More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1072 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1072  MutS family protein  100 
 
 		 463 aa  942    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.6736 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1083  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  36.69 
 
 		 447 aa  281  2e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0195  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  32.97 
 
 		 446 aa  262  8e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0204  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33.19 
 
 		 475 aa  241  2.9999999999999997e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0827  DNA mismatch repair protein MutS  35.43 
 
 		 878 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2046  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.64 
 
 		 791 aa  100  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1642  MutS2 family protein  30.36 
 
 		 787 aa  99.4  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000590377  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0611  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.45 
 
 		 796 aa  98.6  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.651644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  34.71 
 
 		 930 aa  99  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1108  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.39 
 
 		 782 aa  95.1  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0684525  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1813  MutS2 family protein  33.33 
 
 		 796 aa  94.7  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.572275 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  27.4 
 
 		 784 aa  94.7  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1638  MutS2 family protein  33.77 
 
 		 782 aa  94.7  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00924497  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1336  MutS2 family protein  30.4 
 
 		 781 aa  94.7  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1717  MutS family ATPase  27.52 
 
 		 800 aa  94.4  4e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1486  DNA mismatch repair protein MutS  36.79 
 
 		 867 aa  94  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  31.9 
 
 		 786 aa  93.2  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2603  DNA mismatch repair protein MutS  26.48 
 
 		 891 aa  92  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  31.94 
 
 		 868 aa  91.7  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0153  MutS2 family protein  29.17 
 
 		 796 aa  92.4  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323958  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4891  MutS2 family protein  28.2 
 
 		 806 aa  90.5  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  28.73 
 
 		 860 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0299  MutS2 family protein  35.5 
 
 		 803 aa  89  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  26.24 
 
 		 848 aa  89  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0268  Smr protein/MutS2  28.71 
 
 		 805 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0912246 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3655  MutS2 family protein  28.67 
 
 		 780 aa  88.6  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05680  MutS2 family protein  30.28 
 
 		 791 aa  88.6  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1152  MutS2 family protein  28.83 
 
 		 757 aa  88.6  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  31.05 
 
 		 905 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0999  Smr protein/MutS2  31.46 
 
 		 769 aa  88.2  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0458  MutS family ATPase  29.21 
 
 		 795 aa  88.2  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0035  DNA mismatch repair protein MutS  31.15 
 
 		 921 aa  87.8  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0621  DNA mismatch repair protein MutS  32.82 
 
 		 905 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.720679  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1111  DNA mismatch repair protein MutS  29.66 
 
 		 922 aa  87.4  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.88674  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2651  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.36 
 
 		 798 aa  87.4  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.530364  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0727  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.91 
 
 		 782 aa  87  7e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3240  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  26.71 
 
 		 786 aa  86.7  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02471  DNA mismatch repair protein MutS family protein  27.9 
 
 		 803 aa  86.7  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.677193  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  27.46 
 
 		 898 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  26.69 
 
 		 846 aa  86.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4649  DNA mismatch repair protein MutS  31.82 
 
 		 916 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.427089 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1218  DNA mismatch repair protein MutS  32.54 
 
 		 875 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.318661  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1238  DNA mismatch repair protein MutS  31.56 
 
 		 858 aa  86.3  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  39.33 
 
 		 873 aa  85.9  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  31.97 
 
 		 872 aa  86.3  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1537  DNA mismatch repair protein MutS  32.96 
 
 		 880 aa  86.3  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  27.36 
 
 		 883 aa  85.1  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1263  DNA mismatch repair protein MutS  29.32 
 
 		 919 aa  85.1  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0902404 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  26.71 
 
 		 846 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0634  MutS2 family protein  30.09 
 
 		 779 aa  85.5  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  30.19 
 
 		 789 aa  85.5  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0730  MutS2 family protein  30.22 
 
 		 804 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  28.35 
 
 		 881 aa  85.1  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2107  DNA mismatch repair protein MutS  28 
 
 		 882 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317076 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1250  DNA mismatch repair protein MutS  27.3 
 
 		 823 aa  84.7  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.297858  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0824  DNA mismatch repair protein MutS  29.8 
 
 		 804 aa  84.7  0.000000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4282  DNA mismatch repair protein MutS  31.31 
 
 		 916 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4799  DNA mismatch repair protein MutS  31.31 
 
 		 896 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.720607 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  32.06 
 
 		 868 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85730  predicted protein  32.42 
 
 		 871 aa  84.7  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.144196 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1719  MutS2 family protein  29.82 
 
 		 779 aa  84.3  0.000000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  27.68 
 
 		 872 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2559  DNA mismatch repair protein MutS  29.75 
 
 		 891 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  39.5 
 
 		 761 aa  84.3  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2199  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  26.22 
 
 		 633 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1446  DNA mismatch repair protein MutS  29.75 
 
 		 939 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3145  DNA mismatch repair protein MutS  29.75 
 
 		 939 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1671  DNA mismatch repair protein MutS  29.75 
 
 		 891 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207117  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1146  DNA mismatch repair protein MutS  31.11 
 
 		 858 aa  84  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2612  DNA mismatch repair protein MutS  29.75 
 
 		 939 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2750  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  24.18 
 
 		 818 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  25.28 
 
 		 872 aa  84  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2173  DNA mismatch repair protein MutS  29.75 
 
 		 939 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.01775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2691  DNA mismatch repair protein MutS  29.75 
 
 		 938 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0407651  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  25.44 
 
 		 886 aa  83.6  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2326  DNA mismatch repair protein MutS  28.28 
 
 		 925 aa  84  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.160487 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1913  DNA mismatch repair protein MutS  29.67 
 
 		 893 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.396246  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3599  DNA mismatch repair protein MutS  36.31 
 
 		 908 aa  83.6  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  30.83 
 
 		 872 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2879  DNA mismatch repair protein MutS  32.54 
 
 		 880 aa  83.6  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  27.47 
 
 		 869 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0230  MutS2 family protein  28.07 
 
 		 789 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000337666  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1450  MutS2 family protein  29.67 
 
 		 818 aa  82.4  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4380  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.46 
 
 		 786 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  28.29 
 
 		 828 aa  82.4  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0434  DNA mismatch repair protein MutS  28.79 
 
 		 853 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0558205  normal  0.0590484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5060  MutS2 family protein  26.79 
 
 		 802 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3486  putative MutS family protein  26.62 
 
 		 633 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.441527  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0335  DNA mismatch repair protein MutS  27.27 
 
 		 815 aa  83.2  0.00000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.213975  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1437  DNA mismatch repair protein MutS  29.84 
 
 		 870 aa  82.8  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.787998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0363  DNA mismatch repair protein MutS  29.48 
 
 		 882 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1760  DNA mismatch repair protein MutS  29.84 
 
 		 870 aa  82.8  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2655  DNA mismatch repair protein MutS  33.51 
 
 		 876 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.607224  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4296  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.46 
 
 		 786 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4794  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.46 
 
 		 786 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.167233  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0576  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.46 
 
 		 786 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01536  DNA mismatch repair protein MutS  30.59 
 
 		 851 aa  82.4  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1014  MutS2 family protein  29.44 
 
 		 793 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0625051  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  30.32 
 
 		 857 aa  82  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1299  DNA mismatch repair protein MutS  26.01 
 
 		 914 aa  82  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.141225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>