More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0190 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2655  DNA mismatch repair protein MutS  44.38 
 
 
876 aa  687    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.607224  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0030  DNA mismatch repair protein MutS  44.62 
 
 
915 aa  692    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355609 
 
 
-
 
NC_002978  WD0190  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 
820 aa  1679    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0147  DNA mismatch repair protein MutS  43.42 
 
 
910 aa  730    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0159  DNA mismatch repair protein MutS  43.06 
 
 
910 aa  729    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0032  DNA mismatch repair protein MutS  43.67 
 
 
880 aa  696    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4649  DNA mismatch repair protein MutS  43.4 
 
 
916 aa  664    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.427089 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3599  DNA mismatch repair protein MutS  46.08 
 
 
908 aa  738    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0035  DNA mismatch repair protein MutS  44.21 
 
 
921 aa  697    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4282  DNA mismatch repair protein MutS  43.28 
 
 
916 aa  666    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0047  DNA mismatch repair protein MutS  43.25 
 
 
908 aa  692    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.967716  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0260  DNA mismatch repair protein MutS  61 
 
 
804 aa  1025    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.76262  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2879  DNA mismatch repair protein MutS  44.26 
 
 
880 aa  695    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0490  DNA mismatch repair protein MutS  43.82 
 
 
888 aa  698    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0008  DNA mismatch repair protein MutS  41.77 
 
 
904 aa  649    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1218  DNA mismatch repair protein MutS  44.38 
 
 
875 aa  697    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.318661  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3466  DNA mismatch repair protein MutS  45.03 
 
 
877 aa  719    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3541  DNA mismatch repair protein MutS  46.99 
 
 
929 aa  730    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0528  DNA mismatch repair protein MutS  44.91 
 
 
911 aa  706    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0799066  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0142  DNA mismatch repair protein MutS  43.3 
 
 
898 aa  728    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0335  DNA mismatch repair protein MutS  43.97 
 
 
815 aa  709    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.213975  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0824  DNA mismatch repair protein MutS  59.78 
 
 
804 aa  1015    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0209  DNA mismatch repair protein MutS  43.42 
 
 
877 aa  686    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.784326 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0423  DNA mismatch repair protein MutS  43.82 
 
 
883 aa  716    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0363  DNA mismatch repair protein MutS  44.08 
 
 
882 aa  713    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0827  DNA mismatch repair protein MutS  44.14 
 
 
878 aa  702    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133627  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0321  DNA mismatch repair protein MutS  44.68 
 
 
923 aa  704    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.784021  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0614  DNA mismatch repair protein MutS  43.96 
 
 
907 aa  714    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1299  DNA mismatch repair protein MutS  43.84 
 
 
914 aa  705    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.141225  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7642  DNA mismatch repair protein MutS  44.85 
 
 
910 aa  708    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.532158 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2875  DNA mismatch repair protein MutS  44.4 
 
 
879 aa  730    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.928835 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4031  DNA mismatch repair protein MutS  44.06 
 
 
881 aa  722    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137829  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2326  DNA mismatch repair protein MutS  43.2 
 
 
925 aa  637    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.160487 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0621  DNA mismatch repair protein MutS  43.45 
 
 
905 aa  649    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.720679  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3021  DNA mismatch repair protein MutS  43.06 
 
 
897 aa  664    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4799  DNA mismatch repair protein MutS  43.69 
 
 
896 aa  673    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.720607 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0513  DNA mismatch repair protein MutS  45.33 
 
 
907 aa  723    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7101  DNA mismatch repair protein MutS  41.86 
 
 
929 aa  631  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743761  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1263  DNA mismatch repair protein MutS  40.75 
 
 
919 aa  626  1e-178  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0902404 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2791  DNA mismatch repair protein MutS  41.51 
 
 
864 aa  628  1e-178  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6533  DNA mismatch repair protein MutS  41.38 
 
 
962 aa  625  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948742  normal  0.317969 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2761  DNA mismatch repair protein MutS  41.1 
 
 
904 aa  625  1e-177  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572948  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  42.1 
 
 
868 aa  619  1e-176  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3293  DNA mismatch repair protein MutS  39.5 
 
 
858 aa  613  9.999999999999999e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0310827  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  40.57 
 
 
870 aa  610  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  40.29 
 
 
871 aa  605  1.0000000000000001e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  40.5 
 
 
869 aa  600  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  40.1 
 
 
869 aa  600  1e-170  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  39.9 
 
 
870 aa  595  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  39.5 
 
 
872 aa  593  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  40.26 
 
 
904 aa  591  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  39.88 
 
 
891 aa  591  1e-167  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  39.55 
 
 
932 aa  586  1e-166  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  40.83 
 
 
896 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  39.64 
 
 
867 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  39.67 
 
 
873 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  38.71 
 
 
870 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  39.33 
 
 
862 aa  580  1e-164  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  40.12 
 
 
863 aa  580  1e-164  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  38.32 
 
 
889 aa  581  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  40.89 
 
 
853 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  39.19 
 
 
910 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  38.86 
 
 
881 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  38.42 
 
 
872 aa  571  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  38.56 
 
 
887 aa  569  1e-161  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  37.72 
 
 
872 aa  569  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1181  DNA mismatch repair protein MutS  40.17 
 
 
927 aa  566  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  38.82 
 
 
863 aa  566  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  38.86 
 
 
863 aa  566  1e-160  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  39.12 
 
 
897 aa  567  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  38.19 
 
 
858 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  38.81 
 
 
863 aa  564  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  38.07 
 
 
859 aa  560  1e-158  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  38.94 
 
 
882 aa  556  1e-157  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  38.43 
 
 
858 aa  555  1e-156  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  38.12 
 
 
855 aa  555  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  38 
 
 
855 aa  554  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  38.28 
 
 
860 aa  555  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  38.85 
 
 
900 aa  555  1e-156  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  38.12 
 
 
855 aa  555  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  38.12 
 
 
855 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  39.39 
 
 
884 aa  555  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  39.39 
 
 
884 aa  555  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  38.48 
 
 
852 aa  553  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  38.01 
 
 
896 aa  553  1e-156  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  38.12 
 
 
855 aa  555  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  37 
 
 
874 aa  553  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  38.24 
 
 
854 aa  551  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  37.57 
 
 
880 aa  550  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  36.9 
 
 
928 aa  549  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  40.12 
 
 
828 aa  551  1e-155  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  38.21 
 
 
859 aa  549  1e-155  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  37.71 
 
 
858 aa  549  1e-155  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  37.99 
 
 
895 aa  549  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  37.44 
 
 
856 aa  548  1e-154  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  36.81 
 
 
873 aa  545  1e-154  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  38.33 
 
 
871 aa  548  1e-154  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  39.09 
 
 
910 aa  546  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  37.49 
 
 
882 aa  546  1e-154  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  37.94 
 
 
857 aa  544  1e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>