More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1218 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1433  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  55.81 
 
 		 648 aa  718    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00229473  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1218  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  100 
 
 		 654 aa  1348    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215011  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3499  MutS family protein, putative  36.41 
 
 		 633 aa  411  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.969005  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3259  DNA mismatch repair protein  36.41 
 
 		 633 aa  410  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.357626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3205  DNA mismatch repair protein  36.25 
 
 		 633 aa  411  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148048  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3515  putative MutS family protein  36.41 
 
 		 633 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3196  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  36.41 
 
 		 633 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3504  putative MutS family protein  36.25 
 
 		 633 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3289  MutS family protein  36.25 
 
 		 633 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3547  MutS family protein  36.25 
 
 		 633 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3486  putative MutS family protein  36.2 
 
 		 633 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.441527  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2199  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  36.54 
 
 		 633 aa  405  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1760  DNA mismatch repair protein MutS  40.04 
 
 		 572 aa  373  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.21933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2632  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  40.2 
 
 		 784 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176007  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1014  MutS2 family protein  40.12 
 
 		 793 aa  342  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0625051  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1711  MutS2 family protein  39.06 
 
 		 801 aa  340  5.9999999999999996e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000187694  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05680  MutS2 family protein  38.1 
 
 		 791 aa  337  5.999999999999999e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1638  MutS2 family protein  37.95 
 
 		 782 aa  335  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00924497  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2135  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  38.05 
 
 		 786 aa  334  3e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1847  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  38.05 
 
 		 786 aa  334  3e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4380  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  38.32 
 
 		 786 aa  334  4e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  38.32 
 
 		 786 aa  331  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0381928  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0824  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  39.08 
 
 		 792 aa  331  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  38.32 
 
 		 786 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000221381  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4285  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  38.12 
 
 		 786 aa  329  8e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4665  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  38.12 
 
 		 786 aa  329  8e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000565535 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4662  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  38.12 
 
 		 786 aa  329  8e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0676128  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4296  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  38.12 
 
 		 786 aa  329  9e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0576  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  38.12 
 
 		 786 aa  329  9e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3240  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  37.65 
 
 		 786 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4447  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  37.92 
 
 		 786 aa  327  3e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4794  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  37.92 
 
 		 786 aa  327  3e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.167233  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1470  MutS2 family protein  39.72 
 
 		 792 aa  327  4.0000000000000003e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.471316  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1356  MutS2 family protein  39.24 
 
 		 794 aa  326  7e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  39.55 
 
 		 786 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  37.32 
 
 		 784 aa  324  4e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1813  MutS2 family protein  37.25 
 
 		 796 aa  323  6e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.572275 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1203  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  38.08 
 
 		 782 aa  323  7e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1225  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  38.08 
 
 		 782 aa  323  7e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4891  MutS2 family protein  36.21 
 
 		 806 aa  321  1.9999999999999998e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2046  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  38.25 
 
 		 791 aa  318  3e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1308  MutS2 family protein  35.93 
 
 		 778 aa  314  3.9999999999999997e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0545  MutS2 family protein  37.65 
 
 		 775 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.807648  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0727  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.87 
 
 		 782 aa  308  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1336  MutS2 family protein  38.83 
 
 		 781 aa  307  4.0000000000000004e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0153  MutS2 family protein  36.71 
 
 		 796 aa  306  8.000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323958  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1642  MutS2 family protein  35.91 
 
 		 787 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000590377  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0426  mismatch repair ATPase  36.27 
 
 		 791 aa  303  6.000000000000001e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00172781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1717  MutS family ATPase  34.84 
 
 		 800 aa  302  2e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2798  MutS2 family protein  36.42 
 
 		 783 aa  300  6e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1108  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  36.27 
 
 		 782 aa  299  1e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0684525  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4014  MutS2 family protein  35.61 
 
 		 828 aa  298  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.301308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0062  MutS2 family protein  34.98 
 
 		 826 aa  296  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21825  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2125  MutS2 family protein  39.16 
 
 		 776 aa  295  1e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1412  MutS2 family protein  35.63 
 
 		 783 aa  295  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29197e-17 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0230  MutS2 family protein  36.42 
 
 		 789 aa  295  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000337666  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1493  MutS2 family protein  35.53 
 
 		 757 aa  295  2e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1737  MutS family DNA structure-specific ATPase  35.67 
 
 		 783 aa  295  2e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1541  MutS2 family protein  35.33 
 
 		 757 aa  294  3e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1719  MutS2 family protein  35.67 
 
 		 779 aa  293  7e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2782  MutS2 family protein  35.92 
 
 		 785 aa  292  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798995  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0538  MutS2 family protein  33.27 
 
 		 791 aa  291  2e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00387352  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1710  MutS2 family protein  34.4 
 
 		 820 aa  289  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.261707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1886  MutS family ATPase  33.33 
 
 		 620 aa  288  2e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.566906  hitchhiker  0.00000000000303267 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2680  mismatch repair ATPase  35.63 
 
 		 788 aa  287  4e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1809  MutS family DNA structure-specific ATPase  33.73 
 
 		 776 aa  286  1.0000000000000001e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.284001  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  34.93 
 
 		 788 aa  279  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0458  MutS family ATPase  35 
 
 		 795 aa  277  4e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0935  MutS2 family protein  33.08 
 
 		 785 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2974  MutS 2 protein  34.57 
 
 		 785 aa  273  9e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1920  MutS2 family protein  32.39 
 
 		 760 aa  271  2e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.380002  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3655  MutS2 family protein  34.68 
 
 		 780 aa  271  4e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1568  MutS2 family protein  34.33 
 
 		 763 aa  270  5.9999999999999995e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4299  MutS2 family protein  34.86 
 
 		 812 aa  270  7e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0547  MutS2 family protein  33.27 
 
 		 792 aa  270  8e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0634  MutS2 family protein  33.66 
 
 		 779 aa  262  1e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4901  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  36.02 
 
 		 803 aa  262  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1689  Smr protein/MutS2  32.16 
 
 		 793 aa  259  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5060  MutS2 family protein  34.84 
 
 		 802 aa  252  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0730  MutS2 family protein  32.82 
 
 		 804 aa  250  4e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  34.15 
 
 		 750 aa  249  9e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0734  MutS2 family protein  33.4 
 
 		 780 aa  249  1e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.11062  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5711  MutS2 family protein  32.4 
 
 		 824 aa  248  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1152  MutS2 family protein  36.46 
 
 		 757 aa  247  4e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02951  DNA mismatch repair protein MutS family protein  34.6 
 
 		 804 aa  245  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0619291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1585  MutS 2 protein  34.6 
 
 		 804 aa  245  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  37.84 
 
 		 789 aa  244  3.9999999999999997e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03891  putative DNA mismatch repair protein MutS family protein  32.35 
 
 		 828 aa  243  6e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.331058 
 
 
-
 
NC_002950  PG0384  MutS2 family protein  36.53 
 
 		 840 aa  243  7.999999999999999e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2651  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  36.04 
 
 		 798 aa  242  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.530364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3820  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.17 
 
 		 830 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02381  DNA mismatch repair protein MutS family protein  34.95 
 
 		 805 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0668  Smr protein/MutS2  30.37 
 
 		 794 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.529959  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3771  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.17 
 
 		 830 aa  241  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0299  MutS2 family protein  36.39 
 
 		 803 aa  240  6.999999999999999e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0999  Smr protein/MutS2  39.67 
 
 		 769 aa  239  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0447  DNA mismatch repair protein MutS-like  32.48 
 
 		 789 aa  236  7e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  37.5 
 
 		 761 aa  235  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2920  Smr protein/MutS2  35.92 
 
 		 792 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000870196 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2648  DNA-mismatch repair protein  33.55 
 
 		 797 aa  233  8.000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.270427  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>