More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0299 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3599  DNA mismatch repair protein MutS  50.77 
 
 		 908 aa  718    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0513  DNA mismatch repair protein MutS  48.36 
 
 		 907 aa  682    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4649  DNA mismatch repair protein MutS  48.82 
 
 		 916 aa  700    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.427089 
 
 
-
 
NC_004310  BR0147  DNA mismatch repair protein MutS  49.16 
 
 		 910 aa  738    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0035  DNA mismatch repair protein MutS  51.86 
 
 		 921 aa  726    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0827  DNA mismatch repair protein MutS  50.23 
 
 		 878 aa  686    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0490  DNA mismatch repair protein MutS  48.54 
 
 		 888 aa  693    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7642  DNA mismatch repair protein MutS  46.86 
 
 		 910 aa  684    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.532158 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1218  DNA mismatch repair protein MutS  48.59 
 
 		 875 aa  655    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.318661  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1299  DNA mismatch repair protein MutS  44.28 
 
 		 914 aa  687    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.141225  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0047  DNA mismatch repair protein MutS  48.55 
 
 		 908 aa  682    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.967716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7101  DNA mismatch repair protein MutS  48.87 
 
 		 929 aa  650    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743761  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2879  DNA mismatch repair protein MutS  48.82 
 
 		 880 aa  655    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1263  DNA mismatch repair protein MutS  47.01 
 
 		 919 aa  657    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0902404 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3541  DNA mismatch repair protein MutS  50.51 
 
 		 929 aa  692    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2326  DNA mismatch repair protein MutS  46.93 
 
 		 925 aa  640    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.160487 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0528  DNA mismatch repair protein MutS  48.65 
 
 		 911 aa  695    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0799066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3293  DNA mismatch repair protein MutS  47.07 
 
 		 858 aa  635    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0310827  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0032  DNA mismatch repair protein MutS  48.32 
 
 		 880 aa  689    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0209  DNA mismatch repair protein MutS  48.18 
 
 		 877 aa  686    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.784326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4282  DNA mismatch repair protein MutS  49.26 
 
 		 916 aa  701    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0363  DNA mismatch repair protein MutS  48.65 
 
 		 882 aa  688    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0423  DNA mismatch repair protein MutS  48.47 
 
 		 883 aa  689    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2655  DNA mismatch repair protein MutS  48.42 
 
 		 876 aa  655    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.607224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0913  DNA mismatch repair protein MutS  58.55 
 
 		 882 aa  885    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0008  DNA mismatch repair protein MutS  47.53 
 
 		 904 aa  672    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0321  DNA mismatch repair protein MutS  47.81 
 
 		 923 aa  686    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.784021  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0614  DNA mismatch repair protein MutS  47.64 
 
 		 907 aa  678    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2875  DNA mismatch repair protein MutS  47.28 
 
 		 879 aa  680    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.928835 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0621  DNA mismatch repair protein MutS  48.87 
 
 		 905 aa  660    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.720679  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4031  DNA mismatch repair protein MutS  49.16 
 
 		 881 aa  719    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137829  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3466  DNA mismatch repair protein MutS  48.53 
 
 		 877 aa  678    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0159  DNA mismatch repair protein MutS  48.37 
 
 		 910 aa  742    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0030  DNA mismatch repair protein MutS  47.8 
 
 		 915 aa  656    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355609 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6533  DNA mismatch repair protein MutS  48.78 
 
 		 962 aa  670    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948742  normal  0.317969 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 873 aa  1710    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3021  DNA mismatch repair protein MutS  47.71 
 
 		 897 aa  684    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4799  DNA mismatch repair protein MutS  49.21 
 
 		 896 aa  698    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.720607 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0142  DNA mismatch repair protein MutS  49.16 
 
 		 898 aa  737    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2791  DNA mismatch repair protein MutS  47.37 
 
 		 864 aa  634  1e-180  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2761  DNA mismatch repair protein MutS  46.15 
 
 		 904 aa  628  1e-178  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0260  DNA mismatch repair protein MutS  40.07 
 
 		 804 aa  610  1e-173  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.76262  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  42 
 
 		 868 aa  597  1e-169  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0824  DNA mismatch repair protein MutS  39.58 
 
 		 804 aa  593  1e-168  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  40.11 
 
 		 872 aa  561  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_002978  WD0190  DNA mismatch repair protein MutS  36.81 
 
 		 820 aa  558  1e-157  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  40.21 
 
 		 880 aa  558  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  39.5 
 
 		 863 aa  558  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  40.16 
 
 		 872 aa  559  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  40.29 
 
 		 881 aa  552  1e-155  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  38.64 
 
 		 891 aa  547  1e-154  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  39.89 
 
 		 871 aa  545  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1089  DNA mismatch repair protein MutS  41.51 
 
 		 882 aa  544  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2691  DNA mismatch repair protein MutS  39.98 
 
 		 938 aa  545  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0407651  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  40.94 
 
 		 878 aa  545  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0335  DNA mismatch repair protein MutS  38.25 
 
 		 815 aa  541  9.999999999999999e-153  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.213975  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0993  DNA mismatch repair protein MutS  41.69 
 
 		 882 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0273389  normal  0.417331 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  35.71 
 
 		 870 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  40.32 
 
 		 859 aa  538  1e-151  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5989  DNA mismatch repair protein MutS  39.71 
 
 		 885 aa  538  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3145  DNA mismatch repair protein MutS  39.64 
 
 		 939 aa  535  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2173  DNA mismatch repair protein MutS  39.64 
 
 		 939 aa  535  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.01775  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1671  DNA mismatch repair protein MutS  39.64 
 
 		 891 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207117  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  36.34 
 
 		 846 aa  533  1e-150  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1111  DNA mismatch repair protein MutS  40.38 
 
 		 922 aa  535  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.88674  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  37.61 
 
 		 863 aa  535  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2612  DNA mismatch repair protein MutS  39.53 
 
 		 939 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1998  DNA mismatch repair protein MutS  40.11 
 
 		 885 aa  535  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368418 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1075  DNA mismatch repair protein MutS  39.71 
 
 		 916 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835373  normal  0.410772 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2124  DNA mismatch repair protein MutS  40.11 
 
 		 886 aa  534  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1446  DNA mismatch repair protein MutS  39.64 
 
 		 939 aa  535  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2559  DNA mismatch repair protein MutS  39.13 
 
 		 891 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  36.23 
 
 		 846 aa  530  1e-149  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  39.75 
 
 		 860 aa  530  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  35.27 
 
 		 869 aa  529  1e-149  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  37.61 
 
 		 887 aa  531  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  38.15 
 
 		 859 aa  530  1e-149  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  37.56 
 
 		 870 aa  529  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  36.95 
 
 		 883 aa  527  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  36.37 
 
 		 871 aa  529  1e-148  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  40.21 
 
 		 854 aa  526  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1151  DNA mismatch repair protein MutS  41.64 
 
 		 882 aa  528  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75556  normal  0.534383 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1619  DNA mismatch repair protein MutS  41.2 
 
 		 897 aa  526  1e-148  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.510747 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1913  DNA mismatch repair protein MutS  39.59 
 
 		 893 aa  527  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.396246  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2107  DNA mismatch repair protein MutS  39.82 
 
 		 885 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.069343 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1159  DNA mismatch repair protein MutS  40.91 
 
 		 850 aa  525  1e-147  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0179722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  38.31 
 
 		 860 aa  523  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5394  DNA mismatch repair protein MutS  40.11 
 
 		 885 aa  524  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.597717  normal  0.74748 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  37.66 
 
 		 869 aa  523  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  38.79 
 
 		 855 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  39.24 
 
 		 855 aa  525  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  36.14 
 
 		 859 aa  525  1e-147  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2088  DNA mismatch repair protein MutS  39.82 
 
 		 885 aa  525  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  37.63 
 
 		 874 aa  521  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  38.79 
 
 		 855 aa  522  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1186  DNA mismatch repair protein MutS  40.07 
 
 		 884 aa  520  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296401 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  37.64 
 
 		 857 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1282  DNA mismatch repair protein MutS  41.35 
 
 		 862 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  37.6 
 
 		 880 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1146  DNA mismatch repair protein MutS  38.7 
 
 		 858 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>