More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_17711 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  48.69 
 
 
888 aa  823    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18351  DNA mismatch repair protein MutS  51.98 
 
 
913 aa  959    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1243  DNA mismatch repair protein MutS  58.85 
 
 
926 aa  1085    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.32952  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21131  DNA mismatch repair protein MutS  58.54 
 
 
926 aa  1088    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0652427  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  50.23 
 
 
885 aa  821    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  50.06 
 
 
854 aa  806    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17711  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 
908 aa  1862    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0081  DNA mismatch repair protein MutS  60.22 
 
 
905 aa  1047    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294772  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0078  DNA mismatch repair protein MutS  61.56 
 
 
903 aa  1043    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.167909  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1737  DNA mismatch repair protein MutS  51.66 
 
 
913 aa  956    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0169322  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  52.06 
 
 
882 aa  854    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  48.63 
 
 
888 aa  822    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  50.12 
 
 
854 aa  789    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18541  DNA mismatch repair protein MutS  53.01 
 
 
913 aa  964    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00881  DNA mismatch repair protein MutS  62.99 
 
 
927 aa  1119    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0543692 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  48.25 
 
 
901 aa  797    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18351  DNA mismatch repair protein MutS  52.84 
 
 
914 aa  976    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3815  DNA mismatch repair protein MutS  48.38 
 
 
907 aa  783    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.548974 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  40.65 
 
 
932 aa  629  1e-179  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  40.43 
 
 
870 aa  627  1e-178  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  40.89 
 
 
872 aa  617  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  41.08 
 
 
889 aa  616  1e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  40.89 
 
 
873 aa  614  9.999999999999999e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  40.02 
 
 
869 aa  611  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  40.99 
 
 
872 aa  611  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  41.48 
 
 
897 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  40.12 
 
 
871 aa  600  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  39.38 
 
 
870 aa  602  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  41.26 
 
 
823 aa  596  1e-169  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  41.57 
 
 
882 aa  597  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  40.12 
 
 
869 aa  595  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  39.76 
 
 
896 aa  589  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  39.45 
 
 
891 aa  591  1e-167  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  41.91 
 
 
859 aa  588  1e-166  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  38.83 
 
 
857 aa  587  1e-166  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  39.37 
 
 
853 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  41.3 
 
 
868 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  38.98 
 
 
900 aa  582  1e-164  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  39.37 
 
 
857 aa  580  1e-164  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  39.11 
 
 
910 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  39.45 
 
 
910 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  39.93 
 
 
863 aa  573  1.0000000000000001e-162  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  38.99 
 
 
871 aa  571  1e-161  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  38.87 
 
 
859 aa  569  1e-161  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  37.82 
 
 
880 aa  570  1e-161  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  40.31 
 
 
850 aa  570  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  38.28 
 
 
874 aa  571  1e-161  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  38.12 
 
 
848 aa  571  1e-161  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  37.53 
 
 
868 aa  570  1e-161  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  39.54 
 
 
896 aa  566  1e-160  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  40.02 
 
 
870 aa  569  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  39.45 
 
 
872 aa  568  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  37.27 
 
 
867 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  39.05 
 
 
887 aa  565  1.0000000000000001e-159  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  37.22 
 
 
887 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  40.48 
 
 
865 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  38.26 
 
 
858 aa  559  1e-158  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  38 
 
 
863 aa  562  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  38.69 
 
 
854 aa  554  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  39.66 
 
 
862 aa  555  1e-156  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  37.03 
 
 
860 aa  554  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  38.38 
 
 
863 aa  550  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  37.68 
 
 
856 aa  550  1e-155  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  38.49 
 
 
851 aa  549  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  37.44 
 
 
903 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  39.18 
 
 
858 aa  548  1e-154  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  38.14 
 
 
858 aa  548  1e-154  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  37.2 
 
 
863 aa  548  1e-154  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  38.25 
 
 
854 aa  546  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  38.57 
 
 
881 aa  548  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  37.67 
 
 
875 aa  546  1e-154  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  37.38 
 
 
854 aa  546  1e-154  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  37.05 
 
 
872 aa  544  1e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  40.7 
 
 
898 aa  545  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  36.91 
 
 
868 aa  545  1e-153  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  37.18 
 
 
859 aa  543  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  38.58 
 
 
882 aa  544  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  37.17 
 
 
872 aa  544  1e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  37.79 
 
 
878 aa  543  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  35.53 
 
 
852 aa  545  1e-153  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  35.92 
 
 
873 aa  540  9.999999999999999e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  37.79 
 
 
854 aa  539  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  37.62 
 
 
855 aa  541  9.999999999999999e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  37.61 
 
 
859 aa  539  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  38.25 
 
 
881 aa  537  1e-151  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  37.59 
 
 
873 aa  536  1e-151  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  38.77 
 
 
858 aa  539  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  36.86 
 
 
856 aa  538  1e-151  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  37.29 
 
 
874 aa  536  1e-151  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  38.12 
 
 
872 aa  535  1e-150  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  38.92 
 
 
855 aa  533  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  37 
 
 
872 aa  535  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  37.53 
 
 
853 aa  533  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  37.5 
 
 
854 aa  533  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  38.63 
 
 
868 aa  533  1e-150  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  37.09 
 
 
837 aa  534  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  35.64 
 
 
872 aa  530  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  36.63 
 
 
862 aa  530  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  38.2 
 
 
851 aa  531  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  37.97 
 
 
853 aa  531  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>