More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1006 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1006  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  100 
 
 		 688 aa  1321    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2063  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  63.77 
 
 		 739 aa  814    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3631  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  67.51 
 
 		 694 aa  840    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2604  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  66.76 
 
 		 665 aa  764    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0194376  normal  0.689485 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1024  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  67.24 
 
 		 664 aa  853    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318391  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1044  hypothetical protein  34.88 
 
 		 719 aa  367  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1334  DNA mismatch repair protein MutS-like protein  32.38 
 
 		 700 aa  335  2e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000127118  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1046  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  34.9 
 
 		 678 aa  294  3e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0558977  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2432  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  35.17 
 
 		 589 aa  143  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00495271 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2660  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.11 
 
 		 595 aa  143  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0551  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  37.96 
 
 		 583 aa  137  7.000000000000001e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.27881  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1501  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.33 
 
 		 618 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1162  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  44.07 
 
 		 641 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.906748  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1014  MutS2 family protein  25.78 
 
 		 793 aa  79.7  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0625051  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05680  MutS2 family protein  29.27 
 
 		 791 aa  77.4  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1450  MutS2 family protein  28.3 
 
 		 818 aa  73.6  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3655  MutS2 family protein  28.95 
 
 		 780 aa  70.9  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0062  MutS2 family protein  25.84 
 
 		 826 aa  69.7  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21825  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1470  MutS2 family protein  26.19 
 
 		 792 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.471316  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  28.32 
 
 		 788 aa  68.6  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2780  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  22.6 
 
 		 705 aa  67.4  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383732 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2648  DNA-mismatch repair protein  25.88 
 
 		 797 aa  66.6  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.270427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0268  Smr protein/MutS2  27.42 
 
 		 805 aa  65.1  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0912246 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0999  Smr protein/MutS2  24.41 
 
 		 769 aa  64.7  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1457  Smr protein/MutS2  31.76 
 
 		 805 aa  64.3  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  28.63 
 
 		 786 aa  63.9  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4299  MutS2 family protein  27.15 
 
 		 812 aa  63.9  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0935  MutS2 family protein  29.55 
 
 		 785 aa  63.9  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0204  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  23.14 
 
 		 475 aa  63.5  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1412  MutS2 family protein  29.11 
 
 		 783 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29197e-17 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2054  DNA mismatch repair protein MutS-like  27.04 
 
 		 771 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  29.38 
 
 		 789 aa  62.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5060  MutS2 family protein  26.34 
 
 		 802 aa  62  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1159  DNA mismatch repair protein MutS  41.25 
 
 		 850 aa  62  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0179722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1638  MutS2 family protein  26.32 
 
 		 782 aa  61.6  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00924497  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3819  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  26.99 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081272  normal  0.267024 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0299  MutS2 family protein  33.33 
 
 		 803 aa  60.8  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1493  MutS2 family protein  25.51 
 
 		 757 aa  60.8  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1541  MutS2 family protein  25.51 
 
 		 757 aa  60.8  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1619  DNA mismatch repair protein MutS  32.18 
 
 		 897 aa  60.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.510747 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  28.09 
 
 		 856 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34085  predicted protein  29.11 
 
 		 1007 aa  59.7  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.297969  normal  0.623648 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0545  MutS2 family protein  33.82 
 
 		 775 aa  59.3  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.807648  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2798  MutS2 family protein  28.48 
 
 		 783 aa  59.7  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  28.09 
 
 		 861 aa  58.9  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1809  MutS family DNA structure-specific ATPase  20.5 
 
 		 776 aa  58.9  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.284001  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  28.09 
 
 		 856 aa  58.5  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  30.73 
 
 		 858 aa  58.5  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1336  MutS2 family protein  25.71 
 
 		 781 aa  58.5  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2782  MutS2 family protein  28.57 
 
 		 785 aa  58.2  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798995  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  28.09 
 
 		 856 aa  58.2  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  28.09 
 
 		 856 aa  58.2  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0784  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.25 
 
 		 529 aa  58.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1368  Smr protein/MutS2  29.7 
 
 		 771 aa  58.2  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1356  MutS2 family protein  28.1 
 
 		 794 aa  57.8  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37894  predicted protein  28.33 
 
 		 502 aa  57.8  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.525832 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1108  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  27.69 
 
 		 782 aa  57.8  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0684525  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1308  MutS2 family protein  24.53 
 
 		 778 aa  57.8  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  28.09 
 
 		 856 aa  57.8  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  28.09 
 
 		 856 aa  57.4  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1710  MutS2 family protein  24.81 
 
 		 820 aa  57.4  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.261707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1642  MutS2 family protein  22.75 
 
 		 787 aa  56.6  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000590377  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05320  meiotic recombination-related protein, putative  26.67 
 
 		 937 aa  57  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  26.88 
 
 		 880 aa  57  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0047  DNA mismatch repair protein MutS  31.95 
 
 		 908 aa  56.6  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.967716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4031  DNA mismatch repair protein MutS  30.3 
 
 		 881 aa  57  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137829  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  27.53 
 
 		 861 aa  57  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  31.45 
 
 		 930 aa  57.4  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0634  MutS2 family protein  28.66 
 
 		 779 aa  56.2  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0621  DNA mismatch repair protein MutS  29.57 
 
 		 905 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.720679  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  22.97 
 
 		 869 aa  56.2  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1218  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  26.94 
 
 		 654 aa  56.6  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215011  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2974  MutS 2 protein  28.98 
 
 		 785 aa  56.6  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  28.92 
 
 		 859 aa  56.6  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1433  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  27.6 
 
 		 648 aa  56.2  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00229473  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  33.07 
 
 		 761 aa  55.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  32.56 
 
 		 872 aa  56.6  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0734  MutS2 family protein  28.57 
 
 		 780 aa  55.8  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.11062  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  30.56 
 
 		 855 aa  56.2  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  31.16 
 
 		 784 aa  55.5  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2046  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  23.75 
 
 		 791 aa  55.5  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  33.53 
 
 		 878 aa  55.8  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4649  DNA mismatch repair protein MutS  30.77 
 
 		 916 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.427089 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2655  DNA mismatch repair protein MutS  27.83 
 
 		 876 aa  55.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.607224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  24.82 
 
 		 869 aa  55.8  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1657  DNA mismatch repair protein MutS  41.98 
 
 		 868 aa  55.5  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1072  MutS family protein  31.58 
 
 		 463 aa  55.5  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.6736 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  20.46 
 
 		 853 aa  55.1  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0730  MutS2 family protein  26 
 
 		 804 aa  55.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2632  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  24.61 
 
 		 784 aa  54.7  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176007  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2159  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  27.09 
 
 		 522 aa  54.7  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0547  MutS2 family protein  32.91 
 
 		 792 aa  54.7  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0190  DNA mismatch repair protein MutS  28.3 
 
 		 820 aa  54.7  0.000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4282  DNA mismatch repair protein MutS  30.77 
 
 		 916 aa  54.7  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  38.96 
 
 		 855 aa  54.7  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  26.32 
 
 		 881 aa  54.7  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1181  DNA mismatch repair protein MutS  24.91 
 
 		 927 aa  54.7  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  30.97 
 
 		 891 aa  54.3  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0032  DNA mismatch repair protein MutS  31.36 
 
 		 880 aa  54.3  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  26.92 
 
 		 862 aa  54.3  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>