556  1e-157  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3145  DNA mismatch repair protein MutS  41.38 
 
 		 939 aa  557  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1671  DNA mismatch repair protein MutS  41.38 
 
 		 891 aa  557  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207117  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2871  DNA mismatch repair protein MutS  40.19 
 
 		 853 aa  558  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  39.1 
 
 		 856 aa  558  1e-157  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1446  DNA mismatch repair protein MutS  41.38 
 
 		 939 aa  557  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0979  DNA mismatch repair protein MutS  40.19 
 
 		 853 aa  558  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.462533 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>