More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1083 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1083  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  100 
 
 		 447 aa  880    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0195  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  42.7 
 
 		 446 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0204  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  37.55 
 
 		 475 aa  289  7e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1072  MutS family protein  36.69 
 
 		 463 aa  281  2e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.6736 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0611  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  27.78 
 
 		 796 aa  114  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.651644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  29.96 
 
 		 789 aa  112  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  29.71 
 
 		 750 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0827  DNA mismatch repair protein MutS  29.88 
 
 		 878 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2651  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.42 
 
 		 798 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.530364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1642  MutS2 family protein  35.29 
 
 		 787 aa  107  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000590377  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  27.21 
 
 		 784 aa  107  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1717  MutS family ATPase  30.09 
 
 		 800 aa  107  5e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  30.41 
 
 		 872 aa  106  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  30.41 
 
 		 872 aa  106  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1433  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.43 
 
 		 648 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00229473  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2046  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.83 
 
 		 791 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  29.24 
 
 		 956 aa  104  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1218  DNA mismatch repair protein MutS  31.03 
 
 		 875 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.318661  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1356  MutS2 family protein  34.68 
 
 		 794 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  28.36 
 
 		 864 aa  104  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  27.52 
 
 		 881 aa  102  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4891  MutS2 family protein  28.21 
 
 		 806 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2879  DNA mismatch repair protein MutS  31.03 
 
 		 880 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1813  MutS2 family protein  32.21 
 
 		 796 aa  102  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.572275 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  29.18 
 
 		 873 aa  100  6e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0268  Smr protein/MutS2  29.72 
 
 		 805 aa  100  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0912246 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  29.69 
 
 		 892 aa  99.8  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0670  DNA mismatch repair protein MutS  29.84 
 
 		 902 aa  99.4  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.48055  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0209  DNA mismatch repair protein MutS  29.86 
 
 		 877 aa  99.4  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.784326 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  31.7 
 
 		 855 aa  99.4  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  29.11 
 
 		 893 aa  99.4  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2920  Smr protein/MutS2  29.78 
 
 		 792 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000870196 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1638  MutS2 family protein  27.03 
 
 		 782 aa  99  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00924497  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2875  DNA mismatch repair protein MutS  28.83 
 
 		 879 aa  98.6  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.928835 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1108  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.57 
 
 		 782 aa  99  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0684525  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  28.67 
 
 		 828 aa  97.8  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0999  Smr protein/MutS2  30.39 
 
 		 769 aa  97.4  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0509  MutS2 family protein  27.37 
 
 		 799 aa  97.4  4e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0204433  normal  0.523172 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  30.09 
 
 		 853 aa  97.4  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0824  DNA mismatch repair protein MutS  29.61 
 
 		 804 aa  97.4  4e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  29.67 
 
 		 887 aa  97.8  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  30.21 
 
 		 898 aa  97.4  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0363  DNA mismatch repair protein MutS  30.74 
 
 		 882 aa  97.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0426  mismatch repair ATPase  31.39 
 
 		 791 aa  97.1  5e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00172781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0230  MutS2 family protein  30.13 
 
 		 789 aa  97.1  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000337666  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0614  DNA mismatch repair protein MutS  27.78 
 
 		 907 aa  97.1  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  29.54 
 
 		 761 aa  97.1  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0538  MutS2 family protein  31.22 
 
 		 791 aa  97.1  7e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00387352  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  27.2 
 
 		 887 aa  96.7  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2632  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.95 
 
 		 784 aa  96.3  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176007  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3263  DNA mismatch repair protein MutS  32.12 
 
 		 889 aa  96.3  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  31.7 
 
 		 859 aa  96.3  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0081  DNA mismatch repair protein MutS  30.26 
 
 		 905 aa  95.9  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294772  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3706  DNA mismatch repair protein MutS  28.44 
 
 		 1085 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0191943 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2655  DNA mismatch repair protein MutS  32.98 
 
 		 876 aa  95.5  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.607224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1486  DNA mismatch repair protein MutS  30.57 
 
 		 867 aa  95.1  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  31.84 
 
 		 852 aa  95.1  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  30.42 
 
 		 858 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  28.81 
 
 		 900 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3531  DNA mismatch repair protein MutS  28.44 
 
 		 1088 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2648  DNA-mismatch repair protein  28.57 
 
 		 797 aa  95.1  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.270427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  31.19 
 
 		 872 aa  94.7  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  27.03 
 
 		 860 aa  94.7  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1111  DNA mismatch repair protein MutS  30.91 
 
 		 922 aa  94.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.88674  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0078  DNA mismatch repair protein MutS  32.95 
 
 		 903 aa  94.7  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.167909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2750  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  25.71 
 
 		 818 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  25.96 
 
 		 786 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  31.51 
 
 		 855 aa  94.4  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1014  MutS2 family protein  30.49 
 
 		 793 aa  94.4  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0625051  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0366  DNA mismatch repair protein MutS  26.39 
 
 		 914 aa  94.4  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0942134  normal  0.39879 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  32.37 
 
 		 854 aa  94.4  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  31.4 
 
 		 863 aa  93.6  6e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  31.77 
 
 		 859 aa  93.6  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  27.59 
 
 		 889 aa  93.6  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03749  DNA mismatch repair protein msh3 (MutS protein homolog 3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B6T1]  31.5 
 
 		 1091 aa  93.2  7e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.642565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  27.36 
 
 		 862 aa  93.6  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  28.8 
 
 		 872 aa  93.6  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0260  DNA mismatch repair protein MutS  28.45 
 
 		 804 aa  93.2  9e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.76262  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0545  MutS2 family protein  27.15 
 
 		 775 aa  93.2  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.807648  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  28.81 
 
 		 881 aa  93.2  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0062  MutS2 family protein  29.01 
 
 		 826 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21825  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_002950  PG0384  MutS2 family protein  31.55 
 
 		 840 aa  92.8  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  31.31 
 
 		 854 aa  92.8  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  26.62 
 
 		 874 aa  93.2  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1711  MutS2 family protein  29.72 
 
 		 801 aa  92.8  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000187694  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  30.37 
 
 		 856 aa  92.8  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3466  DNA mismatch repair protein MutS  29.09 
 
 		 877 aa  92  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00881  DNA mismatch repair protein MutS  29.36 
 
 		 927 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0543692 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1152  MutS2 family protein  30.73 
 
 		 757 aa  92  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1159  DNA mismatch repair protein MutS  31.18 
 
 		 850 aa  91.7  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0179722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  30.69 
 
 		 881 aa  92.4  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  28.45 
 
 		 882 aa  92  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0993  DNA mismatch repair protein MutS  29.67 
 
 		 882 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0273389  normal  0.417331 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  29.61 
 
 		 856 aa  92  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  25.15 
 
 		 857 aa  91.7  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5060  MutS2 family protein  27.36 
 
 		 802 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  30.47 
 
 		 869 aa  91.7  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  32.14 
 
 		 903 aa  91.7  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2125  MutS2 family protein  28.8 
 
 		 776 aa  91.7  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1999  MutS2 family protein  24.45 
 
 		 825 aa  90.9  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>