More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0195 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0195  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  100 
 
 		 446 aa  877    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1083  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  42.7 
 
 		 447 aa  304  2.0000000000000002e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0204  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  38.04 
 
 		 475 aa  277  2e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1072  MutS family protein  32.97 
 
 		 463 aa  262  6.999999999999999e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.6736 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1717  MutS family ATPase  30.63 
 
 		 800 aa  113  7.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  29.73 
 
 		 784 aa  113  8.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1336  MutS2 family protein  33.48 
 
 		 781 aa  109  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2632  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.29 
 
 		 784 aa  107  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176007  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1642  MutS2 family protein  36.11 
 
 		 787 aa  106  8e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000590377  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  26.51 
 
 		 872 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1470  MutS2 family protein  34.21 
 
 		 792 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.471316  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0538  MutS2 family protein  29.91 
 
 		 791 aa  105  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00387352  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2046  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.67 
 
 		 791 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  25.68 
 
 		 905 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0230  MutS2 family protein  31.7 
 
 		 789 aa  104  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000337666  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1014  MutS2 family protein  33.63 
 
 		 793 aa  103  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0625051  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0458  MutS family ATPase  31.4 
 
 		 795 aa  102  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0153  MutS2 family protein  30.23 
 
 		 796 aa  102  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323958  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1711  MutS2 family protein  30.91 
 
 		 801 aa  101  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000187694  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1638  MutS2 family protein  30 
 
 		 782 aa  100  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00924497  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  27.09 
 
 		 872 aa  99.8  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  29.1 
 
 		 786 aa  99.8  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0545  MutS2 family protein  28.69 
 
 		 775 aa  99.4  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.807648  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0384  MutS2 family protein  26.89 
 
 		 840 aa  99  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1813  MutS2 family protein  30.74 
 
 		 796 aa  99.8  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.572275 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  25.34 
 
 		 863 aa  98.6  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  29.24 
 
 		 956 aa  97.1  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0621  DNA mismatch repair protein MutS  24.41 
 
 		 905 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.720679  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  27.52 
 
 		 882 aa  96.7  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  25.99 
 
 		 789 aa  96.3  9e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4891  MutS2 family protein  29.57 
 
 		 806 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0824  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.28 
 
 		 792 aa  95.9  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  32.34 
 
 		 761 aa  95.9  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  26.67 
 
 		 898 aa  95.1  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  25.08 
 
 		 869 aa  95.5  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  26.19 
 
 		 853 aa  95.5  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3240  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.52 
 
 		 786 aa  95.1  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  25.34 
 
 		 910 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1108  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.6 
 
 		 782 aa  95.5  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0684525  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0999  Smr protein/MutS2  32.29 
 
 		 769 aa  95.1  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85730  predicted protein  29.72 
 
 		 871 aa  94.7  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.144196 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  31.49 
 
 		 750 aa  94.7  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  32.09 
 
 		 860 aa  93.6  7e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0426  mismatch repair ATPase  33.33 
 
 		 791 aa  93.2  8e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00172781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  25.98 
 
 		 828 aa  92.8  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  28.02 
 
 		 869 aa  92.4  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10978  MutS2 family protein  28.76 
 
 		 722 aa  92.4  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  25.76 
 
 		 904 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0174  DNA mismatch repair protein MutS  26.21 
 
 		 820 aa  91.7  2e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0727  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.26 
 
 		 782 aa  92.4  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  27.88 
 
 		 872 aa  92.4  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  32.31 
 
 		 872 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  26.13 
 
 		 872 aa  92  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2054  DNA mismatch repair protein MutS-like  32.33 
 
 		 771 aa  92  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  32.31 
 
 		 872 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  25.08 
 
 		 871 aa  91.3  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4380  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.26 
 
 		 786 aa  90.9  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05680  MutS2 family protein  29.57 
 
 		 791 aa  90.9  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1308  MutS2 family protein  32.57 
 
 		 778 aa  90.5  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1486  DNA mismatch repair protein MutS  28.19 
 
 		 867 aa  90.5  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4299  MutS2 family protein  38.66 
 
 		 812 aa  90.5  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1152  MutS2 family protein  38.93 
 
 		 757 aa  90.1  7e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1218  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  32.14 
 
 		 654 aa  90.1  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215011  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0576  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.26 
 
 		 786 aa  90.1  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613341  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1450  MutS2 family protein  40.58 
 
 		 818 aa  89.7  9e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  28.76 
 
 		 863 aa  89.7  9e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4662  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.26 
 
 		 786 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0676128  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.82 
 
 		 786 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0381928  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1356  MutS2 family protein  28.19 
 
 		 794 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4447  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.82 
 
 		 786 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4285  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.82 
 
 		 786 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4296  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.82 
 
 		 786 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4665  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.82 
 
 		 786 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000565535 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4794  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.82 
 
 		 786 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.167233  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  29.6 
 
 		 892 aa  89.4  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  31.02 
 
 		 864 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3466  DNA mismatch repair protein MutS  25.33 
 
 		 877 aa  89  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.26 
 
 		 786 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000221381  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  25.33 
 
 		 896 aa  89  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  26.2 
 
 		 873 aa  88.6  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1225  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.65 
 
 		 782 aa  88.6  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4799  DNA mismatch repair protein MutS  24.41 
 
 		 896 aa  89  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.720607 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0827  DNA mismatch repair protein MutS  23.75 
 
 		 878 aa  88.6  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  32.86 
 
 		 858 aa  88.2  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0008  DNA mismatch repair protein MutS  24.82 
 
 		 904 aa  89  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1203  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.65 
 
 		 782 aa  88.6  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5060  MutS2 family protein  29.22 
 
 		 802 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  28.63 
 
 		 867 aa  88.2  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  27.54 
 
 		 910 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  27.54 
 
 		 910 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1886  MutS family ATPase  27.73 
 
 		 620 aa  89  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.566906  hitchhiker  0.00000000000303267 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  32.75 
 
 		 854 aa  89  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0358  DNA mismatch repair protein MutS  29.69 
 
 		 918 aa  88.2  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.613152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1568  MutS2 family protein  32.31 
 
 		 763 aa  87.8  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4031  DNA mismatch repair protein MutS  24.25 
 
 		 881 aa  87.8  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137829  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2135  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.94 
 
 		 786 aa  88.2  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1847  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.94 
 
 		 786 aa  88.2  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2750  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  25.3 
 
 		 818 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1433  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.38 
 
 		 648 aa  88.2  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00229473  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0611  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.5 
 
 		 796 aa  87.4  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.651644  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>