More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC01550 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_03749  DNA mismatch repair protein msh3 (MutS protein homolog 3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B6T1]  41.45 
 
 		 1091 aa  659    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.642565  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01550  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 1191 aa  2472    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59113  predicted protein  31.6 
 
 		 910 aa  424  1e-117  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49314  predicted protein  34.78 
 
 		 916 aa  344  5e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0725595  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01708  protein required for mismatch repair in mitosis and meiosis (Eurofung)  26.2 
 
 		 1186 aa  328  5e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  28.94 
 
 		 873 aa  325  3e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  28.52 
 
 		 867 aa  320  7.999999999999999e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81012  Mismatch repair ATPase MSH6 (MutS family)  28.63 
 
 		 1212 aa  313  1e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0833152 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  34.27 
 
 		 870 aa  290  8e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  27.24 
 
 		 896 aa  290  1e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  29.12 
 
 		 858 aa  287  7e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  32.7 
 
 		 869 aa  286  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  32.98 
 
 		 853 aa  284  6.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  29.74 
 
 		 858 aa  283  1e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  32.5 
 
 		 889 aa  282  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  28.45 
 
 		 855 aa  282  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  29.09 
 
 		 856 aa  281  6e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  34.16 
 
 		 854 aa  280  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  31.93 
 
 		 891 aa  278  4e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  31.79 
 
 		 863 aa  277  7e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  28.94 
 
 		 898 aa  277  8e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  35.15 
 
 		 881 aa  273  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  32.92 
 
 		 888 aa  273  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  28.37 
 
 		 897 aa  272  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  31.2 
 
 		 932 aa  272  2.9999999999999997e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  31.46 
 
 		 863 aa  272  2.9999999999999997e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  32.58 
 
 		 828 aa  271  8e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  33.16 
 
 		 864 aa  270  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  32.75 
 
 		 888 aa  270  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  33.02 
 
 		 868 aa  270  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  27.86 
 
 		 901 aa  269  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  31.33 
 
 		 840 aa  269  2e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  28.45 
 
 		 860 aa  268  4e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  32.18 
 
 		 875 aa  268  7e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  32.38 
 
 		 910 aa  267  8e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  32.38 
 
 		 910 aa  266  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  27.93 
 
 		 928 aa  266  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  27.92 
 
 		 855 aa  266  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0434  DNA mismatch repair protein MutS  33.8 
 
 		 853 aa  266  2e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0558205  normal  0.0590484 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  31.87 
 
 		 848 aa  266  2e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  26.79 
 
 		 869 aa  265  3e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  34.24 
 
 		 882 aa  265  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  31.38 
 
 		 852 aa  264  6.999999999999999e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  32.77 
 
 		 873 aa  264  8.999999999999999e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  33.5 
 
 		 900 aa  263  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0335  DNA mismatch repair protein MutS  27.37 
 
 		 815 aa  262  2e-68  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.213975  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  30.67 
 
 		 887 aa  262  3e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2247  DNA mismatch repair protein MutS  33.9 
 
 		 882 aa  261  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136567  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2157  DNA mismatch repair protein MutS  34.07 
 
 		 882 aa  262  4e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.404203  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  27.23 
 
 		 859 aa  261  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  34.95 
 
 		 885 aa  261  7e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  32.59 
 
 		 793 aa  261  7e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  27.21 
 
 		 855 aa  261  8e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  28.11 
 
 		 878 aa  260  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  34.09 
 
 		 850 aa  260  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  30.97 
 
 		 871 aa  260  1e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2234  DNA mismatch repair protein MutS  31.96 
 
 		 894 aa  260  1e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.282824  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2101  DNA mismatch repair protein MutS  31.18 
 
 		 858 aa  259  2e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  34.03 
 
 		 869 aa  259  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0119  DNA mismatch repair protein MutS  28.28 
 
 		 931 aa  259  2e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.893903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  34.16 
 
 		 880 aa  256  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  32.46 
 
 		 823 aa  256  2.0000000000000002e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  28.48 
 
 		 956 aa  256  3e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02590  mismatch repair-related protein, putative  31.2 
 
 		 1205 aa  255  4.0000000000000004e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.102659  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  31.87 
 
 		 868 aa  255  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  31.39 
 
 		 871 aa  254  5.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  32.77 
 
 		 865 aa  254  5.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  31.01 
 
 		 872 aa  254  5.000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  32.53 
 
 		 872 aa  254  7e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  30.95 
 
 		 858 aa  254  8.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  31 
 
 		 870 aa  254  9.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  33.45 
 
 		 857 aa  253  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  0.000000000609956 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  31.62 
 
 		 870 aa  253  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  32.25 
 
 		 793 aa  252  2e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  32.87 
 
 		 872 aa  252  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  27.06 
 
 		 887 aa  252  3e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0458  DNA mismatch repair protein MutS  32.87 
 
 		 865 aa  252  3e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143165  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1284  DNA mismatch repair protein MutS  34.04 
 
 		 896 aa  252  3e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  32.05 
 
 		 862 aa  251  4e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1004  DNA mismatch repair protein MutS  28.5 
 
 		 817 aa  251  4e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  33.57 
 
 		 878 aa  251  5e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  33.27 
 
 		 903 aa  251  6e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  32.68 
 
 		 882 aa  251  7e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  29.86 
 
 		 862 aa  251  7e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1001  DNA mismatch repair protein MutS  29.45 
 
 		 819 aa  251  9e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280502  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  30.68 
 
 		 882 aa  250  9e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  30.98 
 
 		 857 aa  250  9e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  30.72 
 
 		 886 aa  249  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  32.84 
 
 		 871 aa  249  2e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  27.97 
 
 		 868 aa  249  2e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  32.91 
 
 		 854 aa  249  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  31.3 
 
 		 868 aa  249  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  33.39 
 
 		 880 aa  249  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18351  DNA mismatch repair protein MutS  29.95 
 
 		 914 aa  248  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  32.61 
 
 		 874 aa  249  3e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  31.3 
 
 		 917 aa  248  4.9999999999999997e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1737  DNA mismatch repair protein MutS  29.41 
 
 		 913 aa  248  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0169322  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  32.87 
 
 		 858 aa  248  4.9999999999999997e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  32.47 
 
 		 903 aa  248  6e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  31.76 
 
 		 872 aa  248  6e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>