More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0493 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0366  DNA mismatch repair protein MutS  64.8 
 
 		 914 aa  1131    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0942134  normal  0.39879 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3224  DNA mismatch repair protein MutS  64.17 
 
 		 895 aa  1120    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1284  DNA mismatch repair protein MutS  61.95 
 
 		 896 aa  1060    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0493  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 915 aa  1824    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.467736  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0119  DNA mismatch repair protein MutS  62.38 
 
 		 931 aa  1037    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.893903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  39.35 
 
 		 896 aa  586  1e-166  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  39.71 
 
 		 870 aa  580  1e-164  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  37.12 
 
 		 887 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  38.84 
 
 		 932 aa  578  1.0000000000000001e-163  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  38.81 
 
 		 873 aa  571  1e-161  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  38.42 
 
 		 869 aa  562  1.0000000000000001e-159  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  38.78 
 
 		 870 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  36.46 
 
 		 900 aa  557  1e-157  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  40.19 
 
 		 854 aa  555  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  39.68 
 
 		 891 aa  554  1e-156  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  38.64 
 
 		 901 aa  555  1e-156  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  40.16 
 
 		 882 aa  546  1e-154  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  41.56 
 
 		 863 aa  548  1e-154  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  38.09 
 
 		 856 aa  547  1e-154  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  35.22 
 
 		 828 aa  545  1e-153  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  37.65 
 
 		 897 aa  545  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  38.88 
 
 		 885 aa  545  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  40.05 
 
 		 850 aa  545  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0434  DNA mismatch repair protein MutS  41.85 
 
 		 853 aa  543  1e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0558205  normal  0.0590484 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  38.32 
 
 		 859 aa  545  1e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  37.08 
 
 		 910 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  38.57 
 
 		 888 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  42.03 
 
 		 872 aa  538  1e-151  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  38.45 
 
 		 888 aa  538  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  37.08 
 
 		 910 aa  538  1e-151  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  36.07 
 
 		 863 aa  535  1e-150  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  36.87 
 
 		 869 aa  533  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  35.71 
 
 		 867 aa  534  1e-150  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0458  DNA mismatch repair protein MutS  41.94 
 
 		 865 aa  532  1e-150  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143165  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  38.79 
 
 		 872 aa  535  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1520  DNA mismatch repair protein MutS  41.04 
 
 		 848 aa  534  1e-150  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  39.93 
 
 		 871 aa  529  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0358  DNA mismatch repair protein MutS  39.43 
 
 		 918 aa  530  1e-149  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.613152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  38.69 
 
 		 854 aa  531  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3815  DNA mismatch repair protein MutS  38.85 
 
 		 907 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.548974 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  41.54 
 
 		 878 aa  530  1e-149  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  38.96 
 
 		 857 aa  530  1e-149  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  38.15 
 
 		 862 aa  528  1e-148  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  38.64 
 
 		 870 aa  528  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  34.15 
 
 		 868 aa  526  1e-148  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  38.12 
 
 		 893 aa  525  1e-147  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  37.44 
 
 		 855 aa  526  1e-147  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  36.57 
 
 		 881 aa  525  1e-147  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  38.81 
 
 		 882 aa  525  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  38.46 
 
 		 859 aa  525  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  39.11 
 
 		 854 aa  522  1e-147  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  37.05 
 
 		 858 aa  520  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  34.73 
 
 		 860 aa  520  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  39.64 
 
 		 853 aa  522  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  37.18 
 
 		 875 aa  521  1e-146  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  37.32 
 
 		 853 aa  521  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  37.32 
 
 		 928 aa  522  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  37.17 
 
 		 872 aa  522  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  38.53 
 
 		 889 aa  521  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  39.26 
 
 		 872 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  40.27 
 
 		 854 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  38.34 
 
 		 853 aa  518  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  36.27 
 
 		 863 aa  516  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  39.3 
 
 		 855 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  39.3 
 
 		 855 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  39.66 
 
 		 854 aa  514  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  36.71 
 
 		 858 aa  515  1e-144  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  38 
 
 		 855 aa  514  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  38.1 
 
 		 863 aa  514  1e-144  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  38.77 
 
 		 862 aa  514  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  35.52 
 
 		 904 aa  513  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  37.86 
 
 		 851 aa  513  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  39.57 
 
 		 855 aa  516  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  35.59 
 
 		 896 aa  513  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  39.15 
 
 		 853 aa  513  1e-144  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  34.67 
 
 		 852 aa  514  1e-144  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  38.73 
 
 		 868 aa  513  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  39.3 
 
 		 854 aa  512  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  36.12 
 
 		 871 aa  509  1e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  36.98 
 
 		 859 aa  511  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  37.3 
 
 		 861 aa  510  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  39.1 
 
 		 855 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  37.41 
 
 		 861 aa  510  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  40.86 
 
 		 898 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  39.1 
 
 		 855 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  38.23 
 
 		 856 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  38.18 
 
 		 856 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  39.1 
 
 		 855 aa  509  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  38.98 
 
 		 855 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  39.1 
 
 		 855 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  38.75 
 
 		 823 aa  507  9.999999999999999e-143  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  37.15 
 
 		 856 aa  508  9.999999999999999e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  37.01 
 
 		 861 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  37.56 
 
 		 861 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  37.44 
 
 		 872 aa  505  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  38.23 
 
 		 856 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  37.72 
 
 		 887 aa  505  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  37.68 
 
 		 856 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  38.55 
 
 		 874 aa  503  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  40.46 
 
 		 874 aa  505  1e-141  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>