More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2660 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1162  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  77.85 
 
 		 641 aa  940    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.906748  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2432  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  65.71 
 
 		 589 aa  690    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00495271 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2660  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  100 
 
 		 595 aa  1146    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0551  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  63.39 
 
 		 583 aa  629  1e-179  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.27881  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1501  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  58.84 
 
 		 618 aa  623  1e-177  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1044  hypothetical protein  30.65 
 
 		 719 aa  176  8e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1024  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  36.62 
 
 		 664 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318391  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1334  DNA mismatch repair protein MutS-like protein  29.98 
 
 		 700 aa  158  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000127118  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1046  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  36.95 
 
 		 678 aa  155  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0558977  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3631  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  36.67 
 
 		 694 aa  147  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1006  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.11 
 
 		 688 aa  142  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2063  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.44 
 
 		 739 aa  135  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2604  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.47 
 
 		 665 aa  126  9e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0194376  normal  0.689485 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  25.16 
 
 		 863 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  26.69 
 
 		 828 aa  72.8  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4299  MutS2 family protein  28.97 
 
 		 812 aa  70.1  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  28.7 
 
 		 893 aa  68.9  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0935  MutS2 family protein  29.5 
 
 		 785 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1152  MutS2 family protein  22.62 
 
 		 757 aa  67.4  0.0000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  32.34 
 
 		 788 aa  67.4  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  26.2 
 
 		 896 aa  66.6  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  22.22 
 
 		 863 aa  66.2  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01708  protein required for mismatch repair in mitosis and meiosis (Eurofung)  25.58 
 
 		 1186 aa  65.5  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  22.42 
 
 		 853 aa  64.3  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  26.3 
 
 		 871 aa  63.5  0.000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2159  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  25.74 
 
 		 522 aa  63.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  26.96 
 
 		 750 aa  62.8  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0062  MutS2 family protein  23.32 
 
 		 826 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21825  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1356  MutS2 family protein  25.62 
 
 		 794 aa  61.6  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0384  MutS2 family protein  22.09 
 
 		 840 aa  61.2  0.00000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3337  DNA mismatch repair protein MutS  25 
 
 		 864 aa  61.2  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  25.68 
 
 		 786 aa  60.8  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2651  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  23.94 
 
 		 798 aa  60.1  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.530364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0268  Smr protein/MutS2  27.62 
 
 		 805 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0912246 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0204  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  22.69 
 
 		 475 aa  60.1  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0342  MutS family DNA mismatch repair protein  32.5 
 
 		 536 aa  58.9  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  26.29 
 
 		 881 aa  59.3  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  23.38 
 
 		 872 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  27.94 
 
 		 856 aa  59.3  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  26.36 
 
 		 874 aa  58.9  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2274  DNA mismatch repair protein MutS  25.97 
 
 		 911 aa  58.9  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3819  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.36 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081272  normal  0.267024 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  25.2 
 
 		 892 aa  58.5  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  28.23 
 
 		 789 aa  58.9  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1737  MutS family DNA structure-specific ATPase  22.52 
 
 		 783 aa  58.5  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1083  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  23.83 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0434  DNA mismatch repair protein MutS  26.08 
 
 		 853 aa  58.2  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0558205  normal  0.0590484 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1070  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  26.49 
 
 		 593 aa  57.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1004  DNA mismatch repair protein MutS  21.16 
 
 		 817 aa  58.2  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  25.34 
 
 		 898 aa  57.8  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3655  MutS2 family protein  21.83 
 
 		 780 aa  57.4  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2054  DNA mismatch repair protein MutS-like  28.57 
 
 		 771 aa  57.8  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  25.1 
 
 		 889 aa  57.4  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1412  MutS2 family protein  30.71 
 
 		 783 aa  57.4  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29197e-17 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1920  MutS2 family protein  24.3 
 
 		 760 aa  57.4  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.380002  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2798  MutS2 family protein  30.71 
 
 		 783 aa  57.4  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81012  Mismatch repair ATPase MSH6 (MutS family)  26.97 
 
 		 1212 aa  57.4  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0833152 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  27.81 
 
 		 917 aa  57  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02583  DNA mismatch repair protein  27.01 
 
 		 853 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.858461  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0955  DNA mismatch repair protein MutS  27.01 
 
 		 853 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  32.77 
 
 		 761 aa  57  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0979  DNA mismatch repair protein MutS  27.01 
 
 		 853 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.462533 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  25.21 
 
 		 875 aa  57  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2860  DNA mismatch repair protein MutS  27.01 
 
 		 853 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3030  DNA mismatch repair protein MutS  27.01 
 
 		 860 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2871  DNA mismatch repair protein MutS  27.01 
 
 		 853 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3986  DNA mismatch repair protein MutS  27.01 
 
 		 853 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.724345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  25.94 
 
 		 870 aa  56.6  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0509  MutS2 family protein  25 
 
 		 799 aa  56.6  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0204433  normal  0.523172 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3143  DNA mismatch repair protein MutS  27.01 
 
 		 853 aa  56.6  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1897  MutS2 family protein  31.17 
 
 		 767 aa  56.6  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.557227  normal  0.0324553 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02548  hypothetical protein  27.01 
 
 		 853 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766489  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1359  DNA mismatch repair protein MutS  24.72 
 
 		 870 aa  56.6  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219365  normal  0.0149931 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1014  MutS2 family protein  23.32 
 
 		 793 aa  56.6  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0625051  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0496  Smr protein/MutS2  31.47 
 
 		 817 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00013691 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2031  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  24.45 
 
 		 723 aa  56.2  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  24.59 
 
 		 869 aa  56.2  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  25.95 
 
 		 823 aa  55.8  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0159  DNA mismatch repair protein MutS  24.93 
 
 		 910 aa  55.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1785  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  32.26 
 
 		 505 aa  55.5  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0257213  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53969  predicted protein  29.17 
 
 		 1423 aa  55.1  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0030  DNA mismatch repair protein MutS  27 
 
 		 915 aa  55.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355609 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0335  DNA mismatch repair protein MutS  32.95 
 
 		 815 aa  55.5  0.000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.213975  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1087  Smr protein/MutS2  29.63 
 
 		 817 aa  55.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1828  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  32.79 
 
 		 505 aa  55.5  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.338904  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_52173  muts-like protein 5  23.02 
 
 		 376 aa  55.1  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  24.77 
 
 		 864 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03891  putative DNA mismatch repair protein MutS family protein  24.62 
 
 		 828 aa  55.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.331058 
 
 
-
 
NC_002950  PG1072  MutS family protein  24.42 
 
 		 463 aa  55.1  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.6736 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01700  conserved hypothetical protein  29.25 
 
 		 1057 aa  55.1  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3263  DNA mismatch repair protein MutS  25.27 
 
 		 889 aa  55.1  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  30.37 
 
 		 784 aa  55.1  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  27.17 
 
 		 854 aa  55.1  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  31.36 
 
 		 865 aa  54.3  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1486  DNA mismatch repair protein MutS  26.67 
 
 		 867 aa  54.3  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0174  DNA mismatch repair protein MutS  26.62 
 
 		 820 aa  54.3  0.000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0547  MutS2 family protein  32.09 
 
 		 792 aa  53.9  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  32.28 
 
 		 880 aa  54.3  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2782  MutS2 family protein  26.47 
 
 		 785 aa  53.9  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798995  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1166  DNA mismatch repair protein MutS  25 
 
 		 863 aa  53.9  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>