More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0292 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0292  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 784 aa  1554    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.518405  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  41.08 
 
 		 896 aa  617  1e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  43.42 
 
 		 891 aa  608  9.999999999999999e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  42.68 
 
 		 853 aa  593  1e-168  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  41.36 
 
 		 828 aa  593  1e-168  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  39.83 
 
 		 887 aa  589  1e-167  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  41.79 
 
 		 859 aa  592  1e-167  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  41.04 
 
 		 869 aa  588  1e-166  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  43.32 
 
 		 862 aa  588  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  41.92 
 
 		 862 aa  585  1e-166  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  42.17 
 
 		 853 aa  588  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  40.52 
 
 		 932 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  43 
 
 		 875 aa  585  1.0000000000000001e-165  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  43.16 
 
 		 871 aa  580  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  40.55 
 
 		 870 aa  582  1e-164  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  39.23 
 
 		 867 aa  580  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  40.38 
 
 		 858 aa  579  1e-164  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  42.8 
 
 		 868 aa  580  1e-164  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  41.05 
 
 		 854 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  40.82 
 
 		 873 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  41.31 
 
 		 887 aa  573  1.0000000000000001e-162  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  40.58 
 
 		 858 aa  568  1e-161  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  39.68 
 
 		 886 aa  571  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  45.85 
 
 		 882 aa  572  1e-161  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  42.73 
 
 		 872 aa  571  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  38.83 
 
 		 863 aa  568  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  40.72 
 
 		 885 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  41.55 
 
 		 869 aa  565  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  42.41 
 
 		 854 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  43.16 
 
 		 863 aa  563  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  41.69 
 
 		 854 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  38.48 
 
 		 863 aa  565  1.0000000000000001e-159  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  41.36 
 
 		 854 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  41.29 
 
 		 823 aa  563  1.0000000000000001e-159  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  40.95 
 
 		 888 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  40.58 
 
 		 858 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  40.83 
 
 		 888 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  40.66 
 
 		 900 aa  560  1e-158  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  42.59 
 
 		 863 aa  559  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  40.33 
 
 		 855 aa  560  1e-158  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  40.85 
 
 		 858 aa  559  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  39.58 
 
 		 928 aa  559  1e-158  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  39.65 
 
 		 856 aa  561  1e-158  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  40.73 
 
 		 862 aa  562  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  40.22 
 
 		 872 aa  556  1e-157  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  39.3 
 
 		 871 aa  556  1e-157  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  41.48 
 
 		 855 aa  557  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  39.01 
 
 		 882 aa  555  1e-157  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  43.49 
 
 		 898 aa  557  1e-157  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  43.29 
 
 		 930 aa  556  1e-157  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  41.5 
 
 		 857 aa  558  1e-157  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  43.2 
 
 		 854 aa  553  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  41.78 
 
 		 851 aa  555  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  41.43 
 
 		 872 aa  554  1e-156  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  40.58 
 
 		 859 aa  552  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  41.21 
 
 		 870 aa  554  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  40.13 
 
 		 859 aa  553  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  39.83 
 
 		 901 aa  552  1e-156  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  38.85 
 
 		 853 aa  550  1e-155  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  40.61 
 
 		 872 aa  550  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  38.1 
 
 		 868 aa  549  1e-155  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  36.81 
 
 		 869 aa  550  1e-155  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  41.45 
 
 		 873 aa  550  1e-155  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  42.74 
 
 		 882 aa  549  1e-155  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  41.24 
 
 		 870 aa  550  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  40.8 
 
 		 861 aa  549  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  41.13 
 
 		 854 aa  549  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  40.59 
 
 		 871 aa  550  1e-155  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  40.93 
 
 		 861 aa  550  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  44.82 
 
 		 865 aa  549  1e-155  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  42.33 
 
 		 855 aa  549  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  40.45 
 
 		 871 aa  550  1e-155  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  41.2 
 
 		 855 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  41.26 
 
 		 851 aa  546  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  40.67 
 
 		 872 aa  548  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  41.26 
 
 		 851 aa  546  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  40.75 
 
 		 855 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  39.43 
 
 		 878 aa  548  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  41.41 
 
 		 852 aa  547  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  41.06 
 
 		 853 aa  548  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  41.2 
 
 		 855 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  43.39 
 
 		 872 aa  547  1e-154  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3424  DNA mismatch repair protein MutS  41.13 
 
 		 851 aa  547  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  40.63 
 
 		 884 aa  546  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  40.63 
 
 		 884 aa  546  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  42.96 
 
 		 903 aa  547  1e-154  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  37.55 
 
 		 910 aa  548  1e-154  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  37.76 
 
 		 910 aa  548  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  40.68 
 
 		 861 aa  547  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  40.03 
 
 		 861 aa  546  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2234  DNA mismatch repair protein MutS  38.12 
 
 		 894 aa  548  1e-154  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.282824  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  41.9 
 
 		 889 aa  546  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  40.4 
 
 		 856 aa  542  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  40.43 
 
 		 856 aa  545  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  40.62 
 
 		 855 aa  545  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  40.62 
 
 		 855 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  40.43 
 
 		 856 aa  545  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  40.72 
 
 		 897 aa  545  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  40.2 
 
 		 859 aa  545  1e-153  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  40.43 
 
 		 856 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>