More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0119 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3224  DNA mismatch repair protein MutS  67.99 
 
 		 895 aa  1192    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0119  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 931 aa  1830    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.893903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0366  DNA mismatch repair protein MutS  65.55 
 
 		 914 aa  1164    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0942134  normal  0.39879 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1284  DNA mismatch repair protein MutS  66.27 
 
 		 896 aa  1138    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0493  DNA mismatch repair protein MutS  62.28 
 
 		 915 aa  1084    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.467736  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  39.81 
 
 		 873 aa  588  1e-166  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  38.88 
 
 		 870 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  38.27 
 
 		 887 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  38.83 
 
 		 828 aa  577  1.0000000000000001e-163  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  39.22 
 
 		 932 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  38.16 
 
 		 896 aa  570  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  41 
 
 		 869 aa  570  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0458  DNA mismatch repair protein MutS  43.48 
 
 		 865 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143165  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  41 
 
 		 857 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0434  DNA mismatch repair protein MutS  42.64 
 
 		 853 aa  560  1e-158  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0558205  normal  0.0590484 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  43.58 
 
 		 893 aa  562  1e-158  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  39.76 
 
 		 862 aa  559  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  40.85 
 
 		 854 aa  559  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  41.55 
 
 		 882 aa  562  1e-158  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  40.37 
 
 		 868 aa  562  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  40.48 
 
 		 891 aa  556  1e-157  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  37.93 
 
 		 869 aa  557  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  39.81 
 
 		 885 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  41.8 
 
 		 871 aa  555  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  37.87 
 
 		 860 aa  554  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  40.81 
 
 		 870 aa  555  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0358  DNA mismatch repair protein MutS  41.07 
 
 		 918 aa  552  1e-156  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.613152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  37.76 
 
 		 900 aa  552  1e-155  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  36.22 
 
 		 903 aa  551  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  40.8 
 
 		 872 aa  551  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  42.95 
 
 		 863 aa  551  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  43 
 
 		 880 aa  552  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  36.53 
 
 		 872 aa  548  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  36.43 
 
 		 867 aa  549  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  40.81 
 
 		 870 aa  546  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  39.2 
 
 		 888 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  36.53 
 
 		 872 aa  548  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  39.08 
 
 		 888 aa  545  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  41.05 
 
 		 872 aa  544  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  41.49 
 
 		 917 aa  545  1e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  39.13 
 
 		 881 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1520  DNA mismatch repair protein MutS  40.72 
 
 		 848 aa  541  9.999999999999999e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  40.45 
 
 		 862 aa  541  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  38.58 
 
 		 901 aa  541  9.999999999999999e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  34.14 
 
 		 873 aa  538  1e-151  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  37.84 
 
 		 895 aa  536  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  43.83 
 
 		 882 aa  536  1e-151  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  37.27 
 
 		 863 aa  538  1e-151  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  42.57 
 
 		 878 aa  538  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  38.88 
 
 		 859 aa  538  1e-151  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  39.95 
 
 		 853 aa  538  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  36.6 
 
 		 853 aa  533  1e-150  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  39.41 
 
 		 863 aa  533  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  40.02 
 
 		 854 aa  533  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  38.4 
 
 		 862 aa  534  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  36.36 
 
 		 910 aa  533  1e-150  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  38.97 
 
 		 956 aa  533  1e-150  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  39.16 
 
 		 853 aa  531  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  40.74 
 
 		 887 aa  531  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  35.37 
 
 		 868 aa  532  1e-149  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  36.24 
 
 		 910 aa  531  1e-149  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  38.57 
 
 		 872 aa  528  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  37.76 
 
 		 892 aa  527  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  37.76 
 
 		 890 aa  526  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  37.76 
 
 		 894 aa  526  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  37.58 
 
 		 858 aa  528  1e-148  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  40.2 
 
 		 897 aa  529  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  37.77 
 
 		 892 aa  527  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  37.76 
 
 		 892 aa  527  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0670  DNA mismatch repair protein MutS  40.1 
 
 		 902 aa  528  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.48055  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  39.8 
 
 		 855 aa  527  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  38.4 
 
 		 861 aa  527  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  37.76 
 
 		 892 aa  527  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  38.16 
 
 		 859 aa  524  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  37.64 
 
 		 892 aa  524  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  39.29 
 
 		 871 aa  524  1e-147  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  37.64 
 
 		 892 aa  525  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  40.51 
 
 		 872 aa  524  1e-147  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  37.59 
 
 		 871 aa  523  1e-147  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  37.52 
 
 		 890 aa  524  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  39.73 
 
 		 856 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  38.82 
 
 		 856 aa  523  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  39.85 
 
 		 856 aa  526  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  38.62 
 
 		 882 aa  525  1e-147  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  39.85 
 
 		 856 aa  525  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  38.13 
 
 		 856 aa  524  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  39.48 
 
 		 861 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3815  DNA mismatch repair protein MutS  38.62 
 
 		 907 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.548974 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  39.53 
 
 		 856 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  38.6 
 
 		 928 aa  521  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  37.39 
 
 		 890 aa  521  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  39.29 
 
 		 859 aa  521  1e-146  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  39.35 
 
 		 861 aa  521  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  41.43 
 
 		 855 aa  520  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  36.52 
 
 		 852 aa  522  1e-146  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  39.4 
 
 		 889 aa  521  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  40.12 
 
 		 874 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  38.77 
 
 		 855 aa  518  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  39.23 
 
 		 861 aa  519  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  36.65 
 
 		 857 aa  516  1.0000000000000001e-145  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>