More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_18351 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1243  DNA mismatch repair protein MutS  51.79 
 
 
926 aa  936    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.32952  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  44.61 
 
 
854 aa  748    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21131  DNA mismatch repair protein MutS  53.46 
 
 
926 aa  950    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0652427  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0081  DNA mismatch repair protein MutS  48.46 
 
 
905 aa  863    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294772  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0078  DNA mismatch repair protein MutS  49.03 
 
 
903 aa  845    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.167909  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  46.48 
 
 
885 aa  780    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  45.12 
 
 
854 aa  725    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1737  DNA mismatch repair protein MutS  80.27 
 
 
913 aa  1509    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0169322  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  44.39 
 
 
882 aa  758    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17711  DNA mismatch repair protein MutS  52.84 
 
 
908 aa  921    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18541  DNA mismatch repair protein MutS  80.5 
 
 
913 aa  1531    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  46.18 
 
 
888 aa  780    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18351  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 
914 aa  1856    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18351  DNA mismatch repair protein MutS  79.63 
 
 
913 aa  1516    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00881  DNA mismatch repair protein MutS  48.32 
 
 
927 aa  870    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0543692 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  44.19 
 
 
901 aa  743    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  46.06 
 
 
888 aa  778    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3815  DNA mismatch repair protein MutS  43.47 
 
 
907 aa  717    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.548974 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  41.45 
 
 
932 aa  635  1e-180  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  40.38 
 
 
870 aa  624  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  39.76 
 
 
873 aa  605  1.0000000000000001e-171  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  39.52 
 
 
869 aa  598  1e-169  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  37.8 
 
 
889 aa  598  1e-169  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  37.31 
 
 
871 aa  590  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  37.12 
 
 
891 aa  590  1e-167  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  37.8 
 
 
872 aa  591  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  39.45 
 
 
853 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  38.37 
 
 
869 aa  581  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  38.9 
 
 
896 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  39.9 
 
 
859 aa  577  1.0000000000000001e-163  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  37.92 
 
 
870 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  36.67 
 
 
857 aa  570  1e-161  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  40.19 
 
 
871 aa  566  1e-160  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  37.14 
 
 
868 aa  566  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  37.06 
 
 
874 aa  568  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  37.39 
 
 
872 aa  568  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  37.84 
 
 
868 aa  568  1e-160  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  38.47 
 
 
867 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  40.07 
 
 
859 aa  564  1.0000000000000001e-159  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  35.83 
 
 
870 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  37.82 
 
 
897 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  38.73 
 
 
863 aa  562  1.0000000000000001e-159  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  37.8 
 
 
860 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  37.89 
 
 
823 aa  561  1e-158  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  38.92 
 
 
910 aa  559  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  37.32 
 
 
872 aa  561  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  37.15 
 
 
857 aa  556  1e-157  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  38.58 
 
 
862 aa  554  1e-156  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  37.41 
 
 
856 aa  554  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  36.05 
 
 
859 aa  555  1e-156  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  38.8 
 
 
910 aa  555  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  38.19 
 
 
848 aa  551  1e-155  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  36.48 
 
 
863 aa  550  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  37.53 
 
 
865 aa  549  1e-155  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  37.52 
 
 
872 aa  550  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  37.41 
 
 
896 aa  551  1e-155  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  38.24 
 
 
900 aa  546  1e-154  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  37.81 
 
 
887 aa  548  1e-154  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  36.18 
 
 
882 aa  548  1e-154  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  36.47 
 
 
854 aa  545  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  38.49 
 
 
868 aa  544  1e-153  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  37.47 
 
 
859 aa  543  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  37.1 
 
 
851 aa  545  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  34.71 
 
 
880 aa  544  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  37.47 
 
 
872 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  35.52 
 
 
903 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  37.23 
 
 
855 aa  540  9.999999999999999e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  37.29 
 
 
854 aa  539  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  37.03 
 
 
863 aa  539  9.999999999999999e-153  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  36.77 
 
 
853 aa  538  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  36.82 
 
 
855 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  36.6 
 
 
863 aa  538  1e-151  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  35.43 
 
 
881 aa  538  1e-151  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  36.7 
 
 
855 aa  535  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  35.58 
 
 
881 aa  533  1e-150  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  36.12 
 
 
875 aa  533  1e-150  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  36.45 
 
 
853 aa  533  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  36.65 
 
 
869 aa  535  1e-150  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  37.07 
 
 
852 aa  533  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  37.25 
 
 
854 aa  535  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  36.65 
 
 
862 aa  534  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  36.1 
 
 
858 aa  533  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  36.7 
 
 
855 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  36.57 
 
 
855 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  37.67 
 
 
898 aa  534  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  36.7 
 
 
855 aa  535  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  36.51 
 
 
873 aa  531  1e-149  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  35.86 
 
 
872 aa  532  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  35.79 
 
 
892 aa  530  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  36.6 
 
 
853 aa  532  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  36.25 
 
 
851 aa  530  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  36.43 
 
 
868 aa  531  1e-149  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  36.12 
 
 
854 aa  530  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  36.65 
 
 
887 aa  531  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  37.61 
 
 
856 aa  529  1e-149  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  35.16 
 
 
852 aa  532  1e-149  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  35.71 
 
 
892 aa  527  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  36.23 
 
 
859 aa  526  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  35.55 
 
 
850 aa  528  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3424  DNA mismatch repair protein MutS  36.13 
 
 
851 aa  528  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>