More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_00881 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  43.36 
 
 		 897 aa  640    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  40.9 
 
 		 870 aa  660    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  41.38 
 
 		 873 aa  653    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  51.23 
 
 		 888 aa  851    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1243  DNA mismatch repair protein MutS  55.38 
 
 		 926 aa  1060    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.32952  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3815  DNA mismatch repair protein MutS  53.43 
 
 		 907 aa  833    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.548974 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  53.71 
 
 		 854 aa  860    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0081  DNA mismatch repair protein MutS  72.67 
 
 		 905 aa  1241    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294772  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0078  DNA mismatch repair protein MutS  73.67 
 
 		 903 aa  1232    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.167909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  41.32 
 
 		 932 aa  662    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1737  DNA mismatch repair protein MutS  47.04 
 
 		 913 aa  912    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0169322  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  54.47 
 
 		 882 aa  865    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18351  DNA mismatch repair protein MutS  47.74 
 
 		 913 aa  915    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17711  DNA mismatch repair protein MutS  62.99 
 
 		 908 aa  1102    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  51.46 
 
 		 888 aa  856    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00881  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 927 aa  1885    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0543692 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18541  DNA mismatch repair protein MutS  46.63 
 
 		 913 aa  908    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  52.39 
 
 		 854 aa  828    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18351  DNA mismatch repair protein MutS  48.32 
 
 		 914 aa  907    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  48.81 
 
 		 901 aa  828    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21131  DNA mismatch repair protein MutS  55.84 
 
 		 926 aa  1055    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0652427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  51.07 
 
 		 885 aa  830    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  41.5 
 
 		 870 aa  626  1e-178  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  41.49 
 
 		 868 aa  624  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  40.67 
 
 		 859 aa  622  1e-177  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  40.29 
 
 		 896 aa  621  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  38.25 
 
 		 853 aa  620  1e-176  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  41.47 
 
 		 889 aa  616  1e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  43.34 
 
 		 882 aa  615  9.999999999999999e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  38.83 
 
 		 869 aa  610  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  41.56 
 
 		 872 aa  612  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  43.15 
 
 		 863 aa  606  9.999999999999999e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  40.21 
 
 		 891 aa  606  9.999999999999999e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  38.04 
 
 		 910 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  41.3 
 
 		 872 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  38.31 
 
 		 910 aa  599  1e-170  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  39.93 
 
 		 872 aa  598  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  36.68 
 
 		 867 aa  596  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  39.73 
 
 		 869 aa  598  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  40.1 
 
 		 870 aa  598  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  40.75 
 
 		 871 aa  595  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  41.3 
 
 		 880 aa  590  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  41.03 
 
 		 868 aa  591  1e-167  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  36.03 
 
 		 868 aa  588  1e-166  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  42.05 
 
 		 823 aa  588  1e-166  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  40.15 
 
 		 874 aa  588  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  39.61 
 
 		 857 aa  588  1e-166  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  39.4 
 
 		 859 aa  582  1.0000000000000001e-165  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  42.03 
 
 		 850 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  39.52 
 
 		 871 aa  583  1.0000000000000001e-165  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  39.64 
 
 		 859 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  38.06 
 
 		 881 aa  579  1e-164  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  40.84 
 
 		 862 aa  582  1e-164  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  37.97 
 
 		 863 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  38.71 
 
 		 863 aa  573  1.0000000000000001e-162  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  39.04 
 
 		 900 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  39.56 
 
 		 887 aa  573  1.0000000000000001e-162  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  41.69 
 
 		 865 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  37.86 
 
 		 860 aa  572  1e-161  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  38.98 
 
 		 873 aa  572  1e-161  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  40.79 
 
 		 854 aa  568  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  37.94 
 
 		 872 aa  568  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2234  DNA mismatch repair protein MutS  36.47 
 
 		 894 aa  567  1e-160  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.282824  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  37.14 
 
 		 895 aa  567  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  40.93 
 
 		 859 aa  566  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  38.76 
 
 		 854 aa  568  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  40.96 
 
 		 896 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  39.9 
 
 		 863 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  37.47 
 
 		 887 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  38.96 
 
 		 858 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  38.27 
 
 		 875 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  41.06 
 
 		 855 aa  560  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  40.55 
 
 		 855 aa  561  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  41.3 
 
 		 881 aa  561  1e-158  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  40.41 
 
 		 882 aa  559  1e-158  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  40.55 
 
 		 855 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  38.8 
 
 		 858 aa  557  1e-157  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  38.97 
 
 		 856 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  42.96 
 
 		 898 aa  559  1e-157  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  38.98 
 
 		 903 aa  558  1e-157  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  38.63 
 
 		 855 aa  558  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  37.92 
 
 		 856 aa  558  1e-157  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2247  DNA mismatch repair protein MutS  43.35 
 
 		 882 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136567  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  38.33 
 
 		 883 aa  556  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  38.97 
 
 		 861 aa  557  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  40.05 
 
 		 878 aa  556  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  38.2 
 
 		 858 aa  557  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  38.05 
 
 		 857 aa  557  1e-157  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  38.97 
 
 		 861 aa  556  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  36.85 
 
 		 890 aa  552  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  38.85 
 
 		 856 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  38.84 
 
 		 858 aa  553  1e-156  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  38.47 
 
 		 856 aa  554  1e-156  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  38.85 
 
 		 856 aa  552  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  38.96 
 
 		 851 aa  553  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  36.01 
 
 		 872 aa  553  1e-156  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  43.53 
 
 		 882 aa  554  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  37.5 
 
 		 872 aa  553  1e-156  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  38.85 
 
 		 856 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  36.01 
 
 		 872 aa  553  1e-156  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>