More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1046 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1046  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  100 
 
 		 678 aa  1350    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0558977  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1044  hypothetical protein  37.66 
 
 		 719 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1334  DNA mismatch repair protein MutS-like protein  35.4 
 
 		 700 aa  397  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000127118  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1024  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  38.45 
 
 		 664 aa  322  1.9999999999999998e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318391  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3631  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  36.7 
 
 		 694 aa  311  4e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2063  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  35.35 
 
 		 739 aa  310  6.999999999999999e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1006  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  35.33 
 
 		 688 aa  296  8e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2604  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  35.79 
 
 		 665 aa  283  1e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0194376  normal  0.689485 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1501  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  36.25 
 
 		 618 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2660  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  36.95 
 
 		 595 aa  156  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2432  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  37.86 
 
 		 589 aa  153  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00495271 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0551  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  36.51 
 
 		 583 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.27881  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1162  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  41.94 
 
 		 641 aa  144  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.906748  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2046  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  27.24 
 
 		 791 aa  79.7  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0935  MutS2 family protein  29.21 
 
 		 785 aa  79  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1014  MutS2 family protein  24.37 
 
 		 793 aa  75.1  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0625051  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0538  MutS2 family protein  28.85 
 
 		 791 aa  74.7  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00387352  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2974  MutS 2 protein  27.45 
 
 		 785 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1470  MutS2 family protein  26.88 
 
 		 792 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.471316  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2135  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.08 
 
 		 786 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1847  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.08 
 
 		 786 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1486  DNA mismatch repair protein MutS  31.2 
 
 		 867 aa  72.4  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  28.28 
 
 		 786 aa  72  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  29.12 
 
 		 864 aa  71.6  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1638  MutS2 family protein  24.65 
 
 		 782 aa  71.2  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00924497  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0727  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  26.3 
 
 		 782 aa  70.1  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1308  MutS2 family protein  28.11 
 
 		 778 aa  70.5  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0547  MutS2 family protein  27.32 
 
 		 792 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0634  MutS2 family protein  26.63 
 
 		 779 aa  69.3  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1711  MutS2 family protein  28.02 
 
 		 801 aa  69.3  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000187694  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0195  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  28.39 
 
 		 446 aa  69.3  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1031  DNA mismatch repair protein MutS  25.86 
 
 		 851 aa  68.9  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0268  Smr protein/MutS2  28.7 
 
 		 805 aa  68.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0912246 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  27.16 
 
 		 784 aa  68.6  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2782  MutS2 family protein  26.99 
 
 		 785 aa  68.2  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798995  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05680  MutS2 family protein  27.12 
 
 		 791 aa  68.2  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  26.67 
 
 		 788 aa  67.8  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  30.2 
 
 		 857 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.121513 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03749  DNA mismatch repair protein msh3 (MutS protein homolog 3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B6T1]  29.26 
 
 		 1091 aa  67.4  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.642565  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  30.2 
 
 		 857 aa  67.4  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0426  mismatch repair ATPase  30.43 
 
 		 791 aa  67.4  0.0000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00172781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1225  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  25.56 
 
 		 782 aa  67  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  27.4 
 
 		 868 aa  66.6  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1336  MutS2 family protein  26.4 
 
 		 781 aa  67  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1203  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  25.56 
 
 		 782 aa  67  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1108  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.34 
 
 		 782 aa  67  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0684525  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  29.53 
 
 		 857 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  0.000000000609956 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  27.45 
 
 		 873 aa  65.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  26.98 
 
 		 870 aa  66.2  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  30.18 
 
 		 855 aa  66.2  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  30.2 
 
 		 880 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  27.86 
 
 		 853 aa  66.2  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1642  MutS2 family protein  24.79 
 
 		 787 aa  66.2  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000590377  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2632  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  27.95 
 
 		 784 aa  65.5  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176007  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  29.53 
 
 		 860 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  26.18 
 
 		 855 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  28.37 
 
 		 750 aa  65.1  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  27.57 
 
 		 859 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  29.22 
 
 		 872 aa  64.3  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0204  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  25.53 
 
 		 475 aa  64.3  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  23.18 
 
 		 860 aa  63.9  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  29.67 
 
 		 855 aa  63.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  27.87 
 
 		 859 aa  63.2  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3655  MutS2 family protein  23.5 
 
 		 780 aa  63.5  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0342  MutS family DNA mismatch repair protein  29.75 
 
 		 536 aa  62.8  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2798  MutS2 family protein  27.24 
 
 		 783 aa  63.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  29.1 
 
 		 868 aa  63.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  26.51 
 
 		 868 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2648  DNA-mismatch repair protein  24.73 
 
 		 797 aa  63.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.270427  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.28 
 
 		 786 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0381928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4662  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.28 
 
 		 786 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0676128  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4447  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.28 
 
 		 786 aa  62  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4285  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.28 
 
 		 786 aa  62  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4296  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.28 
 
 		 786 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  27.78 
 
 		 900 aa  62.4  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4665  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.28 
 
 		 786 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000565535 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4794  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.28 
 
 		 786 aa  62  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.167233  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  25.5 
 
 		 863 aa  62.4  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1412  MutS2 family protein  25.95 
 
 		 783 aa  62  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29197e-17 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  28.36 
 
 		 853 aa  62  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  29.17 
 
 		 898 aa  62  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3240  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  26.56 
 
 		 786 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1152  MutS2 family protein  27.42 
 
 		 757 aa  62.4  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1619  DNA mismatch repair protein MutS  24.55 
 
 		 897 aa  62  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.510747 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53969  predicted protein  26.99 
 
 		 1423 aa  61.6  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  26.03 
 
 		 930 aa  61.6  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  26.7 
 
 		 871 aa  61.6  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0576  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.28 
 
 		 786 aa  62  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4649  DNA mismatch repair protein MutS  25.46 
 
 		 916 aa  62  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.427089 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  25.69 
 
 		 870 aa  62  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  29.35 
 
 		 886 aa  61.6  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49314  predicted protein  27.62 
 
 		 916 aa  62  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0725595  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47730  predicted protein  25.71 
 
 		 1085 aa  61.6  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4799  DNA mismatch repair protein MutS  25.46 
 
 		 896 aa  61.6  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.720607 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4282  DNA mismatch repair protein MutS  25.46 
 
 		 916 aa  61.6  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  27.65 
 
 		 860 aa  60.8  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1897  MutS2 family protein  25.89 
 
 		 767 aa  60.8  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.557227  normal  0.0324553 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3196  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  26.98 
 
 		 633 aa  60.8  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.73 
 
 		 786 aa  60.8  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000221381  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2159  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  27.43 
 
 		 522 aa  60.8  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>