More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0342 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0342  MutS family DNA mismatch repair protein  100 
 
 		 536 aa  1085    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1585  DNA mismatch repair protein MutS-like  54.27 
 
 		 547 aa  595  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2282  DNA mismatch repair protein MutS-like  48.31 
 
 		 547 aa  488  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  35.25 
 
 		 750 aa  130  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  31.03 
 
 		 878 aa  123  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  36.14 
 
 		 868 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  31.66 
 
 		 872 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  31.64 
 
 		 823 aa  119  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  29.77 
 
 		 889 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  33.65 
 
 		 893 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  31.66 
 
 		 872 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  29.76 
 
 		 868 aa  116  8.999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  32.35 
 
 		 863 aa  116  8.999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  30.71 
 
 		 880 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18351  DNA mismatch repair protein MutS  28.35 
 
 		 913 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03749  DNA mismatch repair protein msh3 (MutS protein homolog 3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B6T1]  37.57 
 
 		 1091 aa  114  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.642565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18541  DNA mismatch repair protein MutS  28.35 
 
 		 913 aa  114  5e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1737  DNA mismatch repair protein MutS  27.88 
 
 		 913 aa  113  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0169322  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  32.54 
 
 		 881 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  31.64 
 
 		 883 aa  113  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  35 
 
 		 882 aa  113  8.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  30.15 
 
 		 871 aa  113  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0538  MutS2 family protein  34.23 
 
 		 791 aa  113  9e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00387352  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  30.12 
 
 		 870 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0458  DNA mismatch repair protein MutS  33.18 
 
 		 865 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143165  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  31.82 
 
 		 872 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  33.82 
 
 		 917 aa  111  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  33.17 
 
 		 860 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  28.74 
 
 		 871 aa  110  5e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  29.66 
 
 		 872 aa  110  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2791  DNA mismatch repair protein MutS  34.65 
 
 		 864 aa  110  5e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  30.68 
 
 		 898 aa  110  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  37.3 
 
 		 761 aa  109  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  30.48 
 
 		 870 aa  109  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  36.99 
 
 		 874 aa  109  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  29.64 
 
 		 868 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  29.81 
 
 		 853 aa  108  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  34.72 
 
 		 856 aa  107  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  30.43 
 
 		 873 aa  107  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  29.45 
 
 		 956 aa  107  6e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  34.01 
 
 		 881 aa  107  7e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  34.67 
 
 		 840 aa  107  7e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  30.95 
 
 		 793 aa  106  8e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3531  DNA mismatch repair protein MutS  35.8 
 
 		 1088 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81012  Mismatch repair ATPase MSH6 (MutS family)  34.12 
 
 		 1212 aa  106  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0833152 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  38.46 
 
 		 897 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0824  DNA mismatch repair protein MutS  28.85 
 
 		 804 aa  106  1e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0035  DNA mismatch repair protein MutS  38.32 
 
 		 921 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3706  DNA mismatch repair protein MutS  33.17 
 
 		 1085 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0191943 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  29.41 
 
 		 872 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2761  DNA mismatch repair protein MutS  31.56 
 
 		 904 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  28.03 
 
 		 793 aa  105  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  32.51 
 
 		 886 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01708  protein required for mismatch repair in mitosis and meiosis (Eurofung)  28.86 
 
 		 1186 aa  105  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  33.33 
 
 		 872 aa  105  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0358  DNA mismatch repair protein MutS  32.65 
 
 		 918 aa  105  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.613152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  32.67 
 
 		 890 aa  105  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0214  DNA mismatch repair protein MutS  30.16 
 
 		 851 aa  105  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.250019 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3021  DNA mismatch repair protein MutS  33.33 
 
 		 897 aa  105  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01479  DNA-binding protein of the mitochondria (Eurofung)  29.77 
 
 		 924 aa  104  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  32.67 
 
 		 892 aa  104  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  32.64 
 
 		 863 aa  104  4e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  32.67 
 
 		 894 aa  104  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  34.17 
 
 		 863 aa  104  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  32.67 
 
 		 892 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  32.67 
 
 		 890 aa  104  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  32.67 
 
 		 892 aa  104  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  32.67 
 
 		 890 aa  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  33.8 
 
 		 865 aa  103  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  32.67 
 
 		 892 aa  104  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  32.67 
 
 		 892 aa  104  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2632  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.03 
 
 		 784 aa  104  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  32.67 
 
 		 892 aa  104  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  33.17 
 
 		 895 aa  104  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0078  DNA mismatch repair protein MutS  33.53 
 
 		 903 aa  103  6e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.167909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  33.95 
 
 		 882 aa  103  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  33.33 
 
 		 887 aa  103  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0008  DNA mismatch repair protein MutS  30.67 
 
 		 904 aa  103  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  31.47 
 
 		 903 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00881  DNA mismatch repair protein MutS  33.33 
 
 		 927 aa  103  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0543692 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  28.96 
 
 		 869 aa  103  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  31.19 
 
 		 891 aa  103  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1250  DNA mismatch repair protein MutS  27.41 
 
 		 823 aa  102  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.297858  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  30.2 
 
 		 873 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  30.85 
 
 		 875 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  30.24 
 
 		 867 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  33.33 
 
 		 857 aa  103  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2125  MutS2 family protein  32.73 
 
 		 776 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3751  DNA mismatch repair protein MutS  32.02 
 
 		 855 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  27.34 
 
 		 864 aa  102  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  34.12 
 
 		 864 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  26.89 
 
 		 900 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1486  DNA mismatch repair protein MutS  33.17 
 
 		 867 aa  102  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3541  DNA mismatch repair protein MutS  38.31 
 
 		 929 aa  102  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  29.02 
 
 		 855 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  29.96 
 
 		 891 aa  102  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  34.29 
 
 		 850 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0335  DNA mismatch repair protein MutS  34.59 
 
 		 815 aa  101  3e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.213975  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4649  DNA mismatch repair protein MutS  33.49 
 
 		 916 aa  101  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.427089 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1760  DNA mismatch repair protein MutS  33.5 
 
 		 870 aa  101  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>