More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6533 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0047  DNA mismatch repair protein MutS  59.06 
 
 		 908 aa  968    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.967716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6533  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 962 aa  1878    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948742  normal  0.317969 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0030  DNA mismatch repair protein MutS  58.84 
 
 		 915 aa  935    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355609 
 
 
-
 
NC_002978  WD0190  DNA mismatch repair protein MutS  41.38 
 
 		 820 aa  671    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2761  DNA mismatch repair protein MutS  50.33 
 
 		 904 aa  727    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7101  DNA mismatch repair protein MutS  88.95 
 
 		 929 aa  1476    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743761  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0147  DNA mismatch repair protein MutS  57.87 
 
 		 910 aa  976    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1263  DNA mismatch repair protein MutS  56.71 
 
 		 919 aa  941    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0902404 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2655  DNA mismatch repair protein MutS  55.08 
 
 		 876 aa  821    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.607224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0035  DNA mismatch repair protein MutS  61.06 
 
 		 921 aa  982    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0423  DNA mismatch repair protein MutS  58.84 
 
 		 883 aa  984    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0827  DNA mismatch repair protein MutS  54.73 
 
 		 878 aa  823    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1299  DNA mismatch repair protein MutS  52.99 
 
 		 914 aa  940    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.141225  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3466  DNA mismatch repair protein MutS  53.95 
 
 		 877 aa  821    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0260  DNA mismatch repair protein MutS  40.29 
 
 		 804 aa  663    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.76262  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4799  DNA mismatch repair protein MutS  71.93 
 
 		 896 aa  1193    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.720607 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0490  DNA mismatch repair protein MutS  61.23 
 
 		 888 aa  1005    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0159  DNA mismatch repair protein MutS  57.51 
 
 		 910 aa  966    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1218  DNA mismatch repair protein MutS  54.59 
 
 		 875 aa  828    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.318661  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0621  DNA mismatch repair protein MutS  70.99 
 
 		 905 aa  1125    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.720679  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0008  DNA mismatch repair protein MutS  50.82 
 
 		 904 aa  786    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4282  DNA mismatch repair protein MutS  72.15 
 
 		 916 aa  1200    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3541  DNA mismatch repair protein MutS  55.49 
 
 		 929 aa  834    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0528  DNA mismatch repair protein MutS  60.04 
 
 		 911 aa  1000    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0799066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3293  DNA mismatch repair protein MutS  48.94 
 
 		 858 aa  715    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0310827  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0824  DNA mismatch repair protein MutS  40.74 
 
 		 804 aa  665    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0209  DNA mismatch repair protein MutS  51.49 
 
 		 877 aa  810    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.784326 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0363  DNA mismatch repair protein MutS  60.89 
 
 		 882 aa  1018    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0513  DNA mismatch repair protein MutS  60.38 
 
 		 907 aa  1015    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0032  DNA mismatch repair protein MutS  59.18 
 
 		 880 aa  966    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0321  DNA mismatch repair protein MutS  60.5 
 
 		 923 aa  1009    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.784021  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  49.39 
 
 		 873 aa  691    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0614  DNA mismatch repair protein MutS  59.69 
 
 		 907 aa  1019    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2326  DNA mismatch repair protein MutS  59.87 
 
 		 925 aa  962    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.160487 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2875  DNA mismatch repair protein MutS  52.65 
 
 		 879 aa  829    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.928835 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2791  DNA mismatch repair protein MutS  49.67 
 
 		 864 aa  720    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3599  DNA mismatch repair protein MutS  57.82 
 
 		 908 aa  920    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4031  DNA mismatch repair protein MutS  59.64 
 
 		 881 aa  962    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137829  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0142  DNA mismatch repair protein MutS  57.87 
 
 		 898 aa  975    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7642  DNA mismatch repair protein MutS  57.16 
 
 		 910 aa  962    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.532158 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4649  DNA mismatch repair protein MutS  71.82 
 
 		 916 aa  1198    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.427089 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2879  DNA mismatch repair protein MutS  54.48 
 
 		 880 aa  824    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3021  DNA mismatch repair protein MutS  51.73 
 
 		 897 aa  792    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0913  DNA mismatch repair protein MutS  48 
 
 		 882 aa  632  1e-180  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  42.14 
 
 		 868 aa  620  1e-176  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  41.09 
 
 		 869 aa  619  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  40.39 
 
 		 870 aa  610  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  39.59 
 
 		 891 aa  606  9.999999999999999e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  41.43 
 
 		 872 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0335  DNA mismatch repair protein MutS  40.12 
 
 		 815 aa  604  1.0000000000000001e-171  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.213975  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  42.03 
 
 		 880 aa  600  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1619  DNA mismatch repair protein MutS  43.25 
 
 		 897 aa  597  1e-169  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.510747 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  40.24 
 
 		 859 aa  596  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  41.32 
 
 		 871 aa  595  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  39.41 
 
 		 872 aa  593  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  42.02 
 
 		 863 aa  593  1e-168  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  40.46 
 
 		 870 aa  594  1e-168  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  41.13 
 
 		 854 aa  587  1e-166  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  37.53 
 
 		 869 aa  587  1e-166  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  40.07 
 
 		 872 aa  587  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  41.72 
 
 		 855 aa  584  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  39.76 
 
 		 856 aa  582  1.0000000000000001e-165  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  41.04 
 
 		 854 aa  585  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1282  DNA mismatch repair protein MutS  44.12 
 
 		 862 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  40.31 
 
 		 861 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  40.8 
 
 		 854 aa  579  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  38.43 
 
 		 871 aa  582  1e-164  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  43.17 
 
 		 854 aa  579  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  38.32 
 
 		 859 aa  581  1e-164  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  39.85 
 
 		 883 aa  582  1e-164  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  40.31 
 
 		 861 aa  580  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  40.07 
 
 		 896 aa  582  1e-164  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  38.98 
 
 		 863 aa  578  1.0000000000000001e-163  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  39.16 
 
 		 853 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  40.8 
 
 		 854 aa  579  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  40.96 
 
 		 904 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  41.18 
 
 		 852 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  40.2 
 
 		 861 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  42.34 
 
 		 878 aa  576  1.0000000000000001e-163  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  40.29 
 
 		 855 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  39.93 
 
 		 862 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  40.31 
 
 		 856 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  39.67 
 
 		 853 aa  573  1.0000000000000001e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  39.78 
 
 		 859 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  39.76 
 
 		 856 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  39.78 
 
 		 856 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  38.91 
 
 		 855 aa  575  1.0000000000000001e-162  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  39.98 
 
 		 856 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  40 
 
 		 851 aa  574  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  39.05 
 
 		 853 aa  572  1.0000000000000001e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  37.57 
 
 		 932 aa  571  1e-161  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  39.98 
 
 		 856 aa  572  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2247  DNA mismatch repair protein MutS  44.8 
 
 		 882 aa  570  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136567  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  39.27 
 
 		 887 aa  570  1e-161  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  39.87 
 
 		 856 aa  572  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  38.96 
 
 		 889 aa  572  1e-161  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  39.74 
 
 		 851 aa  567  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  40.02 
 
 		 881 aa  568  1e-160  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  38.3 
 
 		 892 aa  567  1e-160  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  39.24 
 
 		 858 aa  568  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>