More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_53933 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_53933  predicted protein  100 
 
 		 1258 aa  2595    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34085  predicted protein  35.36 
 
 		 1007 aa  406  1e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.297969  normal  0.623648 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  35.34 
 
 		 905 aa  112  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1250  DNA mismatch repair protein MutS  37.76 
 
 		 823 aa  110  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.297858  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  36.23 
 
 		 853 aa  108  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  36.54 
 
 		 855 aa  108  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  36.54 
 
 		 855 aa  108  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  36.54 
 
 		 855 aa  108  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  36.54 
 
 		 855 aa  108  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  36.54 
 
 		 855 aa  108  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  36.6 
 
 		 863 aa  108  8e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02583  DNA mismatch repair protein  36.06 
 
 		 853 aa  106  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.858461  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0955  DNA mismatch repair protein MutS  36.06 
 
 		 853 aa  106  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0979  DNA mismatch repair protein MutS  36.06 
 
 		 853 aa  106  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.462533 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02548  hypothetical protein  36.06 
 
 		 853 aa  106  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766489  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2871  DNA mismatch repair protein MutS  36.06 
 
 		 853 aa  106  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3986  DNA mismatch repair protein MutS  36.06 
 
 		 853 aa  106  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.724345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3030  DNA mismatch repair protein MutS  36.06 
 
 		 860 aa  107  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  36.45 
 
 		 856 aa  107  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2860  DNA mismatch repair protein MutS  36.06 
 
 		 853 aa  106  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  35.29 
 
 		 900 aa  106  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19604  predicted protein  34.11 
 
 		 363 aa  103  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0273  DNA mismatch repair protein MutS  34.23 
 
 		 1040 aa  104  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.601662 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  36.06 
 
 		 854 aa  104  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  27.78 
 
 		 873 aa  103  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3143  DNA mismatch repair protein MutS  35.58 
 
 		 853 aa  103  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2017  DNA mismatch repair protein MutS  35.68 
 
 		 1014 aa  103  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2234  DNA mismatch repair protein MutS  33.86 
 
 		 894 aa  103  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.282824  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1437  DNA mismatch repair protein MutS  36.73 
 
 		 870 aa  103  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.787998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1760  DNA mismatch repair protein MutS  36.73 
 
 		 870 aa  103  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  28.57 
 
 		 910 aa  103  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3424  DNA mismatch repair protein MutS  37.17 
 
 		 851 aa  103  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  37.17 
 
 		 851 aa  103  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  37.17 
 
 		 851 aa  103  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  37.17 
 
 		 851 aa  103  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  34.31 
 
 		 896 aa  102  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  36 
 
 		 862 aa  102  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  32.7 
 
 		 793 aa  102  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  32.7 
 
 		 793 aa  102  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  35.68 
 
 		 854 aa  102  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  36.65 
 
 		 854 aa  102  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01708  protein required for mismatch repair in mitosis and meiosis (Eurofung)  37.43 
 
 		 1186 aa  101  7e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  33.5 
 
 		 871 aa  100  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  35.1 
 
 		 852 aa  100  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  33.47 
 
 		 846 aa  100  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  32.71 
 
 		 869 aa  100  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3706  DNA mismatch repair protein MutS  29.81 
 
 		 1085 aa  101  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0191943 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  34.33 
 
 		 853 aa  100  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  33.65 
 
 		 872 aa  100  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0247  DNA mismatch repair protein MutS  35.79 
 
 		 1058 aa  100  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  34.74 
 
 		 867 aa  100  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1001  DNA mismatch repair protein MutS  32.65 
 
 		 819 aa  100  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280502  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  34.48 
 
 		 904 aa  100  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0913  DNA mismatch repair protein MutS  36.79 
 
 		 882 aa  100  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1075  DNA mismatch repair protein MutS  34.05 
 
 		 916 aa  100  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835373  normal  0.410772 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  32.39 
 
 		 872 aa  100  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  36.46 
 
 		 932 aa  99.8  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  32.83 
 
 		 869 aa  99.8  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  32.39 
 
 		 872 aa  100  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3531  DNA mismatch repair protein MutS  34.78 
 
 		 1088 aa  99.4  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  33.82 
 
 		 855 aa  99.4  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  34.15 
 
 		 853 aa  99.4  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1299  DNA mismatch repair protein MutS  32 
 
 		 914 aa  99  5e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.141225  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  35.11 
 
 		 868 aa  99  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0434  DNA mismatch repair protein MutS  36.32 
 
 		 853 aa  99  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0558205  normal  0.0590484 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  34.38 
 
 		 855 aa  99  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  32.93 
 
 		 846 aa  98.6  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  36.6 
 
 		 956 aa  98.6  7e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  34.55 
 
 		 872 aa  98.6  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0621  DNA mismatch repair protein MutS  35.27 
 
 		 905 aa  98.6  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.720679  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  34.03 
 
 		 856 aa  98.6  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  33.67 
 
 		 856 aa  98.2  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  29.02 
 
 		 828 aa  98.2  8e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  36.73 
 
 		 862 aa  97.8  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0190  DNA mismatch repair protein MutS  32.66 
 
 		 820 aa  97.8  1e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  31.95 
 
 		 881 aa  97.8  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  34.03 
 
 		 856 aa  97.8  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01700  conserved hypothetical protein  32.47 
 
 		 1057 aa  97.4  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02590  mismatch repair-related protein, putative  35.1 
 
 		 1205 aa  97.8  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.102659  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0335  DNA mismatch repair protein MutS  27.22 
 
 		 815 aa  97.4  1e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.213975  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0423  DNA mismatch repair protein MutS  34.54 
 
 		 883 aa  97.8  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  38.95 
 
 		 873 aa  97.8  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  33.33 
 
 		 861 aa  97.4  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  33.33 
 
 		 860 aa  97.8  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0159  DNA mismatch repair protein MutS  35.29 
 
 		 910 aa  97.8  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  34.03 
 
 		 856 aa  97.1  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  35.94 
 
 		 863 aa  97.1  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  33.33 
 
 		 871 aa  97.1  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  34.74 
 
 		 887 aa  97.1  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  33.16 
 
 		 856 aa  97.1  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0209  DNA mismatch repair protein MutS  35.83 
 
 		 855 aa  97.1  2e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2875  DNA mismatch repair protein MutS  31.84 
 
 		 879 aa  96.7  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.928835 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  33.67 
 
 		 861 aa  96.7  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  32.99 
 
 		 869 aa  96.3  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  33.67 
 
 		 854 aa  96.7  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  35.42 
 
 		 870 aa  96.3  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  33.94 
 
 		 873 aa  96.7  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  33.16 
 
 		 856 aa  96.3  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  31.25 
 
 		 840 aa  96.7  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  33.51 
 
 		 857 aa  96.3  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>