More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1263 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0008  DNA mismatch repair protein MutS  49.19 
 
 		 904 aa  767    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1263  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 919 aa  1830    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0902404 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0032  DNA mismatch repair protein MutS  55.98 
 
 		 880 aa  893    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3466  DNA mismatch repair protein MutS  51.73 
 
 		 877 aa  788    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  46.78 
 
 		 873 aa  637    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6533  DNA mismatch repair protein MutS  56.71 
 
 		 962 aa  895    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948742  normal  0.317969 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0159  DNA mismatch repair protein MutS  53.65 
 
 		 910 aa  913    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0147  DNA mismatch repair protein MutS  54.28 
 
 		 910 aa  911    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0513  DNA mismatch repair protein MutS  57.45 
 
 		 907 aa  952    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0423  DNA mismatch repair protein MutS  54.58 
 
 		 883 aa  892    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0035  DNA mismatch repair protein MutS  55.75 
 
 		 921 aa  899    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7101  DNA mismatch repair protein MutS  58.46 
 
 		 929 aa  893    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743761  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0047  DNA mismatch repair protein MutS  55.8 
 
 		 908 aa  902    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.967716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3599  DNA mismatch repair protein MutS  54.26 
 
 		 908 aa  882    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0490  DNA mismatch repair protein MutS  56.89 
 
 		 888 aa  922    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1218  DNA mismatch repair protein MutS  51.17 
 
 		 875 aa  761    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.318661  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4282  DNA mismatch repair protein MutS  58.06 
 
 		 916 aa  932    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4649  DNA mismatch repair protein MutS  58.06 
 
 		 916 aa  934    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.427089 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2655  DNA mismatch repair protein MutS  51.57 
 
 		 876 aa  769    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.607224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3541  DNA mismatch repair protein MutS  53.68 
 
 		 929 aa  813    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0528  DNA mismatch repair protein MutS  58.32 
 
 		 911 aa  938    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0799066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3293  DNA mismatch repair protein MutS  47.87 
 
 		 858 aa  702    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0310827  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0209  DNA mismatch repair protein MutS  51.34 
 
 		 877 aa  803    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.784326 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0363  DNA mismatch repair protein MutS  56.94 
 
 		 882 aa  943    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2761  DNA mismatch repair protein MutS  49.89 
 
 		 904 aa  713    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0321  DNA mismatch repair protein MutS  57.38 
 
 		 923 aa  942    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.784021  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0614  DNA mismatch repair protein MutS  56.26 
 
 		 907 aa  952    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0827  DNA mismatch repair protein MutS  52.27 
 
 		 878 aa  804    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2875  DNA mismatch repair protein MutS  51.51 
 
 		 879 aa  818    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.928835 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2791  DNA mismatch repair protein MutS  46.58 
 
 		 864 aa  664    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4031  DNA mismatch repair protein MutS  54.51 
 
 		 881 aa  880    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137829  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1299  DNA mismatch repair protein MutS  51.74 
 
 		 914 aa  913    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.141225  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0030  DNA mismatch repair protein MutS  54.3 
 
 		 915 aa  865    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355609 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0913  DNA mismatch repair protein MutS  47.2 
 
 		 882 aa  654    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3021  DNA mismatch repair protein MutS  48.75 
 
 		 897 aa  723    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4799  DNA mismatch repair protein MutS  57.95 
 
 		 896 aa  924    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.720607 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2326  DNA mismatch repair protein MutS  63.47 
 
 		 925 aa  1018    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.160487 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2879  DNA mismatch repair protein MutS  51.06 
 
 		 880 aa  758    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0621  DNA mismatch repair protein MutS  57.67 
 
 		 905 aa  872    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.720679  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7642  DNA mismatch repair protein MutS  56.41 
 
 		 910 aa  949    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.532158 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0142  DNA mismatch repair protein MutS  54.28 
 
 		 898 aa  914    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0190  DNA mismatch repair protein MutS  40.87 
 
 		 820 aa  634  1e-180  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0260  DNA mismatch repair protein MutS  40.93 
 
 		 804 aa  631  1e-179  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.76262  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0824  DNA mismatch repair protein MutS  40.79 
 
 		 804 aa  627  1e-178  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  41.92 
 
 		 868 aa  605  9.999999999999999e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  41.31 
 
 		 863 aa  587  1e-166  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1619  DNA mismatch repair protein MutS  41.75 
 
 		 897 aa  581  1e-164  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.510747 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1282  DNA mismatch repair protein MutS  44.18 
 
 		 862 aa  580  1e-164  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  40.98 
 
 		 881 aa  574  1.0000000000000001e-162  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  39.91 
 
 		 870 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  40.09 
 
 		 863 aa  573  1.0000000000000001e-162  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  40.35 
 
 		 855 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2691  DNA mismatch repair protein MutS  41.74 
 
 		 938 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0407651  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  39.27 
 
 		 891 aa  572  1e-161  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  41.04 
 
 		 855 aa  570  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  41.33 
 
 		 859 aa  569  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1075  DNA mismatch repair protein MutS  41.29 
 
 		 916 aa  569  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835373  normal  0.410772 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1146  DNA mismatch repair protein MutS  40.79 
 
 		 858 aa  571  1e-161  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  40.35 
 
 		 855 aa  569  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  37.79 
 
 		 869 aa  568  1e-160  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2173  DNA mismatch repair protein MutS  41.46 
 
 		 939 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.01775  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1446  DNA mismatch repair protein MutS  41.46 
 
 		 939 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1671  DNA mismatch repair protein MutS  41.46 
 
 		 891 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207117  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1111  DNA mismatch repair protein MutS  40.96 
 
 		 922 aa  566  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.88674  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3145  DNA mismatch repair protein MutS  41.46 
 
 		 939 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  39.78 
 
 		 859 aa  566  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  39.8 
 
 		 855 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1166  DNA mismatch repair protein MutS  40.37 
 
 		 863 aa  565  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  39.6 
 
 		 855 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  40.67 
 
 		 851 aa  562  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2559  DNA mismatch repair protein MutS  41.44 
 
 		 891 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  39.71 
 
 		 855 aa  565  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1913  DNA mismatch repair protein MutS  40.77 
 
 		 893 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.396246  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2612  DNA mismatch repair protein MutS  41.46 
 
 		 939 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  39.43 
 
 		 858 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  39.71 
 
 		 855 aa  565  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3030  DNA mismatch repair protein MutS  39.96 
 
 		 860 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  39.71 
 
 		 855 aa  565  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  41.43 
 
 		 878 aa  563  1.0000000000000001e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  39.71 
 
 		 855 aa  565  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02583  DNA mismatch repair protein  39.96 
 
 		 853 aa  560  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.858461  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0955  DNA mismatch repair protein MutS  39.96 
 
 		 853 aa  560  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  39.31 
 
 		 853 aa  559  1e-158  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0979  DNA mismatch repair protein MutS  39.96 
 
 		 853 aa  560  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.462533 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  38.72 
 
 		 856 aa  561  1e-158  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  39.93 
 
 		 857 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  0.000000000609956 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  39.31 
 
 		 884 aa  562  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  39.31 
 
 		 884 aa  562  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2871  DNA mismatch repair protein MutS  39.96 
 
 		 853 aa  560  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3986  DNA mismatch repair protein MutS  39.96 
 
 		 853 aa  561  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.724345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  38.39 
 
 		 856 aa  559  1e-158  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3143  DNA mismatch repair protein MutS  39.96 
 
 		 853 aa  560  1e-158  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2860  DNA mismatch repair protein MutS  40.07 
 
 		 853 aa  562  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02548  hypothetical protein  39.96 
 
 		 853 aa  560  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766489  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  39.82 
 
 		 857 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  39.82 
 
 		 857 aa  558  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  39.72 
 
 		 859 aa  558  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  39.87 
 
 		 872 aa  556  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  37.85 
 
 		 873 aa  557  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  39.1 
 
 		 859 aa  557  1e-157  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>