More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0273 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  39.64 
 
 
857 aa  637    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  0.000000000609956 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  39.56 
 
 
857 aa  642    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  40.26 
 
 
855 aa  653    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  39.88 
 
 
855 aa  652    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  40.26 
 
 
855 aa  646    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  40.1 
 
 
859 aa  647    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0247  DNA mismatch repair protein MutS  83.58 
 
 
1058 aa  1783    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  39.17 
 
 
860 aa  642    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  39.35 
 
 
880 aa  640    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2017  DNA mismatch repair protein MutS  57.43 
 
 
1014 aa  1110    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0273  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 
1040 aa  2151    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.601662 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  39.88 
 
 
855 aa  653    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  39.66 
 
 
857 aa  645    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  38.18 
 
 
859 aa  634  1e-180  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  38.28 
 
 
871 aa  634  1e-180  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  40.2 
 
 
863 aa  631  1e-179  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  38.69 
 
 
883 aa  628  1e-178  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  39.61 
 
 
881 aa  619  1e-176  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  38.46 
 
 
859 aa  617  1e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  38.58 
 
 
854 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  38.33 
 
 
872 aa  610  1e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  38.99 
 
 
862 aa  612  1e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  38.2 
 
 
860 aa  606  9.999999999999999e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  37.45 
 
 
874 aa  608  9.999999999999999e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  37.92 
 
 
855 aa  608  9.999999999999999e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  38.78 
 
 
846 aa  603  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  38.68 
 
 
846 aa  604  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1146  DNA mismatch repair protein MutS  38.42 
 
 
858 aa  601  1e-170  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  37.71 
 
 
856 aa  600  1e-170  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0670  DNA mismatch repair protein MutS  37.67 
 
 
902 aa  599  1e-170  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.48055  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1166  DNA mismatch repair protein MutS  38.2 
 
 
863 aa  600  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01536  DNA mismatch repair protein MutS  37.93 
 
 
851 aa  600  1e-170  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  38.19 
 
 
853 aa  595  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  37.67 
 
 
853 aa  594  1e-168  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  38 
 
 
878 aa  592  1e-168  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  37.31 
 
 
854 aa  590  1e-167  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  38.06 
 
 
887 aa  590  1e-167  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  38.01 
 
 
884 aa  590  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  38.01 
 
 
884 aa  590  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  37.34 
 
 
851 aa  591  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  37.13 
 
 
856 aa  590  1e-167  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1913  DNA mismatch repair protein MutS  37.18 
 
 
893 aa  586  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.396246  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  36.9 
 
 
861 aa  587  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  37 
 
 
861 aa  586  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2520  DNA mismatch repair protein MutS  38.1 
 
 
894 aa  587  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00821283  hitchhiker  0.000000391787 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  37.2 
 
 
854 aa  585  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  36.79 
 
 
861 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3263  DNA mismatch repair protein MutS  37.18 
 
 
889 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  36.82 
 
 
856 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  36.83 
 
 
856 aa  579  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2612  DNA mismatch repair protein MutS  37.28 
 
 
939 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1671  DNA mismatch repair protein MutS  37.18 
 
 
891 aa  579  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207117  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1089  DNA mismatch repair protein MutS  37.91 
 
 
882 aa  581  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  36.92 
 
 
856 aa  582  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  37.45 
 
 
854 aa  579  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3424  DNA mismatch repair protein MutS  37.14 
 
 
851 aa  581  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  37.41 
 
 
852 aa  580  1e-164  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1446  DNA mismatch repair protein MutS  37.18 
 
 
939 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  36.92 
 
 
856 aa  582  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  37.24 
 
 
851 aa  580  1e-164  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  37.24 
 
 
851 aa  582  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3145  DNA mismatch repair protein MutS  37.18 
 
 
939 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  36.72 
 
 
861 aa  580  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2173  DNA mismatch repair protein MutS  37.18 
 
 
939 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.01775  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  36.87 
 
 
853 aa  580  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2691  DNA mismatch repair protein MutS  37.05 
 
 
938 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0407651  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0993  DNA mismatch repair protein MutS  37.92 
 
 
882 aa  579  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0273389  normal  0.417331 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  35.96 
 
 
871 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  37.35 
 
 
854 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  36.57 
 
 
863 aa  578  1.0000000000000001e-163  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  36.82 
 
 
856 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  37.54 
 
 
862 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2860  DNA mismatch repair protein MutS  36.63 
 
 
853 aa  575  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1619  DNA mismatch repair protein MutS  37.48 
 
 
897 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.510747 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  35.9 
 
 
859 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  36.28 
 
 
855 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1617  DNA mismatch repair protein MutS  38.22 
 
 
878 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  36.38 
 
 
855 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2559  DNA mismatch repair protein MutS  37.18 
 
 
891 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  36.38 
 
 
855 aa  575  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1998  DNA mismatch repair protein MutS  36.91 
 
 
885 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000368418 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  36 
 
 
855 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2124  DNA mismatch repair protein MutS  37.15 
 
 
886 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  36.38 
 
 
855 aa  575  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  36.38 
 
 
855 aa  575  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02583  DNA mismatch repair protein  36.44 
 
 
853 aa  572  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.858461  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0955  DNA mismatch repair protein MutS  36.44 
 
 
853 aa  572  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3143  DNA mismatch repair protein MutS  36.24 
 
 
853 aa  570  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2871  DNA mismatch repair protein MutS  36.44 
 
 
853 aa  572  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3030  DNA mismatch repair protein MutS  36.38 
 
 
860 aa  571  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  37.14 
 
 
856 aa  570  1e-161  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02548  hypothetical protein  36.44 
 
 
853 aa  572  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766489  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3986  DNA mismatch repair protein MutS  36.44 
 
 
853 aa  571  1e-161  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.724345  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1238  DNA mismatch repair protein MutS  37.88 
 
 
858 aa  570  1e-161  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0979  DNA mismatch repair protein MutS  36.44 
 
 
853 aa  572  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.462533 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5989  DNA mismatch repair protein MutS  37.07 
 
 
885 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1282  DNA mismatch repair protein MutS  37.41 
 
 
862 aa  568  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0209  DNA mismatch repair protein MutS  37.64 
 
 
855 aa  566  1e-160  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1399  DNA mismatch repair protein MutS  37.89 
 
 
892 aa  567  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000434224 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  35.87 
 
 
858 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>