285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2063 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1006  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  64.46 
 
 		 688 aa  806    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1024  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  62.55 
 
 		 664 aa  800    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318391  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2063  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  100 
 
 		 739 aa  1432    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2604  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  63.55 
 
 		 665 aa  758    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0194376  normal  0.689485 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3631  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  80.31 
 
 		 694 aa  1059    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1044  hypothetical protein  36.65 
 
 		 719 aa  382  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1334  DNA mismatch repair protein MutS-like protein  32.98 
 
 		 700 aa  354  4e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000127118  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1046  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  35.16 
 
 		 678 aa  302  1e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0558977  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2660  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.76 
 
 		 595 aa  135  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1162  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  44.77 
 
 		 641 aa  129  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.906748  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2432  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.85 
 
 		 589 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00495271 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0551  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  42.41 
 
 		 583 aa  127  8.000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.27881  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1501  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  41.14 
 
 		 618 aa  122  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1470  MutS2 family protein  29.31 
 
 		 792 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.471316  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  32.95 
 
 		 788 aa  73.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2054  DNA mismatch repair protein MutS-like  27.68 
 
 		 771 aa  68.9  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  27.8 
 
 		 956 aa  68.2  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1412  MutS2 family protein  27.75 
 
 		 783 aa  67.4  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29197e-17 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4299  MutS2 family protein  25.91 
 
 		 812 aa  65.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2798  MutS2 family protein  28.25 
 
 		 783 aa  65.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1450  MutS2 family protein  25.19 
 
 		 818 aa  65.1  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0935  MutS2 family protein  30.23 
 
 		 785 aa  65.1  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0342  MutS family DNA mismatch repair protein  32.39 
 
 		 536 aa  63.9  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34085  predicted protein  34.38 
 
 		 1007 aa  63.9  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.297969  normal  0.623648 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2046  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  26.01 
 
 		 791 aa  63.5  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1014  MutS2 family protein  28.14 
 
 		 793 aa  63.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0625051  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3819  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.06 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081272  normal  0.267024 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1457  Smr protein/MutS2  30.38 
 
 		 805 aa  62.4  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3655  MutS2 family protein  23.67 
 
 		 780 aa  62  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  31.68 
 
 		 786 aa  61.6  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0913  DNA mismatch repair protein MutS  32.7 
 
 		 882 aa  61.6  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4031  DNA mismatch repair protein MutS  32.92 
 
 		 881 aa  61.2  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137829  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05680  MutS2 family protein  25.64 
 
 		 791 aa  60.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  29.34 
 
 		 750 aa  60.1  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  30.25 
 
 		 784 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  33.33 
 
 		 873 aa  59.3  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2782  MutS2 family protein  29.89 
 
 		 785 aa  59.7  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798995  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1433  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.03 
 
 		 648 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00229473  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0153  MutS2 family protein  27.75 
 
 		 796 aa  60.1  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323958  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1638  MutS2 family protein  30.99 
 
 		 782 aa  59.3  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00924497  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0999  Smr protein/MutS2  28.39 
 
 		 769 aa  58.9  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0204  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  28.21 
 
 		 475 aa  58.5  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1541  MutS2 family protein  29.25 
 
 		 757 aa  58.5  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1493  MutS2 family protein  29.25 
 
 		 757 aa  58.5  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4649  DNA mismatch repair protein MutS  32.5 
 
 		 916 aa  58.2  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.427089 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1336  MutS2 family protein  29.52 
 
 		 781 aa  58.2  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  34.46 
 
 		 761 aa  58.2  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0423  DNA mismatch repair protein MutS  31.06 
 
 		 883 aa  58.2  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0299  MutS2 family protein  33.33 
 
 		 803 aa  58.2  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0614  DNA mismatch repair protein MutS  29.17 
 
 		 907 aa  57.4  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  31.08 
 
 		 893 aa  57.4  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  26.9 
 
 		 789 aa  57  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4282  DNA mismatch repair protein MutS  32.5 
 
 		 916 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0621  DNA mismatch repair protein MutS  31.68 
 
 		 905 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.720679  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0824  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.08 
 
 		 792 aa  57.4  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0190  DNA mismatch repair protein MutS  26.63 
 
 		 820 aa  56.2  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1897  MutS2 family protein  27.98 
 
 		 767 aa  56.6  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.557227  normal  0.0324553 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53933  predicted protein  30.47 
 
 		 1258 aa  56.2  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1809  MutS family DNA structure-specific ATPase  25.79 
 
 		 776 aa  56.6  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.284001  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0827  DNA mismatch repair protein MutS  26.84 
 
 		 878 aa  56.2  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133627  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0147  DNA mismatch repair protein MutS  31.1 
 
 		 910 aa  55.5  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0142  DNA mismatch repair protein MutS  31.1 
 
 		 898 aa  55.5  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0062  MutS2 family protein  22.87 
 
 		 826 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21825  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4799  DNA mismatch repair protein MutS  31.87 
 
 		 896 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.720607 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4891  MutS2 family protein  28.49 
 
 		 806 aa  55.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  31.9 
 
 		 863 aa  55.1  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0624  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.89 
 
 		 977 aa  55.1  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7642  DNA mismatch repair protein MutS  30.25 
 
 		 910 aa  55.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.532158 
 
 
-
 
NC_002950  PG1072  MutS family protein  29.09 
 
 		 463 aa  55.1  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.6736 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2974  MutS 2 protein  28.49 
 
 		 785 aa  55.1  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1299  DNA mismatch repair protein MutS  27.75 
 
 		 914 aa  55.1  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.141225  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0159  DNA mismatch repair protein MutS  30.49 
 
 		 910 aa  54.7  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  32.45 
 
 		 930 aa  54.7  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1689  Smr protein/MutS2  28.82 
 
 		 793 aa  54.3  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0545  MutS2 family protein  32.89 
 
 		 775 aa  54.3  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.807648  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5060  MutS2 family protein  28.32 
 
 		 802 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  29.8 
 
 		 880 aa  53.9  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1218  DNA mismatch repair protein MutS  28.11 
 
 		 875 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.318661  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2655  DNA mismatch repair protein MutS  28.41 
 
 		 876 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.607224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0634  MutS2 family protein  24.57 
 
 		 779 aa  53.5  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0727  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  25.15 
 
 		 782 aa  53.1  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47730  predicted protein  26.35 
 
 		 1085 aa  53.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3240  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.21 
 
 		 786 aa  53.1  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  28.29 
 
 		 903 aa  53.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0458  DNA mismatch repair protein MutS  30.34 
 
 		 865 aa  52.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143165  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  29.52 
 
 		 871 aa  53.5  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2879  DNA mismatch repair protein MutS  28.11 
 
 		 880 aa  53.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0490  DNA mismatch repair protein MutS  28.32 
 
 		 888 aa  52.4  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2680  mismatch repair ATPase  27.78 
 
 		 788 aa  52.4  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0447  DNA mismatch repair protein MutS-like  27.37 
 
 		 789 aa  52.4  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0528  DNA mismatch repair protein MutS  29.63 
 
 		 911 aa  52.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0799066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1920  MutS2 family protein  29.14 
 
 		 760 aa  52.4  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.380002  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2284  DNA mismatch repair protein MutS  29.78 
 
 		 897 aa  52  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.339354  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1813  MutS2 family protein  25.29 
 
 		 796 aa  52  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.572275 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2875  DNA mismatch repair protein MutS  26.56 
 
 		 879 aa  52  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.928835 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0734  MutS2 family protein  25.88 
 
 		 780 aa  52  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.11062  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3706  DNA mismatch repair protein MutS  28.21 
 
 		 1085 aa  52  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0191943 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  28.25 
 
 		 854 aa  52  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0513  DNA mismatch repair protein MutS  29.01 
 
 		 907 aa  52  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  26.82 
 
 		 863 aa  52  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>