More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_81012 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_01708  protein required for mismatch repair in mitosis and meiosis (Eurofung)  47.66 
 
 		 1186 aa  934    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02590  mismatch repair-related protein, putative  35.66 
 
 		 1205 aa  659    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.102659  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81012  Mismatch repair ATPase MSH6 (MutS family)  100 
 
 		 1212 aa  2506    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0833152 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40782  predicted protein  27.82 
 
 		 1113 aa  364  7.0000000000000005e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.119207  normal  0.227387 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  30.33 
 
 		 868 aa  316  1.9999999999999998e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03749  DNA mismatch repair protein msh3 (MutS protein homolog 3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B6T1]  27.06 
 
 		 1091 aa  312  2e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.642565  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01550  conserved hypothetical protein  28.52 
 
 		 1191 aa  312  2e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  27.9 
 
 		 882 aa  311  4e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  30.02 
 
 		 900 aa  310  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53969  predicted protein  33.6 
 
 		 1423 aa  309  2.0000000000000002e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  28.46 
 
 		 887 aa  309  3e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  28.56 
 
 		 858 aa  307  9.000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  27.35 
 
 		 930 aa  306  2.0000000000000002e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  28.39 
 
 		 870 aa  303  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  29.12 
 
 		 887 aa  302  3e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  29.33 
 
 		 932 aa  301  5e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  28.01 
 
 		 868 aa  300  9e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  27.42 
 
 		 862 aa  300  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  28.69 
 
 		 858 aa  299  2e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  28.91 
 
 		 888 aa  298  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  29.5 
 
 		 848 aa  298  4e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  28.91 
 
 		 888 aa  298  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  28.3 
 
 		 858 aa  298  4e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  27.8 
 
 		 867 aa  298  4e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  29.04 
 
 		 857 aa  298  5e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  27.69 
 
 		 870 aa  298  6e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  28.8 
 
 		 873 aa  297  7e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  29.38 
 
 		 903 aa  297  8e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  28.84 
 
 		 868 aa  296  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  27.25 
 
 		 863 aa  295  4e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  27.92 
 
 		 872 aa  295  4e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  27.92 
 
 		 859 aa  295  4e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2612  DNA mismatch repair protein MutS  28.13 
 
 		 939 aa  294  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1446  DNA mismatch repair protein MutS  28.13 
 
 		 939 aa  294  7e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2173  DNA mismatch repair protein MutS  28.13 
 
 		 939 aa  294  7e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.01775  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3145  DNA mismatch repair protein MutS  28.13 
 
 		 939 aa  294  7e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  28.8 
 
 		 868 aa  294  8e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2691  DNA mismatch repair protein MutS  28.13 
 
 		 938 aa  293  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0407651  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1671  DNA mismatch repair protein MutS  28.13 
 
 		 891 aa  293  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207117  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1913  DNA mismatch repair protein MutS  27.47 
 
 		 893 aa  292  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.396246  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  28.2 
 
 		 853 aa  290  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  29.98 
 
 		 869 aa  289  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  27.34 
 
 		 871 aa  289  2.9999999999999996e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  28.6 
 
 		 793 aa  288  5e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  28.14 
 
 		 884 aa  287  7e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  28.14 
 
 		 884 aa  287  7e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  28.15 
 
 		 869 aa  287  8e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  29.47 
 
 		 828 aa  287  9e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2559  DNA mismatch repair protein MutS  27.74 
 
 		 891 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  28.77 
 
 		 872 aa  286  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  28.46 
 
 		 897 aa  285  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  27.61 
 
 		 896 aa  285  5.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  28.38 
 
 		 885 aa  285  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  27.42 
 
 		 889 aa  284  6.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  28.6 
 
 		 870 aa  284  7.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  26.81 
 
 		 856 aa  283  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1486  DNA mismatch repair protein MutS  28.54 
 
 		 867 aa  283  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  27.51 
 
 		 872 aa  281  5e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  27.54 
 
 		 872 aa  281  6e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  28 
 
 		 854 aa  280  9e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  25.71 
 
 		 863 aa  280  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  27.77 
 
 		 793 aa  280  1e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  28.34 
 
 		 896 aa  280  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  26.88 
 
 		 882 aa  278  3e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  26.56 
 
 		 860 aa  278  4e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1111  DNA mismatch repair protein MutS  26.93 
 
 		 922 aa  278  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.88674  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59113  predicted protein  28.52 
 
 		 910 aa  278  4e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  28.7 
 
 		 880 aa  278  4e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3751  DNA mismatch repair protein MutS  26.62 
 
 		 855 aa  277  8e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  27.41 
 
 		 878 aa  277  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  27.21 
 
 		 856 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  26.95 
 
 		 883 aa  275  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1001  DNA mismatch repair protein MutS  28.34 
 
 		 819 aa  275  4.0000000000000004e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280502  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  27.21 
 
 		 856 aa  275  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  27.21 
 
 		 856 aa  275  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2234  DNA mismatch repair protein MutS  28.41 
 
 		 894 aa  274  7e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.282824  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  27.22 
 
 		 904 aa  273  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  27.12 
 
 		 856 aa  273  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  26.98 
 
 		 856 aa  273  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  25.55 
 
 		 872 aa  272  2.9999999999999997e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  26.75 
 
 		 901 aa  272  2.9999999999999997e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  26.64 
 
 		 875 aa  272  2.9999999999999997e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  26.98 
 
 		 855 aa  272  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2603  DNA mismatch repair protein MutS  28.14 
 
 		 891 aa  271  4e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  27.05 
 
 		 871 aa  271  5e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  27.51 
 
 		 873 aa  271  5.9999999999999995e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  28.37 
 
 		 871 aa  271  7e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  28.54 
 
 		 898 aa  271  7e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3263  DNA mismatch repair protein MutS  26.77 
 
 		 889 aa  269  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  27.6 
 
 		 860 aa  269  2.9999999999999995e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  26.7 
 
 		 854 aa  268  4e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  26.64 
 
 		 862 aa  268  4e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  27.07 
 
 		 855 aa  268  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  27.94 
 
 		 823 aa  268  5e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  27.84 
 
 		 861 aa  268  5e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  26.93 
 
 		 859 aa  268  5.999999999999999e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2124  DNA mismatch repair protein MutS  27.29 
 
 		 886 aa  268  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  27.07 
 
 		 855 aa  267  7e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  27.27 
 
 		 873 aa  267  8.999999999999999e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  26.41 
 
 		 872 aa  267  8.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>