More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3706 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  49.43 
 
 		 928 aa  960    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3706  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 1085 aa  2182    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0191943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3531  DNA mismatch repair protein MutS  85.78 
 
 		 1088 aa  1856    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3768  DNA mismatch repair protein MutS  66.07 
 
 		 968 aa  625  1e-177  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1181  DNA mismatch repair protein MutS  35.28 
 
 		 927 aa  561  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0190  DNA mismatch repair protein MutS  32.96 
 
 		 820 aa  500  1e-140  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  51.01 
 
 		 862 aa  485  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  48.22 
 
 		 858 aa  479  1e-133  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  46.69 
 
 		 887 aa  474  1e-132  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  49.6 
 
 		 873 aa  473  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  45.7 
 
 		 900 aa  469  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  48.62 
 
 		 858 aa  461  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  46.44 
 
 		 870 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  43.9 
 
 		 896 aa  457  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  48.22 
 
 		 903 aa  457  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  48.72 
 
 		 858 aa  449  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  46.75 
 
 		 860 aa  449  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  48.29 
 
 		 898 aa  449  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  50 
 
 		 882 aa  445  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  49 
 
 		 870 aa  446  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  46 
 
 		 867 aa  443  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  42.5 
 
 		 863 aa  443  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  46.34 
 
 		 863 aa  439  1e-121  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  47.14 
 
 		 889 aa  438  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  45.47 
 
 		 881 aa  436  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  47.41 
 
 		 872 aa  433  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  46.35 
 
 		 872 aa  430  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  50.43 
 
 		 871 aa  427  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  51.08 
 
 		 932 aa  429  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  46.91 
 
 		 869 aa  427  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  43.07 
 
 		 895 aa  426  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  46.71 
 
 		 872 aa  428  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  48.81 
 
 		 865 aa  429  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  45.82 
 
 		 868 aa  425  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  43.45 
 
 		 886 aa  426  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  43.89 
 
 		 869 aa  420  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  44.01 
 
 		 881 aa  421  1e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  43.19 
 
 		 890 aa  420  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  44.23 
 
 		 910 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  44.87 
 
 		 891 aa  414  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  42.47 
 
 		 890 aa  415  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  41.93 
 
 		 864 aa  413  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  44.23 
 
 		 874 aa  414  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  42.31 
 
 		 892 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  42.47 
 
 		 890 aa  416  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  46.72 
 
 		 850 aa  416  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  43.47 
 
 		 856 aa  413  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  43.4 
 
 		 910 aa  415  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  46.02 
 
 		 857 aa  416  1e-114  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  42.15 
 
 		 892 aa  411  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  41.04 
 
 		 858 aa  412  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  42.31 
 
 		 892 aa  413  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  42.53 
 
 		 894 aa  412  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  45.74 
 
 		 870 aa  411  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  41.92 
 
 		 892 aa  412  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  42.31 
 
 		 892 aa  413  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  45.11 
 
 		 892 aa  411  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  42.34 
 
 		 892 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  43.31 
 
 		 859 aa  412  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  49.24 
 
 		 868 aa  410  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  41.67 
 
 		 873 aa  407  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  44.47 
 
 		 891 aa  408  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  43.9 
 
 		 897 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  51.64 
 
 		 930 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  45.24 
 
 		 872 aa  405  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  46.48 
 
 		 828 aa  405  1e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  45.38 
 
 		 896 aa  403  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  39.38 
 
 		 872 aa  401  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  39.38 
 
 		 872 aa  401  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  40.32 
 
 		 855 aa  402  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  44.84 
 
 		 853 aa  401  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  42.44 
 
 		 869 aa  401  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  43.51 
 
 		 864 aa  399  1e-109  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  43.88 
 
 		 882 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  41.87 
 
 		 868 aa  399  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  43.41 
 
 		 860 aa  394  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  43.79 
 
 		 871 aa  394  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  46.14 
 
 		 875 aa  395  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  49.64 
 
 		 823 aa  395  1e-108  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  45.42 
 
 		 874 aa  392  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  43.3 
 
 		 904 aa  392  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  45.69 
 
 		 880 aa  392  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  44.6 
 
 		 857 aa  391  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1031  DNA mismatch repair protein MutS  44.08 
 
 		 851 aa  387  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  43.29 
 
 		 868 aa  389  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2107  DNA mismatch repair protein MutS  47.52 
 
 		 882 aa  389  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317076 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  44.95 
 
 		 855 aa  389  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3224  DNA mismatch repair protein MutS  42.43 
 
 		 895 aa  388  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  44.99 
 
 		 905 aa  389  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2101  DNA mismatch repair protein MutS  42.15 
 
 		 858 aa  384  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  41.41 
 
 		 873 aa  385  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  51.31 
 
 		 882 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  41.25 
 
 		 878 aa  384  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  44.07 
 
 		 910 aa  385  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2247  DNA mismatch repair protein MutS  46.65 
 
 		 882 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136567  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  45.71 
 
 		 854 aa  383  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  43.64 
 
 		 880 aa  383  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  45.67 
 
 		 903 aa  382  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  46.22 
 
 		 863 aa  382  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  40.34 
 
 		 848 aa  382  1e-104  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>