More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_59113 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_59113  predicted protein  100 
 
 		 910 aa  1861    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03749  DNA mismatch repair protein msh3 (MutS protein homolog 3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B6T1]  34.84 
 
 		 1091 aa  512  1e-143  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.642565  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01550  conserved hypothetical protein  31.29 
 
 		 1191 aa  417  9.999999999999999e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49314  predicted protein  28.82 
 
 		 916 aa  387  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0725595  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  29.3 
 
 		 867 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  28.64 
 
 		 863 aa  302  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  28.26 
 
 		 865 aa  298  3e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  28.52 
 
 		 870 aa  295  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  28.05 
 
 		 793 aa  294  5e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  28.57 
 
 		 828 aa  292  2e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  28.46 
 
 		 868 aa  290  9e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  28.1 
 
 		 868 aa  288  2.9999999999999996e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  27.62 
 
 		 793 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  29.03 
 
 		 900 aa  288  4e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  26.94 
 
 		 872 aa  287  7e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  26.94 
 
 		 872 aa  287  7e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0214  DNA mismatch repair protein MutS  27.88 
 
 		 851 aa  286  1.0000000000000001e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.250019 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  27.19 
 
 		 873 aa  286  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02590  mismatch repair-related protein, putative  27.7 
 
 		 1205 aa  284  6.000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.102659  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  27.95 
 
 		 896 aa  284  6.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  28.1 
 
 		 870 aa  283  1e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01708  protein required for mismatch repair in mitosis and meiosis (Eurofung)  27.62 
 
 		 1186 aa  280  8e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  26.9 
 
 		 863 aa  280  9e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  27.61 
 
 		 882 aa  279  2e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81012  Mismatch repair ATPase MSH6 (MutS family)  28.52 
 
 		 1212 aa  279  2e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0833152 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  25.61 
 
 		 881 aa  278  3e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  26.89 
 
 		 872 aa  278  3e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  27.2 
 
 		 850 aa  278  4e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  25.56 
 
 		 928 aa  276  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  27.16 
 
 		 871 aa  275  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  26.66 
 
 		 891 aa  275  3e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  26.74 
 
 		 853 aa  274  6e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3751  DNA mismatch repair protein MutS  26.7 
 
 		 855 aa  273  9e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  26.19 
 
 		 872 aa  273  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  27.21 
 
 		 872 aa  272  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  27.74 
 
 		 864 aa  272  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  28.22 
 
 		 858 aa  272  2e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  27.62 
 
 		 858 aa  271  4e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  27.45 
 
 		 872 aa  270  8e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  27.02 
 
 		 892 aa  269  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  26.91 
 
 		 892 aa  270  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  26.91 
 
 		 892 aa  269  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  26.91 
 
 		 892 aa  269  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  26.77 
 
 		 890 aa  269  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  27.02 
 
 		 869 aa  269  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  26.91 
 
 		 890 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  27.02 
 
 		 892 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  28.57 
 
 		 856 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  25.93 
 
 		 889 aa  268  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  26.58 
 
 		 869 aa  268  4e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  26.91 
 
 		 894 aa  268  4e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  27.5 
 
 		 887 aa  268  4e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  26.91 
 
 		 890 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  27.1 
 
 		 858 aa  266  1e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  26.91 
 
 		 892 aa  266  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  26.14 
 
 		 874 aa  266  1e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  26.14 
 
 		 857 aa  266  1e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  26.06 
 
 		 870 aa  265  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  25.69 
 
 		 874 aa  266  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  26.01 
 
 		 881 aa  265  2e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  25.94 
 
 		 875 aa  265  2e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  27.66 
 
 		 855 aa  265  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  25.25 
 
 		 893 aa  265  4e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  31.79 
 
 		 895 aa  264  4.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  25.25 
 
 		 857 aa  263  8.999999999999999e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  27.63 
 
 		 886 aa  263  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  28.38 
 
 		 863 aa  263  1e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  26.76 
 
 		 880 aa  263  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1520  DNA mismatch repair protein MutS  25.96 
 
 		 848 aa  263  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1486  DNA mismatch repair protein MutS  26.17 
 
 		 867 aa  261  3e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  24.97 
 
 		 903 aa  261  4e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0119  DNA mismatch repair protein MutS  26.35 
 
 		 931 aa  261  5.0000000000000005e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.893903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  27.88 
 
 		 868 aa  261  6e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  26.36 
 
 		 881 aa  260  7e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  28.06 
 
 		 932 aa  260  8e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0434  DNA mismatch repair protein MutS  26.11 
 
 		 853 aa  259  1e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0558205  normal  0.0590484 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  26.98 
 
 		 897 aa  259  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  25.5 
 
 		 855 aa  258  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  27.37 
 
 		 861 aa  258  3e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  27.41 
 
 		 848 aa  258  4e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1250  DNA mismatch repair protein MutS  26.36 
 
 		 823 aa  257  6e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.297858  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  26.04 
 
 		 871 aa  257  7e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3337  DNA mismatch repair protein MutS  26.32 
 
 		 864 aa  257  8e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  27.22 
 
 		 882 aa  256  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  26.11 
 
 		 863 aa  255  3e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  26.36 
 
 		 878 aa  254  4.0000000000000004e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  26.88 
 
 		 873 aa  254  5.000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1031  DNA mismatch repair protein MutS  26.57 
 
 		 851 aa  254  5.000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  27.53 
 
 		 862 aa  254  7e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  25.75 
 
 		 904 aa  253  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  25.85 
 
 		 871 aa  253  1e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  26.37 
 
 		 852 aa  253  1e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  26.91 
 
 		 891 aa  252  2e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  25.66 
 
 		 860 aa  252  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  25.82 
 
 		 859 aa  252  2e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  26.94 
 
 		 846 aa  251  4e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  25.67 
 
 		 887 aa  251  5e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  26.43 
 
 		 871 aa  251  6e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2234  DNA mismatch repair protein MutS  27.67 
 
 		 894 aa  251  6e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.282824  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  25.81 
 
 		 892 aa  250  7e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>