More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1537 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0434  DNA mismatch repair protein MutS  56.73 
 
 		 853 aa  858    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0558205  normal  0.0590484 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1520  DNA mismatch repair protein MutS  59.64 
 
 		 848 aa  886    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1537  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 880 aa  1732    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0458  DNA mismatch repair protein MutS  44.44 
 
 		 865 aa  625  1e-177  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143165  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0358  DNA mismatch repair protein MutS  47.27 
 
 		 918 aa  613  9.999999999999999e-175  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.613152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  43.02 
 
 		 917 aa  613  9.999999999999999e-175  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  42.89 
 
 		 893 aa  610  1e-173  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  38.29 
 
 		 873 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  41.66 
 
 		 857 aa  580  1e-164  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  38.21 
 
 		 887 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  38.82 
 
 		 870 aa  574  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  40.98 
 
 		 889 aa  570  1e-161  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  39.65 
 
 		 896 aa  568  1e-160  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  36.87 
 
 		 863 aa  566  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  45.05 
 
 		 956 aa  566  1e-160  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  35.81 
 
 		 867 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  43.16 
 
 		 865 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  38.62 
 
 		 857 aa  560  1e-158  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  43.45 
 
 		 863 aa  554  1e-156  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  38.87 
 
 		 900 aa  549  1e-155  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  39.33 
 
 		 869 aa  548  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  41.99 
 
 		 891 aa  548  1e-154  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  39.61 
 
 		 868 aa  548  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  37.27 
 
 		 932 aa  548  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  37.85 
 
 		 869 aa  547  1e-154  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  40.16 
 
 		 870 aa  545  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  43.16 
 
 		 882 aa  545  1e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  37.84 
 
 		 872 aa  540  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  37.97 
 
 		 881 aa  541  9.999999999999999e-153  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  41.18 
 
 		 882 aa  541  9.999999999999999e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  37.84 
 
 		 872 aa  540  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  41.24 
 
 		 872 aa  536  1e-151  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  38.95 
 
 		 892 aa  538  1e-151  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  37.16 
 
 		 910 aa  536  1e-151  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  39.86 
 
 		 871 aa  534  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  36.9 
 
 		 873 aa  533  1e-150  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  41.03 
 
 		 862 aa  534  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  41.03 
 
 		 903 aa  535  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  42.14 
 
 		 880 aa  533  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  39.26 
 
 		 872 aa  533  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  37.15 
 
 		 853 aa  534  1e-150  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  37.03 
 
 		 910 aa  535  1e-150  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  38.39 
 
 		 859 aa  535  1e-150  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  39.13 
 
 		 858 aa  530  1e-149  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  41.23 
 
 		 850 aa  531  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  37.23 
 
 		 860 aa  527  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  39.47 
 
 		 897 aa  529  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  40.8 
 
 		 872 aa  525  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  38.74 
 
 		 872 aa  524  1e-147  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  37.79 
 
 		 872 aa  523  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  40.28 
 
 		 862 aa  523  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  37.62 
 
 		 828 aa  523  1e-147  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1001  DNA mismatch repair protein MutS  37.11 
 
 		 819 aa  523  1e-147  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280502  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  39.16 
 
 		 858 aa  520  1e-146  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  38.86 
 
 		 875 aa  521  1e-146  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  39.91 
 
 		 861 aa  521  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  39.02 
 
 		 871 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  37.28 
 
 		 868 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  39.56 
 
 		 874 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  40.63 
 
 		 823 aa  518  1.0000000000000001e-145  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  40.71 
 
 		 854 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  38.23 
 
 		 793 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  38.61 
 
 		 856 aa  518  1.0000000000000001e-145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  39.98 
 
 		 855 aa  515  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  40.8 
 
 		 856 aa  514  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  40.1 
 
 		 863 aa  514  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  40.67 
 
 		 864 aa  514  1e-144  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1004  DNA mismatch repair protein MutS  36.19 
 
 		 817 aa  514  1e-144  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  40.16 
 
 		 855 aa  511  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  39.69 
 
 		 862 aa  510  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  40.42 
 
 		 861 aa  510  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  40.26 
 
 		 856 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  40.26 
 
 		 856 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  40.68 
 
 		 854 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  37.97 
 
 		 793 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  32.52 
 
 		 848 aa  508  9.999999999999999e-143  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  40.39 
 
 		 903 aa  508  9.999999999999999e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  40.19 
 
 		 861 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  36.94 
 
 		 854 aa  508  9.999999999999999e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  41.72 
 
 		 861 aa  509  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  37.33 
 
 		 881 aa  506  1e-141  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  40.14 
 
 		 856 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  40 
 
 		 856 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  40.2 
 
 		 858 aa  501  1e-140  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  42.51 
 
 		 898 aa  500  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  39.5 
 
 		 853 aa  501  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  39.49 
 
 		 859 aa  501  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  40.79 
 
 		 854 aa  502  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  40.33 
 
 		 863 aa  499  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  40.69 
 
 		 858 aa  499  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  40.16 
 
 		 884 aa  501  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  40.16 
 
 		 884 aa  501  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  37.78 
 
 		 840 aa  501  1e-140  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  38.31 
 
 		 870 aa  497  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  38.87 
 
 		 872 aa  496  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  37.94 
 
 		 873 aa  497  1e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2234  DNA mismatch repair protein MutS  33.15 
 
 		 894 aa  498  1e-139  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.282824  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  40.09 
 
 		 854 aa  498  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1486  DNA mismatch repair protein MutS  42.27 
 
 		 867 aa  498  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  34.98 
 
 		 852 aa  498  1e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>