More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_85730 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009048  PICST_85730  predicted protein  100 
 
 		 871 aa  1794    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.144196 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01700  conserved hypothetical protein  31.28 
 
 		 1057 aa  394  1e-108  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0159  DNA mismatch repair protein MutS  29.9 
 
 		 910 aa  360  7e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0142  DNA mismatch repair protein MutS  30.01 
 
 		 898 aa  358  1.9999999999999998e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0147  DNA mismatch repair protein MutS  30.01 
 
 		 910 aa  356  8.999999999999999e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0614  DNA mismatch repair protein MutS  28.95 
 
 		 907 aa  356  8.999999999999999e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1299  DNA mismatch repair protein MutS  30.16 
 
 		 914 aa  351  3e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.141225  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2875  DNA mismatch repair protein MutS  28.39 
 
 		 879 aa  345  2.9999999999999997e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.928835 
 
 
-
 
NC_002978  WD0190  DNA mismatch repair protein MutS  30.39 
 
 		 820 aa  343  5e-93  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4282  DNA mismatch repair protein MutS  29.5 
 
 		 916 aa  333  7.000000000000001e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4649  DNA mismatch repair protein MutS  29.63 
 
 		 916 aa  333  7.000000000000001e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.427089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4799  DNA mismatch repair protein MutS  29.36 
 
 		 896 aa  327  7e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.720607 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2326  DNA mismatch repair protein MutS  29.95 
 
 		 925 aa  325  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.160487 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  29.9 
 
 		 861 aa  324  4e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  30.18 
 
 		 859 aa  323  7e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  30.48 
 
 		 872 aa  322  1.9999999999999998e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  30.12 
 
 		 854 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  30.76 
 
 		 854 aa  322  3e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  30.13 
 
 		 851 aa  321  3.9999999999999996e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  30.13 
 
 		 851 aa  320  6e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  30.36 
 
 		 851 aa  320  6e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1263  DNA mismatch repair protein MutS  28.62 
 
 		 919 aa  320  9e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0902404 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  30.15 
 
 		 852 aa  320  9e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3424  DNA mismatch repair protein MutS  30.01 
 
 		 851 aa  318  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  29.92 
 
 		 861 aa  318  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  29.98 
 
 		 854 aa  318  4e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  30.73 
 
 		 863 aa  317  5e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  29.2 
 
 		 868 aa  317  6e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0209  DNA mismatch repair protein MutS  28.08 
 
 		 877 aa  317  9e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.784326 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  30.64 
 
 		 855 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  30.52 
 
 		 855 aa  315  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  29.22 
 
 		 862 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  29.65 
 
 		 859 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1075  DNA mismatch repair protein MutS  29.53 
 
 		 916 aa  313  5.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835373  normal  0.410772 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  30.52 
 
 		 855 aa  313  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  30.52 
 
 		 855 aa  313  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3021  DNA mismatch repair protein MutS  29.1 
 
 		 897 aa  313  7.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  30.41 
 
 		 855 aa  312  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  30.4 
 
 		 855 aa  312  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725135 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02583  DNA mismatch repair protein  30.13 
 
 		 853 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.858461  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0955  DNA mismatch repair protein MutS  30.13 
 
 		 853 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02548  hypothetical protein  30.13 
 
 		 853 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766489  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0979  DNA mismatch repair protein MutS  30.13 
 
 		 853 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.462533 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2871  DNA mismatch repair protein MutS  30.13 
 
 		 853 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1111  DNA mismatch repair protein MutS  28.95 
 
 		 922 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.88674  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3986  DNA mismatch repair protein MutS  30.13 
 
 		 853 aa  309  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.724345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3143  DNA mismatch repair protein MutS  30.13 
 
 		 853 aa  309  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  28.7 
 
 		 859 aa  308  2.0000000000000002e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1617  DNA mismatch repair protein MutS  29.31 
 
 		 878 aa  308  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  28.41 
 
 		 930 aa  306  8.000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  28.96 
 
 		 874 aa  306  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  30.01 
 
 		 853 aa  306  1.0000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  28.46 
 
 		 884 aa  305  3.0000000000000004e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  28.46 
 
 		 884 aa  305  3.0000000000000004e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  28.56 
 
 		 871 aa  303  1e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3030  DNA mismatch repair protein MutS  30.01 
 
 		 860 aa  303  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2860  DNA mismatch repair protein MutS  29.9 
 
 		 853 aa  301  4e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  28.93 
 
 		 856 aa  301  5e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1619  DNA mismatch repair protein MutS  29.93 
 
 		 897 aa  300  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.510747 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  29.49 
 
 		 854 aa  298  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  27 
 
 		 895 aa  298  4e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  29.04 
 
 		 858 aa  297  5e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0081  DNA mismatch repair protein MutS  29.1 
 
 		 905 aa  296  1e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294772  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1913  DNA mismatch repair protein MutS  29.43 
 
 		 893 aa  296  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.396246  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2612  DNA mismatch repair protein MutS  29.03 
 
 		 939 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  27.9 
 
 		 859 aa  295  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0993  DNA mismatch repair protein MutS  28.44 
 
 		 882 aa  295  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0273389  normal  0.417331 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  27.98 
 
 		 880 aa  295  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1671  DNA mismatch repair protein MutS  29.03 
 
 		 891 aa  294  4e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2173  DNA mismatch repair protein MutS  29.03 
 
 		 939 aa  294  5e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.01775  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3145  DNA mismatch repair protein MutS  29.03 
 
 		 939 aa  294  5e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1446  DNA mismatch repair protein MutS  29.03 
 
 		 939 aa  294  5e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2691  DNA mismatch repair protein MutS  29.03 
 
 		 938 aa  294  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0407651  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1089  DNA mismatch repair protein MutS  28.41 
 
 		 882 aa  293  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1001  DNA mismatch repair protein MutS  27.76 
 
 		 819 aa  293  1e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280502  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1151  DNA mismatch repair protein MutS  27.8 
 
 		 882 aa  291  5.0000000000000004e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75556  normal  0.534383 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  27.13 
 
 		 854 aa  290  7e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7101  DNA mismatch repair protein MutS  28.89 
 
 		 929 aa  289  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743761  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0078  DNA mismatch repair protein MutS  27.67 
 
 		 903 aa  287  7e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.167909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  28.54 
 
 		 878 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  28.16 
 
 		 855 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  26.71 
 
 		 871 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  28.16 
 
 		 855 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  27.88 
 
 		 863 aa  285  3.0000000000000004e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0670  DNA mismatch repair protein MutS  28.08 
 
 		 902 aa  283  7.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.48055  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  27.54 
 
 		 871 aa  281  3e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  27.07 
 
 		 860 aa  278  3e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01479  DNA-binding protein of the mitochondria (Eurofung)  40.35 
 
 		 924 aa  278  4e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  26.78 
 
 		 873 aa  277  6e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2101  DNA mismatch repair protein MutS  28.32 
 
 		 858 aa  275  3e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3337  DNA mismatch repair protein MutS  27.77 
 
 		 864 aa  270  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2284  DNA mismatch repair protein MutS  27.15 
 
 		 897 aa  267  5e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.339354  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1004  DNA mismatch repair protein MutS  29.27 
 
 		 817 aa  267  8e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  26.97 
 
 		 893 aa  257  7e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  26.76 
 
 		 917 aa  253  9.000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0292  DNA mismatch repair protein MutS  27.35 
 
 		 784 aa  253  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.518405  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0827  DNA mismatch repair protein MutS  38.79 
 
 		 878 aa  243  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3466  DNA mismatch repair protein MutS  42.61 
 
 		 877 aa  243  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2791  DNA mismatch repair protein MutS  46.74 
 
 		 864 aa  238  3e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0423  DNA mismatch repair protein MutS  40.18 
 
 		 883 aa  234  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>