More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK01700 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006680  CNK01700  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 1057 aa  2182    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85730  predicted protein  30.83 
 
 		 871 aa  390  1e-106  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.144196 
 
 
-
 
NC_002978  WD0190  DNA mismatch repair protein MutS  30.23 
 
 		 820 aa  349  1e-94  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0513  DNA mismatch repair protein MutS  30.83 
 
 		 907 aa  348  4e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0614  DNA mismatch repair protein MutS  30.56 
 
 		 907 aa  345  2e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0159  DNA mismatch repair protein MutS  30.57 
 
 		 910 aa  345  2.9999999999999997e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0260  DNA mismatch repair protein MutS  29.1 
 
 		 804 aa  341  5e-92  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.76262  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0142  DNA mismatch repair protein MutS  30.01 
 
 		 898 aa  341  5e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0147  DNA mismatch repair protein MutS  30.07 
 
 		 910 aa  340  9.999999999999999e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0209  DNA mismatch repair protein MutS  30.34 
 
 		 877 aa  336  1e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.784326 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4649  DNA mismatch repair protein MutS  31.2 
 
 		 916 aa  335  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.427089 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0363  DNA mismatch repair protein MutS  30.79 
 
 		 882 aa  336  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  29.41 
 
 		 930 aa  336  2e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4282  DNA mismatch repair protein MutS  30.88 
 
 		 916 aa  335  4e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2655  DNA mismatch repair protein MutS  31.08 
 
 		 876 aa  333  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.607224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0824  DNA mismatch repair protein MutS  28.74 
 
 		 804 aa  332  2e-89  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1218  DNA mismatch repair protein MutS  30.75 
 
 		 875 aa  329  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.318661  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2879  DNA mismatch repair protein MutS  30.65 
 
 		 880 aa  326  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4799  DNA mismatch repair protein MutS  31.23 
 
 		 896 aa  323  8e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.720607 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0032  DNA mismatch repair protein MutS  30.34 
 
 		 880 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0490  DNA mismatch repair protein MutS  29.61 
 
 		 888 aa  322  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0335  DNA mismatch repair protein MutS  29.53 
 
 		 815 aa  322  1.9999999999999998e-86  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.213975  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0035  DNA mismatch repair protein MutS  29.99 
 
 		 921 aa  322  1.9999999999999998e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  29.78 
 
 		 858 aa  321  3.9999999999999996e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0528  DNA mismatch repair protein MutS  30.16 
 
 		 911 aa  321  5e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0799066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  28.3 
 
 		 910 aa  321  5e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  28.3 
 
 		 910 aa  320  6e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0321  DNA mismatch repair protein MutS  29.96 
 
 		 923 aa  320  7e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.784021  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0423  DNA mismatch repair protein MutS  30.84 
 
 		 883 aa  320  7.999999999999999e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  29.04 
 
 		 853 aa  316  1.9999999999999998e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  27.88 
 
 		 896 aa  315  3.9999999999999997e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0827  DNA mismatch repair protein MutS  29.55 
 
 		 878 aa  314  4.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  29.4 
 
 		 887 aa  313  1e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2875  DNA mismatch repair protein MutS  28.91 
 
 		 879 aa  311  4e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.928835 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0047  DNA mismatch repair protein MutS  30 
 
 		 908 aa  310  6.999999999999999e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.967716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3541  DNA mismatch repair protein MutS  31.18 
 
 		 929 aa  310  9e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0030  DNA mismatch repair protein MutS  30.1 
 
 		 915 aa  310  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355609 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  28.28 
 
 		 857 aa  309  2.0000000000000002e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  29.72 
 
 		 900 aa  306  9.000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  28.45 
 
 		 892 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  29.25 
 
 		 891 aa  305  3.0000000000000004e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  28.06 
 
 		 881 aa  304  7.000000000000001e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2603  DNA mismatch repair protein MutS  29.51 
 
 		 891 aa  303  1e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  28.3 
 
 		 864 aa  303  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  27.84 
 
 		 886 aa  302  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1250  DNA mismatch repair protein MutS  27.56 
 
 		 823 aa  301  3e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.297858  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  28.53 
 
 		 878 aa  302  3e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1263  DNA mismatch repair protein MutS  30.37 
 
 		 919 aa  301  4e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0902404 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6533  DNA mismatch repair protein MutS  29.84 
 
 		 962 aa  300  7e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948742  normal  0.317969 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01479  DNA-binding protein of the mitochondria (Eurofung)  35.6 
 
 		 924 aa  298  2e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  27.2 
 
 		 867 aa  298  3e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2791  DNA mismatch repair protein MutS  28.96 
 
 		 864 aa  298  4e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  26.69 
 
 		 869 aa  297  8e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  28.31 
 
 		 856 aa  295  2e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2234  DNA mismatch repair protein MutS  28.62 
 
 		 894 aa  295  3e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.282824  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  29.44 
 
 		 854 aa  295  3e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  30.38 
 
 		 884 aa  295  3e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  30.38 
 
 		 884 aa  295  3e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7101  DNA mismatch repair protein MutS  30.47 
 
 		 929 aa  295  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743761  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  26.26 
 
 		 873 aa  295  4e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2761  DNA mismatch repair protein MutS  29.93 
 
 		 904 aa  294  5e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  28.96 
 
 		 862 aa  293  8e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  27.05 
 
 		 872 aa  293  1e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  27.5 
 
 		 863 aa  293  1e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1146  DNA mismatch repair protein MutS  28.59 
 
 		 858 aa  290  1e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  27.85 
 
 		 871 aa  289  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  28.06 
 
 		 854 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1166  DNA mismatch repair protein MutS  27.79 
 
 		 863 aa  288  4e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  28.16 
 
 		 853 aa  286  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  27.63 
 
 		 855 aa  286  1.0000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  27.48 
 
 		 870 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  27.92 
 
 		 871 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  29.14 
 
 		 850 aa  286  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  27.53 
 
 		 863 aa  286  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  27.49 
 
 		 855 aa  285  3.0000000000000004e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  29.12 
 
 		 872 aa  284  5.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  27.47 
 
 		 854 aa  282  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  28 
 
 		 857 aa  282  2e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2157  DNA mismatch repair protein MutS  28.96 
 
 		 882 aa  283  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.404203  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01536  DNA mismatch repair protein MutS  28.99 
 
 		 851 aa  282  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1001  DNA mismatch repair protein MutS  27.21 
 
 		 819 aa  281  4e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280502  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  28.09 
 
 		 854 aa  281  4e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  27.58 
 
 		 854 aa  281  5e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3293  DNA mismatch repair protein MutS  28.2 
 
 		 858 aa  281  5e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0310827  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  29.19 
 
 		 887 aa  281  5e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1486  DNA mismatch repair protein MutS  29.03 
 
 		 867 aa  281  6e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  27.43 
 
 		 932 aa  279  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  27.75 
 
 		 855 aa  278  3e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  27.86 
 
 		 873 aa  278  4e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  27.13 
 
 		 863 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  27.72 
 
 		 871 aa  276  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  26.5 
 
 		 872 aa  276  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  27.62 
 
 		 861 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3424  DNA mismatch repair protein MutS  27.55 
 
 		 851 aa  275  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  27.62 
 
 		 859 aa  274  5.000000000000001e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  27.84 
 
 		 896 aa  274  6e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  27.82 
 
 		 872 aa  274  7e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  27.7 
 
 		 882 aa  273  1e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0670  DNA mismatch repair protein MutS  27.34 
 
 		 902 aa  272  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.48055  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  27.44 
 
 		 851 aa  273  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>