More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0081 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  52.76 
 
 		 888 aa  854    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00881  DNA mismatch repair protein MutS  72.67 
 
 		 927 aa  1244    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0543692 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21131  DNA mismatch repair protein MutS  53.94 
 
 		 926 aa  1024    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0652427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18351  DNA mismatch repair protein MutS  47.38 
 
 		 913 aa  911    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18541  DNA mismatch repair protein MutS  48.64 
 
 		 913 aa  912    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1243  DNA mismatch repair protein MutS  53.39 
 
 		 926 aa  1009    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.32952  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  52.77 
 
 		 854 aa  822    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17711  DNA mismatch repair protein MutS  60.22 
 
 		 908 aa  1033    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  53.39 
 
 		 854 aa  848    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  41.66 
 
 		 896 aa  635    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0081  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 905 aa  1831    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294772  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0078  DNA mismatch repair protein MutS  77.05 
 
 		 903 aa  1313    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.167909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1737  DNA mismatch repair protein MutS  47.15 
 
 		 913 aa  920    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0169322  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  55.2 
 
 		 882 aa  878    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  41.08 
 
 		 870 aa  647    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  53 
 
 		 888 aa  857    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3815  DNA mismatch repair protein MutS  52.49 
 
 		 907 aa  825    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.548974 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  52.03 
 
 		 885 aa  833    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  42.11 
 
 		 932 aa  671    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18351  DNA mismatch repair protein MutS  48.46 
 
 		 914 aa  899    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  49.12 
 
 		 901 aa  815    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  40.9 
 
 		 873 aa  648    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  42.52 
 
 		 870 aa  630  1e-179  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  43.01 
 
 		 872 aa  631  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  42.45 
 
 		 889 aa  626  1e-178  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  42.21 
 
 		 868 aa  623  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  40.34 
 
 		 869 aa  620  1e-176  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  40.95 
 
 		 872 aa  616  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  38.34 
 
 		 853 aa  617  1e-175  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  37.24 
 
 		 867 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  42.45 
 
 		 871 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  42.44 
 
 		 872 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  42.52 
 
 		 897 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  41.96 
 
 		 859 aa  611  1e-173  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  42.09 
 
 		 871 aa  612  1e-173  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  43.4 
 
 		 868 aa  610  1e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  40.44 
 
 		 869 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  38.53 
 
 		 910 aa  608  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  38.57 
 
 		 910 aa  608  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  43.55 
 
 		 850 aa  601  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  44.97 
 
 		 882 aa  602  1e-170  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  41.29 
 
 		 891 aa  598  1e-169  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  39.8 
 
 		 859 aa  597  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  40.47 
 
 		 857 aa  596  1e-169  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  38.99 
 
 		 860 aa  592  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  40.78 
 
 		 887 aa  591  1e-167  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  42.72 
 
 		 823 aa  591  1e-167  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  42.42 
 
 		 863 aa  586  1e-166  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  39.93 
 
 		 870 aa  587  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  35.92 
 
 		 868 aa  588  1e-166  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  43.18 
 
 		 854 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  41.03 
 
 		 872 aa  585  1.0000000000000001e-165  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  39.59 
 
 		 900 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  40.86 
 
 		 874 aa  584  1.0000000000000001e-165  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  41.41 
 
 		 880 aa  578  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  37.76 
 
 		 895 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  37.56 
 
 		 892 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  37.59 
 
 		 863 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  41.31 
 
 		 862 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  37.68 
 
 		 890 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  42.17 
 
 		 859 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  39.16 
 
 		 875 aa  570  1e-161  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  37.55 
 
 		 892 aa  570  1e-161  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  40.32 
 
 		 859 aa  570  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  37.55 
 
 		 892 aa  572  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  37.55 
 
 		 890 aa  571  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  37.55 
 
 		 894 aa  571  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  39.36 
 
 		 883 aa  571  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  37.55 
 
 		 892 aa  572  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  42.29 
 
 		 896 aa  571  1e-161  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  37.55 
 
 		 892 aa  572  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  38.92 
 
 		 858 aa  569  1e-161  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  37.55 
 
 		 892 aa  570  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  37.65 
 
 		 890 aa  572  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  42.86 
 
 		 881 aa  570  1e-161  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  39.04 
 
 		 903 aa  570  1e-161  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  42.31 
 
 		 865 aa  570  1e-161  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  41.38 
 
 		 863 aa  568  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  40.84 
 
 		 855 aa  568  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  39.88 
 
 		 882 aa  566  1e-160  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  41.17 
 
 		 854 aa  567  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  39.16 
 
 		 858 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  39.85 
 
 		 856 aa  564  1.0000000000000001e-159  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  38.4 
 
 		 873 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1282  DNA mismatch repair protein MutS  43.44 
 
 		 862 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  37.61 
 
 		 881 aa  564  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  37.33 
 
 		 887 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  39.46 
 
 		 878 aa  561  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  38.52 
 
 		 871 aa  562  1e-158  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  40.72 
 
 		 854 aa  561  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  41.36 
 
 		 878 aa  560  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  39.04 
 
 		 858 aa  559  1e-158  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  44.14 
 
 		 898 aa  562  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  39.95 
 
 		 858 aa  556  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  40.74 
 
 		 860 aa  556  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  39.63 
 
 		 862 aa  556  1e-157  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  41.15 
 
 		 855 aa  557  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  39.36 
 
 		 861 aa  558  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  37.93 
 
 		 863 aa  556  1e-157  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  34.12 
 
 		 848 aa  557  1e-157  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>