More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0335 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0190  DNA mismatch repair protein MutS  43.97 
 
 
820 aa  703    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0260  DNA mismatch repair protein MutS  44.03 
 
 
804 aa  676    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.76262  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0335  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 
815 aa  1678    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.213975  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0824  DNA mismatch repair protein MutS  44.47 
 
 
804 aa  680    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3599  DNA mismatch repair protein MutS  42.84 
 
 
908 aa  631  1e-179  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0147  DNA mismatch repair protein MutS  41.51 
 
 
910 aa  627  1e-178  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0159  DNA mismatch repair protein MutS  40.95 
 
 
910 aa  627  1e-178  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4031  DNA mismatch repair protein MutS  42.63 
 
 
881 aa  627  1e-178  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137829  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0142  DNA mismatch repair protein MutS  41.39 
 
 
898 aa  625  1e-178  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3541  DNA mismatch repair protein MutS  43.54 
 
 
929 aa  622  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0513  DNA mismatch repair protein MutS  42.67 
 
 
907 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0047  DNA mismatch repair protein MutS  42.89 
 
 
908 aa  619  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.967716  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0363  DNA mismatch repair protein MutS  42.07 
 
 
882 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0423  DNA mismatch repair protein MutS  42.54 
 
 
883 aa  616  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0614  DNA mismatch repair protein MutS  41.37 
 
 
907 aa  619  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0827  DNA mismatch repair protein MutS  42.63 
 
 
878 aa  618  1e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133627  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0032  DNA mismatch repair protein MutS  42.51 
 
 
880 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1299  DNA mismatch repair protein MutS  41.09 
 
 
914 aa  606  9.999999999999999e-173  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.141225  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0528  DNA mismatch repair protein MutS  41.16 
 
 
911 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0799066  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2875  DNA mismatch repair protein MutS  41.47 
 
 
879 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.928835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7642  DNA mismatch repair protein MutS  42.03 
 
 
910 aa  601  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.532158 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4799  DNA mismatch repair protein MutS  41.77 
 
 
896 aa  599  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.720607 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0035  DNA mismatch repair protein MutS  41.95 
 
 
921 aa  602  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4649  DNA mismatch repair protein MutS  41.49 
 
 
916 aa  596  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.427089 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0209  DNA mismatch repair protein MutS  42.29 
 
 
877 aa  597  1e-169  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.784326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4282  DNA mismatch repair protein MutS  41.37 
 
 
916 aa  595  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0321  DNA mismatch repair protein MutS  41.47 
 
 
923 aa  595  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.784021  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0030  DNA mismatch repair protein MutS  42.33 
 
 
915 aa  589  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355609 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0490  DNA mismatch repair protein MutS  41.38 
 
 
888 aa  588  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3466  DNA mismatch repair protein MutS  41.47 
 
 
877 aa  585  1.0000000000000001e-165  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2326  DNA mismatch repair protein MutS  41.21 
 
 
925 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.160487 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0621  DNA mismatch repair protein MutS  41.18 
 
 
905 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.720679  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2655  DNA mismatch repair protein MutS  42.33 
 
 
876 aa  562  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.607224  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2879  DNA mismatch repair protein MutS  41.76 
 
 
880 aa  559  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1218  DNA mismatch repair protein MutS  41.88 
 
 
875 aa  560  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.318661  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  40.88 
 
 
871 aa  558  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6533  DNA mismatch repair protein MutS  40.12 
 
 
962 aa  556  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948742  normal  0.317969 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  40.52 
 
 
869 aa  554  1e-156  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7101  DNA mismatch repair protein MutS  39.85 
 
 
929 aa  549  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743761  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  38.86 
 
 
870 aa  551  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0008  DNA mismatch repair protein MutS  38.18 
 
 
904 aa  542  1e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  40.2 
 
 
872 aa  543  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  40.45 
 
 
881 aa  545  1e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  40.52 
 
 
869 aa  545  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  39.75 
 
 
863 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  40.66 
 
 
862 aa  536  1e-151  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1263  DNA mismatch repair protein MutS  38.55 
 
 
919 aa  537  1e-151  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0902404 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  38.96 
 
 
858 aa  536  1e-151  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3021  DNA mismatch repair protein MutS  38.71 
 
 
897 aa  536  1e-151  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  38.77 
 
 
891 aa  535  1e-150  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  39.43 
 
 
870 aa  533  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  39.88 
 
 
873 aa  532  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  38.33 
 
 
887 aa  535  1e-150  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  39.18 
 
 
878 aa  531  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  39.44 
 
 
872 aa  529  1e-149  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  38.1 
 
 
872 aa  530  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  39.06 
 
 
828 aa  531  1e-149  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  38.61 
 
 
889 aa  529  1e-149  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  38.96 
 
 
858 aa  526  1e-148  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  38.61 
 
 
868 aa  529  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  39.01 
 
 
900 aa  526  1e-148  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  39.1 
 
 
882 aa  526  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  39.2 
 
 
857 aa  528  1e-148  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  39.27 
 
 
858 aa  524  1e-147  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  38.26 
 
 
904 aa  522  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  37.47 
 
 
870 aa  524  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  38.21 
 
 
853 aa  525  1e-147  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  37.76 
 
 
867 aa  525  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  38.01 
 
 
873 aa  520  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  39.12 
 
 
896 aa  520  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  37.76 
 
 
855 aa  521  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  38.71 
 
 
872 aa  522  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  39.73 
 
 
868 aa  522  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  38.93 
 
 
882 aa  518  1.0000000000000001e-145  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0913  DNA mismatch repair protein MutS  37.91 
 
 
882 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  37.16 
 
 
848 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3293  DNA mismatch repair protein MutS  37.97 
 
 
858 aa  517  1.0000000000000001e-145  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0310827  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  37.56 
 
 
864 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  38.2 
 
 
868 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2761  DNA mismatch repair protein MutS  38.34 
 
 
904 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572948  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  37.84 
 
 
932 aa  513  1e-144  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  37.27 
 
 
886 aa  513  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  36.86 
 
 
869 aa  514  1e-144  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  39.19 
 
 
872 aa  515  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0214  DNA mismatch repair protein MutS  37.88 
 
 
851 aa  513  1e-144  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.250019 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  39.24 
 
 
859 aa  514  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  38.41 
 
 
875 aa  514  1e-144  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0174  DNA mismatch repair protein MutS  37.94 
 
 
820 aa  509  1e-143  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  37.88 
 
 
891 aa  509  1e-143  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  38.09 
 
 
871 aa  509  1e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  37.81 
 
 
896 aa  512  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  38.25 
 
 
892 aa  511  1e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  38.44 
 
 
872 aa  509  1e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2791  DNA mismatch repair protein MutS  36.45 
 
 
864 aa  511  1e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2234  DNA mismatch repair protein MutS  37.25 
 
 
894 aa  511  1e-143  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.282824  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  37.14 
 
 
910 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  37.32 
 
 
910 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  38.74 
 
 
874 aa  505  1e-141  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  36.38 
 
 
928 aa  505  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  39.11 
 
 
823 aa  503  1e-141  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>