More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0214 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  41.11 
 
 
870 aa  635    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  41.76 
 
 
872 aa  642    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  44.07 
 
 
853 aa  649    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0214  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 
851 aa  1751    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.250019 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  41.95 
 
 
863 aa  635  1e-180  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  41 
 
 
872 aa  631  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  41.48 
 
 
867 aa  627  1e-178  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  41.03 
 
 
865 aa  625  1e-177  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  40.77 
 
 
872 aa  624  1e-177  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  40.82 
 
 
873 aa  624  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  40.3 
 
 
870 aa  619  1e-176  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  40.34 
 
 
871 aa  616  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  41.27 
 
 
870 aa  616  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  41.74 
 
 
869 aa  615  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  42.14 
 
 
823 aa  615  9.999999999999999e-175  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  40.55 
 
 
896 aa  612  9.999999999999999e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  41.08 
 
 
862 aa  610  1e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  39.52 
 
 
869 aa  612  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  40.16 
 
 
859 aa  608  9.999999999999999e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  38.34 
 
 
891 aa  605  9.999999999999999e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  40.55 
 
 
858 aa  605  1.0000000000000001e-171  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  41.36 
 
 
850 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  39.61 
 
 
882 aa  605  1.0000000000000001e-171  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  39.96 
 
 
889 aa  603  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  41.14 
 
 
828 aa  600  1e-170  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  40.78 
 
 
858 aa  599  1e-170  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  39 
 
 
881 aa  600  1e-170  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  40.25 
 
 
868 aa  602  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  40.76 
 
 
882 aa  600  1e-170  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  40.61 
 
 
873 aa  595  1e-169  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  37.8 
 
 
851 aa  597  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  40.63 
 
 
898 aa  596  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  40.81 
 
 
932 aa  598  1e-169  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3424  DNA mismatch repair protein MutS  38.01 
 
 
851 aa  594  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  38.35 
 
 
854 aa  592  1e-168  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  40.97 
 
 
910 aa  595  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  41.33 
 
 
910 aa  593  1e-168  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  38.72 
 
 
855 aa  592  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  37.9 
 
 
851 aa  590  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  37.9 
 
 
851 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  41.48 
 
 
897 aa  589  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  38.72 
 
 
855 aa  591  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  39.17 
 
 
857 aa  590  1e-167  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  38.84 
 
 
871 aa  587  1e-166  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  38.18 
 
 
854 aa  588  1e-166  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  38.65 
 
 
858 aa  588  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1001  DNA mismatch repair protein MutS  40.42 
 
 
819 aa  586  1e-166  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280502  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  38.13 
 
 
887 aa  587  1e-166  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  38.71 
 
 
854 aa  588  1e-166  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  38.73 
 
 
859 aa  587  1e-166  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  38.57 
 
 
855 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  38.68 
 
 
856 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  39.28 
 
 
887 aa  582  1.0000000000000001e-165  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  38.88 
 
 
855 aa  582  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  38.84 
 
 
861 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  38.68 
 
 
856 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  38.68 
 
 
856 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  38.84 
 
 
861 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  39.05 
 
 
861 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  38.99 
 
 
859 aa  582  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  39.89 
 
 
860 aa  581  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  40.34 
 
 
872 aa  581  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  38.32 
 
 
874 aa  580  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  39.63 
 
 
863 aa  579  1e-164  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  38.9 
 
 
859 aa  581  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  39.24 
 
 
856 aa  580  1e-164  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  39.4 
 
 
854 aa  580  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  38.68 
 
 
856 aa  582  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  38.57 
 
 
861 aa  580  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  40.34 
 
 
872 aa  581  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  38.68 
 
 
874 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  37.72 
 
 
855 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  38.95 
 
 
856 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  37.72 
 
 
855 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  37.44 
 
 
852 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  39.09 
 
 
860 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  37.6 
 
 
855 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  37.72 
 
 
855 aa  578  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  38.63 
 
 
856 aa  578  1.0000000000000001e-163  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  38.45 
 
 
856 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  37.72 
 
 
855 aa  575  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  38.81 
 
 
875 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  39.45 
 
 
871 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  38.44 
 
 
871 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  38.58 
 
 
855 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  38.24 
 
 
859 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  38.25 
 
 
928 aa  572  1e-161  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  37.92 
 
 
854 aa  572  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  36.96 
 
 
853 aa  571  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  37.57 
 
 
859 aa  570  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  37.5 
 
 
862 aa  570  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  38.65 
 
 
873 aa  570  1e-161  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3030  DNA mismatch repair protein MutS  38.02 
 
 
860 aa  571  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  39.91 
 
 
858 aa  571  1e-161  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3986  DNA mismatch repair protein MutS  38.02 
 
 
853 aa  572  1e-161  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.724345  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  40.34 
 
 
903 aa  571  1e-161  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2860  DNA mismatch repair protein MutS  38.02 
 
 
853 aa  570  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02548  hypothetical protein  37.9 
 
 
853 aa  568  1e-160  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766489  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  37.16 
 
 
900 aa  568  1e-160  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  38.35 
 
 
884 aa  567  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>