More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3224 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0493  DNA mismatch repair protein MutS  64.06 
 
 		 915 aa  1125    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.467736  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3224  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 895 aa  1785    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0366  DNA mismatch repair protein MutS  68.15 
 
 		 914 aa  1181    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0942134  normal  0.39879 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0119  DNA mismatch repair protein MutS  67.13 
 
 		 931 aa  1140    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.893903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1284  DNA mismatch repair protein MutS  85.17 
 
 		 896 aa  1456    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  36 
 
 		 870 aa  593  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  38.61 
 
 		 932 aa  586  1e-166  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  37.55 
 
 		 887 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  39.47 
 
 		 893 aa  579  1e-164  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  42.48 
 
 		 863 aa  574  1.0000000000000001e-162  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  40.63 
 
 		 891 aa  573  1.0000000000000001e-162  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  38.54 
 
 		 870 aa  569  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  37.78 
 
 		 869 aa  569  1e-161  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0358  DNA mismatch repair protein MutS  40.96 
 
 		 918 aa  572  1e-161  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.613152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  35.62 
 
 		 860 aa  569  1e-161  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  37.27 
 
 		 863 aa  567  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  36.68 
 
 		 867 aa  566  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  36.53 
 
 		 896 aa  569  1e-160  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  40 
 
 		 857 aa  566  1e-160  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  38.92 
 
 		 873 aa  564  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  38.83 
 
 		 853 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  36.99 
 
 		 900 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  36.88 
 
 		 903 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  39.39 
 
 		 869 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  36.62 
 
 		 895 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0458  DNA mismatch repair protein MutS  43.48 
 
 		 865 aa  561  1e-158  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143165  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  38.46 
 
 		 897 aa  561  1e-158  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  40.96 
 
 		 868 aa  558  1e-157  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  40 
 
 		 871 aa  552  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  37.12 
 
 		 890 aa  554  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  36.69 
 
 		 892 aa  550  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  38.55 
 
 		 872 aa  551  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  36.69 
 
 		 892 aa  550  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  36.69 
 
 		 892 aa  550  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  36.75 
 
 		 892 aa  550  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  36.36 
 
 		 892 aa  548  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  36.23 
 
 		 890 aa  546  1e-154  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  36.63 
 
 		 894 aa  547  1e-154  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  34.69 
 
 		 868 aa  548  1e-154  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  37.01 
 
 		 890 aa  547  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  35.2 
 
 		 881 aa  547  1e-154  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  35.31 
 
 		 828 aa  548  1e-154  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  36.71 
 
 		 892 aa  544  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  41.86 
 
 		 850 aa  543  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  41.84 
 
 		 882 aa  545  1e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  37.53 
 
 		 856 aa  545  1e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  43.43 
 
 		 956 aa  544  1e-153  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  40.62 
 
 		 882 aa  541  9.999999999999999e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  37.51 
 
 		 917 aa  541  9.999999999999999e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  37.13 
 
 		 910 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  38.64 
 
 		 859 aa  542  9.999999999999999e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  35.58 
 
 		 868 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  36.89 
 
 		 910 aa  537  1e-151  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  40.58 
 
 		 898 aa  535  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  40.65 
 
 		 855 aa  534  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  37.08 
 
 		 928 aa  533  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  35.44 
 
 		 857 aa  533  1e-150  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  36.49 
 
 		 872 aa  529  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  39.78 
 
 		 896 aa  531  1e-149  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  40.69 
 
 		 854 aa  530  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  34.97 
 
 		 868 aa  530  1e-149  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  36.24 
 
 		 881 aa  530  1e-149  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  39.02 
 
 		 854 aa  530  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  41.6 
 
 		 865 aa  529  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  38.35 
 
 		 853 aa  532  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  39.8 
 
 		 872 aa  530  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  36.49 
 
 		 872 aa  529  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  40.79 
 
 		 823 aa  530  1e-149  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  34.71 
 
 		 852 aa  530  1e-149  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  38.33 
 
 		 862 aa  526  1e-148  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  40.67 
 
 		 855 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0434  DNA mismatch repair protein MutS  40.32 
 
 		 853 aa  528  1e-148  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0558205  normal  0.0590484 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  33.48 
 
 		 873 aa  524  1e-147  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  37.93 
 
 		 872 aa  525  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  39.46 
 
 		 862 aa  526  1e-147  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  39.33 
 
 		 859 aa  525  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  37.88 
 
 		 901 aa  526  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  40.67 
 
 		 855 aa  525  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  39.44 
 
 		 889 aa  524  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2101  DNA mismatch repair protein MutS  35.27 
 
 		 858 aa  520  1e-146  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  38.78 
 
 		 856 aa  522  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  37.5 
 
 		 888 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  37.08 
 
 		 872 aa  520  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  39.04 
 
 		 854 aa  521  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  39.1 
 
 		 863 aa  521  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  38.46 
 
 		 870 aa  521  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  37.5 
 
 		 888 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  37.78 
 
 		 885 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  38.9 
 
 		 856 aa  522  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  38.78 
 
 		 856 aa  522  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  39.05 
 
 		 854 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  39.69 
 
 		 855 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  38.55 
 
 		 856 aa  519  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  35.77 
 
 		 904 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1619  DNA mismatch repair protein MutS  39.67 
 
 		 897 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.510747 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  37.2 
 
 		 853 aa  517  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  38 
 
 		 856 aa  516  1.0000000000000001e-145  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  38.14 
 
 		 861 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  37.5 
 
 		 840 aa  516  1.0000000000000001e-145  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  38.58 
 
 		 861 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>